MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Buchnera aphidicola str. Sg (Schizaphis graminum) chromosome

Total Repeats: 21401

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_004061	TAAA	2	8	31469	31476	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_004061	AT	3	6	31480	31485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_004061	TTA	2	6	31492	31497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_004061	TAT	2	6	31509	31514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_004061	A	7	7	31588	31594	100 %	0 %	0 %	0 %	21672324
1006	NC_004061	TCT	2	6	31621	31626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672324
1007	NC_004061	T	6	6	31636	31641	0 %	100 %	0 %	0 %	21672324
1008	NC_004061	AAG	2	6	31660	31665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672324
1009	NC_004061	AG	3	6	31664	31669	50 %	0 %	50 %	0 %	21672324
1010	NC_004061	A	6	6	31676	31681	100 %	0 %	0 %	0 %	21672324
1011	NC_004061	ATG	2	6	31754	31759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672324
1012	NC_004061	ATA	2	6	31797	31802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672324
1013	NC_004061	GATT	2	8	31804	31811	25 %	50 %	25 %	0 %	21672324
1014	NC_004061	GTT	2	6	31839	31844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672324
1015	NC_004061	TGC	2	6	31855	31860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672324
1016	NC_004061	TA	3	6	31898	31903	50 %	50 %	0 %	0 %	21672324
1017	NC_004061	AGA	2	6	31957	31962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672324
1018	NC_004061	TGA	2	6	31966	31971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672324
1019	NC_004061	ATT	3	9	31975	31983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672324
1020	NC_004061	TCT	2	6	32071	32076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672324
1021	NC_004061	AT	3	6	32082	32087	50 %	50 %	0 %	0 %	21672324
1022	NC_004061	AT	3	6	32093	32098	50 %	50 %	0 %	0 %	21672324
1023	NC_004061	TGA	2	6	32149	32154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672324
1024	NC_004061	A	6	6	32189	32194	100 %	0 %	0 %	0 %	21672324
1025	NC_004061	AAC	2	6	32227	32232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21672324
1026	NC_004061	ATT	2	6	32239	32244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672324
1027	NC_004061	AAC	2	6	32245	32250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21672324
1028	NC_004061	AACAT	2	10	32268	32277	60 %	20 %	0 %	20 %	21672324
1029	NC_004061	AT	3	6	32281	32286	50 %	50 %	0 %	0 %	21672324
1030	NC_004061	ATT	2	6	32434	32439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672324
1031	NC_004061	CTA	2	6	32451	32456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672324
1032	NC_004061	A	6	6	32471	32476	100 %	0 %	0 %	0 %	21672324
1033	NC_004061	TTA	2	6	32477	32482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672324
1034	NC_004061	A	7	7	32532	32538	100 %	0 %	0 %	0 %	21672324
1035	NC_004061	A	6	6	32555	32560	100 %	0 %	0 %	0 %	21672324
1036	NC_004061	TAAA	2	8	32616	32623	75 %	25 %	0 %	0 %	21672324
1037	NC_004061	ATTCA	2	10	32634	32643	40 %	40 %	0 %	20 %	21672324
1038	NC_004061	A	6	6	32691	32696	100 %	0 %	0 %	0 %	21672324
1039	NC_004061	ATTTA	2	10	32788	32797	40 %	60 %	0 %	0 %	21672324
1040	NC_004061	CAA	2	6	32808	32813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21672324
1041	NC_004061	ACG	2	6	32857	32862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672324
1042	NC_004061	ATG	2	6	32886	32891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672324
1043	NC_004061	A	6	6	32912	32917	100 %	0 %	0 %	0 %	21672324
1044	NC_004061	TAA	2	6	32931	32936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672324
1045	NC_004061	GAAA	2	8	32984	32991	75 %	0 %	25 %	0 %	21672324
1046	NC_004061	ACC	2	6	33082	33087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21672324
1047	NC_004061	ATT	3	9	33089	33097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672324
1048	NC_004061	TATTT	2	10	33199	33208	20 %	80 %	0 %	0 %	21672324
1049	NC_004061	AGA	2	6	33223	33228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672324
1050	NC_004061	A	6	6	33240	33245	100 %	0 %	0 %	0 %	21672324
1051	NC_004061	AGAAAA	2	12	33292	33303	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	21672324
1052	NC_004061	A	6	6	33300	33305	100 %	0 %	0 %	0 %	21672324
1053	NC_004061	TGA	2	6	33322	33327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672324
1054	NC_004061	GAAT	2	8	33370	33377	50 %	25 %	25 %	0 %	21672324
1055	NC_004061	TTC	2	6	33412	33417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672324
1056	NC_004061	A	6	6	33424	33429	100 %	0 %	0 %	0 %	21672324
1057	NC_004061	TAC	2	6	33430	33435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672324
1058	NC_004061	CA	4	8	33443	33450	50 %	0 %	0 %	50 %	21672324
1059	NC_004061	TCTT	2	8	33491	33498	0 %	75 %	0 %	25 %	21672324
1060	NC_004061	TTA	2	6	33510	33515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672324
1061	NC_004061	ATTC	2	8	33605	33612	25 %	50 %	0 %	25 %	21672324
1062	NC_004061	TAAA	2	8	33651	33658	75 %	25 %	0 %	0 %	21672324
1063	NC_004061	A	6	6	33748	33753	100 %	0 %	0 %	0 %	21672324
1064	NC_004061	TGC	2	6	33763	33768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672324
1065	NC_004061	GA	3	6	33778	33783	50 %	0 %	50 %	0 %	21672324
1066	NC_004061	TAAAA	2	10	33784	33793	80 %	20 %	0 %	0 %	21672324
1067	NC_004061	A	8	8	33790	33797	100 %	0 %	0 %	0 %	21672324
1068	NC_004061	TAAA	3	12	33803	33814	75 %	25 %	0 %	0 %	21672324
