MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Buchnera aphidicola str. Sg (Schizaphis graminum) chromosome

Total Repeats: 21401

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004061	ATG	2	6	15743	15748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672310
502	NC_004061	TCT	2	6	15772	15777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672310
503	NC_004061	TTAA	2	8	15778	15785	50 %	50 %	0 %	0 %	21672310
504	NC_004061	TAG	2	6	15860	15865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672310
505	NC_004061	TTTA	2	8	15921	15928	25 %	75 %	0 %	0 %	21672310
506	NC_004061	ATT	2	6	15930	15935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672310
507	NC_004061	TAT	2	6	15975	15980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672310
508	NC_004061	ATG	2	6	15994	15999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672310
509	NC_004061	AAT	2	6	16125	16130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672310
510	NC_004061	TA	3	6	16136	16141	50 %	50 %	0 %	0 %	21672310
511	NC_004061	AGAA	2	8	16142	16149	75 %	0 %	25 %	0 %	21672310
512	NC_004061	A	6	6	16148	16153	100 %	0 %	0 %	0 %	21672310
513	NC_004061	GTT	2	6	16169	16174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672310
514	NC_004061	T	7	7	16199	16205	0 %	100 %	0 %	0 %	21672310
515	NC_004061	TTTTG	2	10	16256	16265	0 %	80 %	20 %	0 %	21672310
516	NC_004061	T	6	6	16330	16335	0 %	100 %	0 %	0 %	21672310
517	NC_004061	TAA	2	6	16353	16358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672310
518	NC_004061	CAA	2	6	16375	16380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21672310
519	NC_004061	A	6	6	16379	16384	100 %	0 %	0 %	0 %	21672310
520	NC_004061	T	8	8	16417	16424	0 %	100 %	0 %	0 %	21672310
521	NC_004061	TAT	2	6	16476	16481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672310
522	NC_004061	ACA	2	6	16482	16487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21672310
523	NC_004061	AT	3	6	16491	16496	50 %	50 %	0 %	0 %	21672310
524	NC_004061	A	8	8	16510	16517	100 %	0 %	0 %	0 %	21672310
525	NC_004061	A	6	6	16520	16525	100 %	0 %	0 %	0 %	21672310
526	NC_004061	ATT	2	6	16533	16538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_004061	TTTA	2	8	16546	16553	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_004061	TAT	2	6	16590	16595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672311
529	NC_004061	T	6	6	16723	16728	0 %	100 %	0 %	0 %	21672311
530	NC_004061	TAT	2	6	16836	16841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672311
531	NC_004061	TAA	2	6	16850	16855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672311
532	NC_004061	GAT	2	6	16966	16971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672311
533	NC_004061	TTAA	2	8	16972	16979	50 %	50 %	0 %	0 %	21672311
534	NC_004061	A	6	6	17048	17053	100 %	0 %	0 %	0 %	21672311
535	NC_004061	TAA	2	6	17054	17059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672311
536	NC_004061	A	7	7	17058	17064	100 %	0 %	0 %	0 %	21672311
537	NC_004061	AGA	2	6	17109	17114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672311
538	NC_004061	TTGATT	2	12	17120	17131	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	21672311
539	NC_004061	TAT	2	6	17142	17147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672311
540	NC_004061	TAAAAA	2	12	17180	17191	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	21672311
541	NC_004061	ACC	2	6	17247	17252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21672311
542	NC_004061	ACA	2	6	17326	17331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21672311
543	NC_004061	AAATAT	2	12	17349	17360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672311
544	NC_004061	AAT	2	6	17379	17384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672311
545	NC_004061	AGA	2	6	17409	17414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672311
546	NC_004061	A	6	6	17423	17428	100 %	0 %	0 %	0 %	21672311
547	NC_004061	GAT	2	6	17451	17456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672311
548	NC_004061	AGA	2	6	17505	17510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672311
549	NC_004061	A	9	9	17513	17521	100 %	0 %	0 %	0 %	21672311
550	NC_004061	TCT	2	6	17548	17553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672311
551	NC_004061	AAG	2	6	17564	17569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672311
552	NC_004061	TTTTG	2	10	17574	17583	0 %	80 %	20 %	0 %	21672311
553	NC_004061	TAG	2	6	17597	17602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672311
554	NC_004061	A	7	7	17685	17691	100 %	0 %	0 %	0 %	21672311
555	NC_004061	AAG	2	6	17723	17728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672311
556	NC_004061	AGA	2	6	17743	17748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672311
557	NC_004061	TCA	2	6	17757	17762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672311
558	NC_004061	A	7	7	17798	17804	100 %	0 %	0 %	0 %	21672311
559	NC_004061	ATT	2	6	17829	17834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672311
560	NC_004061	TAAT	2	8	17852	17859	50 %	50 %	0 %	0 %	21672311
561	NC_004061	ATT	2	6	17862	17867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672311
562	NC_004061	TTA	2	6	17902	17907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672311
563	NC_004061	T	6	6	17915	17920	0 %	100 %	0 %	0 %	21672311
