MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 17770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002929	GT	3	6	638	643	0 %	50 %	50 %	0 %	33591276
2	NC_002929	CG	3	6	1259	1264	0 %	0 %	50 %	50 %	33591276
3	NC_002929	CG	3	6	1463	1468	0 %	0 %	50 %	50 %	33591276
4	NC_002929	CG	3	6	1680	1685	0 %	0 %	50 %	50 %	33591276
5	NC_002929	CG	4	8	1827	1834	0 %	0 %	50 %	50 %	33591276
6	NC_002929	GC	4	8	2167	2174	0 %	0 %	50 %	50 %	33591277
7	NC_002929	GC	3	6	2234	2239	0 %	0 %	50 %	50 %	33591277
8	NC_002929	GC	3	6	2305	2310	0 %	0 %	50 %	50 %	33591277
9	NC_002929	CG	3	6	2847	2852	0 %	0 %	50 %	50 %	33591278
10	NC_002929	CG	3	6	3329	3334	0 %	0 %	50 %	50 %	33591278
11	NC_002929	CG	3	6	3336	3341	0 %	0 %	50 %	50 %	33591278
12	NC_002929	GC	3	6	3342	3347	0 %	0 %	50 %	50 %	33591278
13	NC_002929	GC	3	6	3470	3475	0 %	0 %	50 %	50 %	33591279
14	NC_002929	GC	3	6	3569	3574	0 %	0 %	50 %	50 %	33591279
15	NC_002929	GC	4	8	4044	4051	0 %	0 %	50 %	50 %	33591279
16	NC_002929	GC	3	6	4355	4360	0 %	0 %	50 %	50 %	33591280
17	NC_002929	GC	3	6	4396	4401	0 %	0 %	50 %	50 %	33591280
18	NC_002929	CG	3	6	4518	4523	0 %	0 %	50 %	50 %	33591280
19	NC_002929	CG	3	6	4907	4912	0 %	0 %	50 %	50 %	33591280
20	NC_002929	CG	3	6	4963	4968	0 %	0 %	50 %	50 %	33591280
21	NC_002929	CG	3	6	5011	5016	0 %	0 %	50 %	50 %	33591280
22	NC_002929	GC	3	6	5183	5188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_002929	GC	3	6	5275	5280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_002929	GC	3	6	5352	5357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_002929	GC	3	6	5927	5932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_002929	CG	3	6	6093	6098	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_002929	GC	3	6	6376	6381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_002929	CG	3	6	7068	7073	0 %	0 %	50 %	50 %	33591281
29	NC_002929	GC	3	6	7339	7344	0 %	0 %	50 %	50 %	33591281
30	NC_002929	GC	3	6	8621	8626	0 %	0 %	50 %	50 %	33591283
31	NC_002929	GT	3	6	9004	9009	0 %	50 %	50 %	0 %	33591283
32	NC_002929	CG	3	6	9027	9032	0 %	0 %	50 %	50 %	33591283
33	NC_002929	CG	3	6	9442	9447	0 %	0 %	50 %	50 %	33591284
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41	NC_002929	CG	3	6	12869	12874	0 %	0 %	50 %	50 %	33591288
42	NC_002929	GC	3	6	13095	13100	0 %	0 %	50 %	50 %	33591288
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49	NC_002929	GC	3	6	15188	15193	0 %	0 %	50 %	50 %	33591288
50	NC_002929	GC	3	6	15340	15345	0 %	0 %	50 %	50 %	33591288
51	NC_002929	CG	3	6	15477	15482	0 %	0 %	50 %	50 %	33591288
52	NC_002929	GC	3	6	17375	17380	0 %	0 %	50 %	50 %	33591289
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54	NC_002929	GC	4	8	18106	18113	0 %	0 %	50 %	50 %	33591289
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61	NC_002929	CG	3	6	21103	21108	0 %	0 %	50 %	50 %	33591291
62	NC_002929	GC	3	6	21257	21262	0 %	0 %	50 %	50 %	33591291
63	NC_002929	CG	3	6	22181	22186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_002929	CG	5	10	22418	22427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_002929	CG	3	6	22507	22512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_002929	CG	3	6	22651	22656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_002929	GC	3	6	22776	22781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_002929	GC	3	6	22913	22918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_002929	CG	3	6	23016	23021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_002929	CG	3	6	23091	23096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_002929	GC	3	6	23488	23493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_002929	CG	4	8	23926	23933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_002929	GC	3	6	24295	24300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_002929	GC	3	6	24517	24522	0 %	0 %	50 %	50 %	33591292
