MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bacillus anthracis str. A2012 plasmid pXO2

Total Repeats: 301

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003981	CTTC	2	8	86	93	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_003981	TAAC	2	8	214	221	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_003981	CTTT	2	8	308	315	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_003981	ATGT	2	8	404	411	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003981	TTTG	2	8	471	478	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003981	TTAA	2	8	895	902	50 %	50 %	0 %	0 %	21392894
7	NC_003981	TCTA	2	8	1229	1236	25 %	50 %	0 %	25 %	21392895
8	NC_003981	TTTC	2	8	1393	1400	0 %	75 %	0 %	25 %	21392895
9	NC_003981	AACT	2	8	1468	1475	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_003981	TTAA	2	8	1532	1539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003981	TTTC	2	8	1787	1794	0 %	75 %	0 %	25 %	21392897
12	NC_003981	ATTG	2	8	1860	1867	25 %	50 %	25 %	0 %	21392897
13	NC_003981	TAAA	2	8	2522	2529	75 %	25 %	0 %	0 %	21392897
14	NC_003981	TTTC	2	8	2668	2675	0 %	75 %	0 %	25 %	21392898
15	NC_003981	TCCT	2	8	2875	2882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_003981	ATTT	2	8	2888	2895	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003981	TCTT	2	8	3463	3470	0 %	75 %	0 %	25 %	21392899
18	NC_003981	ATTT	2	8	3562	3569	25 %	75 %	0 %	0 %	21392899
19	NC_003981	TGAC	2	8	3713	3720	25 %	25 %	25 %	25 %	21392900
20	NC_003981	CATC	2	8	3942	3949	25 %	25 %	0 %	50 %	21392900
21	NC_003981	AAAT	2	8	5962	5969	75 %	25 %	0 %	0 %	21392901
22	NC_003981	TTTC	2	8	6187	6194	0 %	75 %	0 %	25 %	21392901
23	NC_003981	CCAC	2	8	6866	6873	25 %	0 %	0 %	75 %	21392902
24	NC_003981	AAGT	2	8	7119	7126	50 %	25 %	25 %	0 %	21392902
25	NC_003981	TAAT	2	8	7730	7737	50 %	50 %	0 %	0 %	21392903
26	NC_003981	ATTG	2	8	8831	8838	25 %	50 %	25 %	0 %	21392906
27	NC_003981	ATTT	2	8	8953	8960	25 %	75 %	0 %	0 %	21392906
28	NC_003981	GTTT	2	8	9043	9050	0 %	75 %	25 %	0 %	21392906
29	NC_003981	GTTT	2	8	9133	9140	0 %	75 %	25 %	0 %	21392906
30	NC_003981	AGAT	2	8	9811	9818	50 %	25 %	25 %	0 %	21392906
31	NC_003981	ATTA	2	8	9827	9834	50 %	50 %	0 %	0 %	21392906
32	NC_003981	AAAC	2	8	9846	9853	75 %	0 %	0 %	25 %	21392906
33	NC_003981	TAAA	2	8	10087	10094	75 %	25 %	0 %	0 %	21392906
34	NC_003981	ATTT	2	8	10202	10209	25 %	75 %	0 %	0 %	21392906
35	NC_003981	TCGT	2	8	10233	10240	0 %	50 %	25 %	25 %	21392906
36	NC_003981	CTGT	2	8	10377	10384	0 %	50 %	25 %	25 %	21392906
37	NC_003981	TAAA	2	8	10445	10452	75 %	25 %	0 %	0 %	21392906
38	NC_003981	CCCT	2	8	10826	10833	0 %	25 %	0 %	75 %	21392906
39	NC_003981	ATTG	2	8	10836	10843	25 %	50 %	25 %	0 %	21392906
40	NC_003981	CATT	2	8	10878	10885	25 %	50 %	0 %	25 %	21392906
41	NC_003981	CTTT	3	12	11562	11573	0 %	75 %	0 %	25 %	21392907
42	NC_003981	CTTT	2	8	12208	12215	0 %	75 %	0 %	25 %	21392908
43	NC_003981	TTTA	2	8	12449	12456	25 %	75 %	0 %	0 %	21392908
44	NC_003981	TTGA	2	8	13099	13106	25 %	50 %	25 %	0 %	21392908
45	NC_003981	ATCA	2	8	13127	13134	50 %	25 %	0 %	25 %	21392908
46	NC_003981	GTCT	2	8	13265	13272	0 %	50 %	25 %	25 %	21392908
47	NC_003981	ATTC	2	8	13537	13544	25 %	50 %	0 %	25 %	21392908
48	NC_003981	CTTT	2	8	13977	13984	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_003981	TCTT	2	8	13986	13993	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_003981	TCTT	2	8	14325	14332	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_003981	TGAT	2	8	14384	14391	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003981	AATT	2	8	14462	14469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003981	CTCA	2	8	14750	14757	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_003981	TTTC	2	8	16849	16856	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_003981	CCCT	2	8	16857	16864	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