564	NC_004061	ACC	2	6	17975	17980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_004061	ATC	2	6	18043	18048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_004061	T	7	7	18070	18076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_004061	ATAAA	2	10	18131	18140	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_004061	A	7	7	18144	18150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_004061	T	6	6	18154	18159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_004061	AT	3	6	18195	18200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_004061	AAAG	2	8	18201	18208	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
572	NC_004061	TAAA	2	8	18212	18219	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_004061	A	7	7	18217	18223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_004061	T	8	8	18227	18234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_004061	ATT	2	6	18251	18256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_004061	GGT	2	6	18341	18346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672312
577	NC_004061	CTG	2	6	18363	18368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672312
578	NC_004061	CAG	2	6	18396	18401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672312
579	NC_004061	TGT	2	6	18463	18468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672312
580	NC_004061	A	6	6	18501	18506	100 %	0 %	0 %	0 %	21672312
581	NC_004061	GAA	2	6	18515	18520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672312
582	NC_004061	TTG	2	6	18555	18560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672312
583	NC_004061	TAAAC	2	10	18566	18575	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
584	NC_004061	AT	3	6	18577	18582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_004061	AT	3	6	18600	18605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_004061	GTA	2	6	18734	18739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672313
587	NC_004061	AGA	2	6	18808	18813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672313
588	NC_004061	AAG	2	6	18846	18851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672313
589	NC_004061	ATG	2	6	18867	18872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672313
590	NC_004061	CAG	2	6	18873	18878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672313
591	NC_004061	ACA	3	9	18887	18895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21672313
592	NC_004061	ATT	2	6	18901	18906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672313
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594	NC_004061	AGC	2	6	18943	18948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672313
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596	NC_004061	A	6	6	19015	19020	100 %	0 %	0 %	0 %	21672313
597	NC_004061	ACG	2	6	19134	19139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21672313
598	NC_004061	TTA	2	6	19143	19148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672313
599	NC_004061	AGA	2	6	19153	19158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672313
600	NC_004061	TATC	2	8	19217	19224	25 %	50 %	0 %	25 %	21672313
601	NC_004061	TTATT	2	10	19228	19237	20 %	80 %	0 %	0 %	21672313
602	NC_004061	TTG	2	6	19257	19262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672313
603	NC_004061	A	7	7	19295	19301	100 %	0 %	0 %	0 %	21672313
604	NC_004061	ATT	2	6	19360	19365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672313
605	NC_004061	AAT	2	6	19366	19371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672313
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610	NC_004061	AGA	2	6	19564	19569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672313
611	NC_004061	TAC	2	6	19606	19611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672313
612	NC_004061	TAT	2	6	19615	19620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21672313
613	NC_004061	GGT	2	6	19622	19627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672313
614	NC_004061	AAG	2	6	19683	19688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672313
615	NC_004061	AGA	2	6	19794	19799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672313
616	NC_004061	AGA	2	6	19810	19815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672313
617	NC_004061	TGC	2	6	19834	19839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672313
618	NC_004061	AGA	2	6	19843	19848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672313
619	NC_004061	GTT	2	6	19853	19858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21672313
620	NC_004061	ATCTA	2	10	19900	19909	40 %	40 %	0 %	20 %	21672313
621	NC_004061	GAA	2	6	20000	20005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672313
622	NC_004061	TAA	2	6	20020	20025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21672313
623	NC_004061	GCT	2	6	20060	20065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672313
624	NC_004061	TGAT	2	8	20085	20092	25 %	50 %	25 %	0 %	21672313
625	NC_004061	CTA	2	6	20109	20114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21672313
626	NC_004061	ACA	2	6	20168	20173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21672313
627	NC_004061	AGA	2	6	20200	20205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21672313
628	NC_004061	TCT	2	6	20210	20215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21672313
629	NC_004061	CTG	2	6	20232	20237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21672313
630	NC_004061	GGT	2	6	20246	20251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21672313
631	NC_004061	ATG	2	6	20261	20266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21672313
632	NC_004061	T	6	6	20287	20292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_004061	AATT	2	8	20294	20301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_004061	AT	3	6	20321	20326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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