1069	NC_004061	T	6	6	33818	33823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_004061	ATC	2	6	33848	33853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_004061	ATT	2	6	33860	33865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_004061	TTA	2	6	33866	33871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_004061	ATG	2	6	33887	33892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_004061	TAA	2	6	33896	33901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_004061	T	6	6	33908	33913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_004061	A	6	6	33918	33923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_004061	TTTA	2	8	33931	33938	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_004061	TAA	2	6	33954	33959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_004061	A	7	7	33963	33969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_004061	TTA	2	6	33996	34001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672325
1081	NC_004061	TAT	2	6	34040	34045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672325
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1083	NC_004061	ATA	2	6	34099	34104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672325
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1085	NC_004061	A	6	6	34153	34158	100 %	0 %	0 %	0 %	21672325
1086	NC_004061	GTA	2	6	34183	34188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672325
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1097	NC_004061	T	7	7	34474	34480	0 %	100 %	0 %	0 %	21672325
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1099	NC_004061	AAT	2	6	34560	34565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672325
1100	NC_004061	T	6	6	34581	34586	0 %	100 %	0 %	0 %	21672325
1101	NC_004061	ATT	2	6	34633	34638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672325
1102	NC_004061	AT	3	6	34796	34801	50 %	50 %	0 %	0 %	21672325
1103	NC_004061	TAT	3	9	34799	34807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672325
1104	NC_004061	AGAT	2	8	34809	34816	50 %	25 %	25 %	0 %	21672325
1105	NC_004061	TA	3	6	34875	34880	50 %	50 %	0 %	0 %	21672325
1106	NC_004061	T	7	7	34926	34932	0 %	100 %	0 %	0 %	21672325
1107	NC_004061	T	7	7	34966	34972	0 %	100 %	0 %	0 %	21672325
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1110	NC_004061	A	6	6	35002	35007	100 %	0 %	0 %	0 %	21672325
1111	NC_004061	ATT	2	6	35017	35022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672325
1112	NC_004061	TAG	2	6	35054	35059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672325
1113	NC_004061	AAATC	2	10	35062	35071	60 %	20 %	0 %	20 %	21672325
1114	NC_004061	AGTATT	2	12	35088	35099	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	21672325
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1117	NC_004061	GCA	2	6	35170	35175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672325
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1120	NC_004061	TCT	2	6	35218	35223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672325
1121	NC_004061	T	6	6	35249	35254	0 %	100 %	0 %	0 %	21672325
1122	NC_004061	T	6	6	35315	35320	0 %	100 %	0 %	0 %	21672325
1123	NC_004061	ACC	2	6	35346	35351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21672325
1124	NC_004061	TAT	2	6	35352	35357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672325
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1127	NC_004061	T	9	9	35440	35448	0 %	100 %	0 %	0 %	21672325
1128	NC_004061	TCC	2	6	35463	35468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21672325
1129	NC_004061	T	9	9	35486	35494	0 %	100 %	0 %	0 %	21672325
1130	NC_004061	ACTA	2	8	35541	35548	50 %	25 %	0 %	25 %	21672325
1131	NC_004061	ATT	2	6	35565	35570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672325
1132	NC_004061	ATTT	2	8	35581	35588	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_004061	T	6	6	35591	35596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_004061	T	6	6	35635	35640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_004061	ATTTTT	2	12	35651	35662	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_004061	T	6	6	35704	35709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_004061	T	6	6	35734	35739	0 %	100 %	0 %	0 %	21672326
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1143	NC_004061	T	6	6	35912	35917	0 %	100 %	0 %	0 %	21672326
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1149	NC_004061	TAAA	2	8	36032	36039	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1152	NC_004061	AGATA	2	10	36097	36106	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1153	NC_004061	A	8	8	36106	36113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1154	NC_004061	T	6	6	36129	36134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1156	NC_004061	A	6	6	36180	36185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1157	NC_004061	AT	3	6	36206	36211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1158	NC_004061	AT	3	6	36213	36218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1159	NC_004061	TAAA	2	8	36243	36250	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1160	NC_004061	TTA	2	6	36272	36277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1161	NC_004061	ATT	2	6	36279	36284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1163	NC_004061	ATT	2	6	36294	36299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1164	NC_004061	TTA	2	6	36303	36308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1166	NC_004061	T	9	9	36335	36343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1167	NC_004061	TTA	2	6	36350	36355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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