56	NC_003981	ATTA	2	8	17048	17055	50 %	50 %	0 %	0 %	21392913
57	NC_003981	GCGA	2	8	18081	18088	25 %	0 %	50 %	25 %	21392914
58	NC_003981	TTTC	2	8	18167	18174	0 %	75 %	0 %	25 %	21392914
59	NC_003981	AATC	2	8	19407	19414	50 %	25 %	0 %	25 %	21392915
60	NC_003981	TAAT	2	8	19535	19542	50 %	50 %	0 %	0 %	21392915
61	NC_003981	CTTT	2	8	19824	19831	0 %	75 %	0 %	25 %	21392916
62	NC_003981	TACT	2	8	19845	19852	25 %	50 %	0 %	25 %	21392916
63	NC_003981	CTCG	2	8	20081	20088	0 %	25 %	25 %	50 %	21392916
64	NC_003981	CAAA	2	8	20231	20238	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_003981	TAAA	2	8	21215	21222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003981	AATC	2	8	21362	21369	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_003981	TTTA	2	8	21672	21679	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003981	CTTG	2	8	21840	21847	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_003981	ACCA	2	8	22169	22176	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_003981	TCAC	2	8	22437	22444	25 %	25 %	0 %	50 %	21392920
71	NC_003981	ACCA	2	8	22445	22452	50 %	0 %	0 %	50 %	21392920
72	NC_003981	ATTT	2	8	22598	22605	25 %	75 %	0 %	0 %	21392920
73	NC_003981	GTAA	2	8	22778	22785	50 %	25 %	25 %	0 %	21392920
74	NC_003981	CAAG	2	8	23335	23342	50 %	0 %	25 %	25 %	21392920
75	NC_003981	GAAT	2	8	23405	23412	50 %	25 %	25 %	0 %	21392920
76	NC_003981	GCAT	2	8	23475	23482	25 %	25 %	25 %	25 %	21392920
77	NC_003981	TTTC	2	8	23616	23623	0 %	75 %	0 %	25 %	21392920
78	NC_003981	GTTT	2	8	24685	24692	0 %	75 %	25 %	0 %	21392920
79	NC_003981	AAGT	2	8	24911	24918	50 %	25 %	25 %	0 %	21392920
80	NC_003981	TTTG	2	8	25264	25271	0 %	75 %	25 %	0 %	21392921
81	NC_003981	TTCC	2	8	25440	25447	0 %	50 %	0 %	50 %	21392921
82	NC_003981	ACCT	2	8	25664	25671	25 %	25 %	0 %	50 %	21392922
83	NC_003981	GTTT	2	8	25926	25933	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003981	AAAC	2	8	26017	26024	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_003981	GAAA	2	8	26098	26105	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003981	ATTT	2	8	26481	26488	25 %	75 %	0 %	0 %	21392923
87	NC_003981	CATT	2	8	26590	26597	25 %	50 %	0 %	25 %	21392923
88	NC_003981	ATGA	2	8	26910	26917	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003981	CATT	2	8	26918	26925	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_003981	ATCT	2	8	26940	26947	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_003981	AAAT	2	8	26979	26986	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003981	ACTA	2	8	27187	27194	50 %	25 %	0 %	25 %	21392924
93	NC_003981	AGAA	2	8	27280	27287	75 %	0 %	25 %	0 %	21392924
94	NC_003981	TCGG	2	8	27637	27644	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_003981	TGAT	2	8	29312	29319	25 %	50 %	25 %	0 %	21392926
96	NC_003981	TTAT	2	8	29782	29789	25 %	75 %	0 %	0 %	21392927
97	NC_003981	CTTG	2	8	30338	30345	0 %	50 %	25 %	25 %	21392928
98	NC_003981	TAGT	2	8	30559	30566	25 %	50 %	25 %	0 %	21392928
99	NC_003981	CATT	2	8	30645	30652	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_003981	TCTT	2	8	31633	31640	0 %	75 %	0 %	25 %	21392930
101	NC_003981	AAAG	2	8	32733	32740	75 %	0 %	25 %	0 %	21392931
102	NC_003981	TGTT	2	8	32771	32778	0 %	75 %	25 %	0 %	21392931