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82	NC_002929	CG	3	6	25677	25682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_002929	CG	3	6	25865	25870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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90	NC_002929	CG	3	6	28869	28874	0 %	0 %	50 %	50 %	33591295
91	NC_002929	AC	3	6	28991	28996	50 %	0 %	0 %	50 %	33591295
92	NC_002929	GC	3	6	29231	29236	0 %	0 %	50 %	50 %	33591296
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97	NC_002929	AT	3	6	30152	30157	50 %	50 %	0 %	0 %	33591296
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100	NC_002929	CG	3	6	31153	31158	0 %	0 %	50 %	50 %	33591298
101	NC_002929	TA	3	6	31628	31633	50 %	50 %	0 %	0 %	33591298
102	NC_002929	GC	3	6	31673	31678	0 %	0 %	50 %	50 %	33591298
103	NC_002929	GC	3	6	31731	31736	0 %	0 %	50 %	50 %	33591298
104	NC_002929	GC	3	6	32128	32133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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106	NC_002929	CG	3	6	32768	32773	0 %	0 %	50 %	50 %	33591299
107	NC_002929	CG	3	6	32839	32844	0 %	0 %	50 %	50 %	33591299
108	NC_002929	GC	4	8	32970	32977	0 %	0 %	50 %	50 %	33591299
109	NC_002929	GC	3	6	32992	32997	0 %	0 %	50 %	50 %	33591299
110	NC_002929	GA	3	6	33039	33044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002929	CG	3	6	33767	33772	0 %	0 %	50 %	50 %	33591300
112	NC_002929	GC	3	6	34174	34179	0 %	0 %	50 %	50 %	33591300
113	NC_002929	GC	5	10	34378	34387	0 %	0 %	50 %	50 %	33591300
114	NC_002929	TG	3	6	34704	34709	0 %	50 %	50 %	0 %	33591301
115	NC_002929	GC	3	6	34893	34898	0 %	0 %	50 %	50 %	33591301
116	NC_002929	GC	3	6	35513	35518	0 %	0 %	50 %	50 %	33591301
117	NC_002929	CG	3	6	35590	35595	0 %	0 %	50 %	50 %	33591302
118	NC_002929	CG	3	6	36071	36076	0 %	0 %	50 %	50 %	33591302
119	NC_002929	GC	5	10	36130	36139	0 %	0 %	50 %	50 %	33591302
120	NC_002929	GC	6	12	36354	36365	0 %	0 %	50 %	50 %	33591302
121	NC_002929	GC	3	6	36977	36982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_002929	GC	3	6	37135	37140	0 %	0 %	50 %	50 %	33591303
123	NC_002929	GC	3	6	37159	37164	0 %	0 %	50 %	50 %	33591303
124	NC_002929	GC	3	6	37772	37777	0 %	0 %	50 %	50 %	33591303
125	NC_002929	GC	3	6	37798	37803	0 %	0 %	50 %	50 %	33591303
126	NC_002929	CG	3	6	37833	37838	0 %	0 %	50 %	50 %	33591303
127	NC_002929	GC	3	6	38024	38029	0 %	0 %	50 %	50 %	33591304
128	NC_002929	GC	3	6	38037	38042	0 %	0 %	50 %	50 %	33591304
129	NC_002929	CG	3	6	38299	38304	0 %	0 %	50 %	50 %	33591304
130	NC_002929	GC	3	6	38317	38322	0 %	0 %	50 %	50 %	33591304
131	NC_002929	GC	3	6	38619	38624	0 %	0 %	50 %	50 %	33591304
132	NC_002929	CG	4	8	38999	39006	0 %	0 %	50 %	50 %	33591304
133	NC_002929	GC	3	6	39074	39079	0 %	0 %	50 %	50 %	33591304
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135	NC_002929	GC	3	6	39572	39577	0 %	0 %	50 %	50 %	33591304
136	NC_002929	CG	3	6	39687	39692	0 %	0 %	50 %	50 %	33591304
137	NC_002929	GC	3	6	39921	39926	0 %	0 %	50 %	50 %	33591304
138	NC_002929	GC	3	6	39983	39988	0 %	0 %	50 %	50 %	33591304
139	NC_002929	CG	3	6	40168	40173	0 %	0 %	50 %	50 %	33591305
140	NC_002929	GC	3	6	40226	40231	0 %	0 %	50 %	50 %	33591305
141	NC_002929	CG	3	6	40280	40285	0 %	0 %	50 %	50 %	33591305
142	NC_002929	CG	3	6	40390	40395	0 %	0 %	50 %	50 %	33591305
143	NC_002929	GC	4	8	40749	40756	0 %	0 %	50 %	50 %	33591306
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145	NC_002929	CG	3	6	41061	41066	0 %	0 %	50 %	50 %	33591306
146	NC_002929	GC	4	8	41127	41134	0 %	0 %	50 %	50 %	33591306
147	NC_002929	GC	4	8	41470	41477	0 %	0 %	50 %	50 %	33591307
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