103	NC_003981	CTGT	2	8	33964	33971	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_003981	AAAT	2	8	34153	34160	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_003981	ACTT	2	8	34931	34938	25 %	50 %	0 %	25 %	21392932
106	NC_003981	ATTT	2	8	35228	35235	25 %	75 %	0 %	0 %	21392932
107	NC_003981	AAAG	2	8	35452	35459	75 %	0 %	25 %	0 %	21392933
108	NC_003981	TACA	2	8	36039	36046	50 %	25 %	0 %	25 %	21392997
109	NC_003981	AAGA	2	8	36417	36424	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003981	AGTA	2	8	36457	36464	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003981	AGAA	2	8	36707	36714	75 %	0 %	25 %	0 %	21392935
112	NC_003981	CTTC	2	8	37269	37276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_003981	AACA	2	8	37666	37673	75 %	0 %	0 %	25 %	21392936
114	NC_003981	ATGA	2	8	38473	38480	50 %	25 %	25 %	0 %	21392936
115	NC_003981	TTTG	2	8	39435	39442	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_003981	CTTT	2	8	39897	39904	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_003981	ATAA	2	8	40413	40420	75 %	25 %	0 %	0 %	21392938
118	NC_003981	AGTA	2	8	41858	41865	50 %	25 %	25 %	0 %	21392943
119	NC_003981	ATAG	2	8	41882	41889	50 %	25 %	25 %	0 %	21392943
120	NC_003981	TAAA	2	8	42151	42158	75 %	25 %	0 %	0 %	21392943
121	NC_003981	TACT	2	8	42172	42179	25 %	50 %	0 %	25 %	21392943
122	NC_003981	GTTA	2	8	42314	42321	25 %	50 %	25 %	0 %	21392943
123	NC_003981	ACAA	2	8	42644	42651	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_003981	TAGT	2	8	43145	43152	25 %	50 %	25 %	0 %	21392944
125	NC_003981	AAAG	2	8	43230	43237	75 %	0 %	25 %	0 %	21392944
126	NC_003981	AATT	2	8	43583	43590	50 %	50 %	0 %	0 %	21392944
127	NC_003981	AAAT	2	8	43659	43666	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003981	TATT	2	8	44027	44034	25 %	75 %	0 %	0 %	21392945
129	NC_003981	AGGA	2	8	44394	44401	50 %	0 %	50 %	0 %	21392945
130	NC_003981	TCGC	2	8	44441	44448	0 %	25 %	25 %	50 %	21392945
131	NC_003981	GGAG	2	8	44470	44477	25 %	0 %	75 %	0 %	21392945
132	NC_003981	TTCA	2	8	44588	44595	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_003981	AATA	2	8	44616	44623	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_003981	CAAA	2	8	45311	45318	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_003981	ATCA	2	8	45331	45338	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_003981	AGGC	2	8	45454	45461	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_003981	ATGA	2	8	47061	47068	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_003981	ATTA	2	8	47216	47223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_003981	TATT	2	8	47402	47409	25 %	75 %	0 %	0 %	21392946
140	NC_003981	TACT	2	8	47491	47498	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_003981	TCCT	2	8	47917	47924	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_003981	AATA	2	8	48052	48059	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_003981	TTCA	2	8	48483	48490	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_003981	CTAA	2	8	48560	48567	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_003981	CCCA	2	8	48624	48631	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
146	NC_003981	TAAA	2	8	48864	48871	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_003981	GTTT	2	8	49355	49362	0 %	75 %	25 %	0 %	21392948
148	NC_003981	ACAT	2	8	49377	49384	50 %	25 %	0 %	25 %	21392948
149	NC_003981	TAAC	2	8	49500	49507	50 %	25 %	0 %	25 %	21392948
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301	NC_003981	AATG	2	8	94588	94595	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.