MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 3957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002929	GGCAA	2	10	1501	1510	40 %	0 %	40 %	20 %	33591276
2	NC_002929	CTGGC	2	10	2703	2712	0 %	20 %	40 %	40 %	33591278
3	NC_002929	GGGAG	2	10	3457	3466	20 %	0 %	80 %	0 %	33591279
4	NC_002929	TTCGC	2	10	5656	5665	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_002929	GGCCG	2	10	5674	5683	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6	NC_002929	GCTGG	2	10	8516	8525	0 %	20 %	60 %	20 %	33591282
7	NC_002929	TCGCC	2	10	9915	9924	0 %	20 %	20 %	60 %	33591285
8	NC_002929	TACCG	2	10	10058	10067	20 %	20 %	20 %	40 %	33591285
9	NC_002929	GACCA	2	10	13225	13234	40 %	0 %	20 %	40 %	33591288
10	NC_002929	TGCCT	2	10	13748	13757	0 %	40 %	20 %	40 %	33591288
11	NC_002929	CTGGG	2	10	15067	15076	0 %	20 %	60 %	20 %	33591288
12	NC_002929	TCGCC	2	10	15844	15853	0 %	20 %	20 %	60 %	33591289
13	NC_002929	AAGGC	2	10	17101	17110	40 %	0 %	40 %	20 %	33591289
14	NC_002929	CGGCC	2	10	19406	19415	0 %	0 %	40 %	60 %	33591289
15	NC_002929	CTGGC	2	10	19852	19861	0 %	20 %	40 %	40 %	33591289
16	NC_002929	GCGCC	2	10	20818	20827	0 %	0 %	40 %	60 %	33591291
17	NC_002929	CGGCC	2	10	22091	22100	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18	NC_002929	GGCGC	2	10	22947	22956	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19	NC_002929	GCGTC	2	10	23034	23043	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_002929	GCAGC	2	10	23430	23439	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_002929	GGGCT	2	10	25385	25394	0 %	20 %	60 %	20 %	33591292
22	NC_002929	GGCGC	2	10	26926	26935	0 %	0 %	60 %	40 %	33591293
23	NC_002929	CGTGT	2	10	28517	28526	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_002929	CAGGG	2	10	29916	29925	20 %	0 %	60 %	20 %	33591296
25	NC_002929	TGGAT	2	10	30274	30283	20 %	40 %	40 %	0 %	33591296
26	NC_002929	ACTCC	2	10	30437	30446	20 %	20 %	0 %	60 %	33591297
27	NC_002929	ACGGC	2	10	32546	32555	20 %	0 %	40 %	40 %	33591299
28	NC_002929	GCCGG	2	10	34472	34481	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
29	NC_002929	GCGCC	2	10	36289	36298	0 %	0 %	40 %	60 %	33591302
30	NC_002929	CCGCG	2	10	39131	39140	0 %	0 %	40 %	60 %	33591304
31	NC_002929	GCGCC	2	10	39410	39419	0 %	0 %	40 %	60 %	33591304
32	NC_002929	GCCGC	2	10	42829	42838	0 %	0 %	40 %	60 %	33591309
33	NC_002929	ACCGC	2	10	44796	44805	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
34	NC_002929	TCCAG	2	10	44862	44871	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_002929	CGGGC	2	10	45065	45074	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
36	NC_002929	GTTTC	2	10	45215	45224	0 %	60 %	20 %	20 %	33591311
37	NC_002929	AGGCC	2	10	47573	47582	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_002929	AGGCC	2	10	47723	47732	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_002929	TCCTG	2	10	48156	48165	0 %	40 %	20 %	40 %	33591314
40	NC_002929	GCGCA	2	10	48340	48349	20 %	0 %	40 %	40 %	33591314
41	NC_002929	GGCGC	2	10	48789	48798	0 %	0 %	60 %	40 %	33591314
42	NC_002929	GCACG	2	10	48843	48852	20 %	0 %	40 %	40 %	33591314
43	NC_002929	CGGCG	2	10	51761	51770	0 %	0 %	60 %	40 %	33591317
44	NC_002929	GGCCG	2	10	52244	52253	0 %	0 %	60 %	40 %	33591317
45	NC_002929	CCAGC	2	10	53641	53650	20 %	0 %	20 %	60 %	33591318
46	NC_002929	GTTGC	2	10	54993	55002	0 %	40 %	40 %	20 %	33591319
47	NC_002929	ACGGC	2	10	56452	56461	20 %	0 %	40 %	40 %	33591320
48	NC_002929	TGTCC	2	10	60801	60810	0 %	40 %	20 %	40 %	33591324
49	NC_002929	AGCGA	2	10	61056	61065	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_002929	GAACG	2	10	61609	61618	40 %	0 %	40 %	20 %	33591325
51	NC_002929	TTTTG	2	10	62972	62981	0 %	80 %	20 %	0 %	33591327
52	NC_002929	TTTTC	2	10	64313	64322	0 %	80 %	0 %	20 %	33591329
53	NC_002929	CCTGT	2	10	64681	64690	0 %	40 %	20 %	40 %	33591330
54	NC_002929	CATCT	2	10	65574	65583	20 %	40 %	0 %	40 %	33591331
55	NC_002929	GGCAC	2	10	66588	66597	20 %	0 %	40 %	40 %	33591331
56	NC_002929	ATGGG	2	10	67998	68007	20 %	20 %	60 %	0 %	33591332
57	NC_002929	CGATT	2	10	68204	68213	20 %	40 %	20 %	20 %	33591332
58	NC_002929	GGCGA	2	10	70376	70385	20 %	0 %	60 %	20 %	33591334
59	NC_002929	GCCGC	2	10	70521	70530	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
60	NC_002929	GGGGT	2	10	72024	72033	0 %	20 %	80 %	0 %	33591335
61	NC_002929	GCGCA	2	10	75128	75137	20 %	0 %	40 %	40 %	33591338
62	NC_002929	GGGCG	3	15	75162	75176	0 %	0 %	80 %	20 %	33591338
63	NC_002929	CAGCG	2	10	75363	75372	20 %	0 %	40 %	40 %	33591339
64	NC_002929	CGAAG	2	10	78798	78807	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_002929	CCGCA	2	10	78840	78849	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
66	NC_002929	GACGG	2	10	80945	80954	20 %	0 %	60 %	20 %	33591342
67	NC_002929	GGACG	2	10	81555	81564	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
68	NC_002929	ACAGC	2	10	82192	82201	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_002929	GCGCG	2	10	84368	84377	0 %	0 %	60 %	40 %	33591344
70	NC_002929	CGATG	2	10	85506	85515	20 %	20 %	40 %	20 %	33591346
71	NC_002929	GGGCA	2	10	86640	86649	20 %	0 %	60 %	20 %	33591346
72	NC_002929	AGGGC	2	10	87445	87454	20 %	0 %	60 %	20 %	33591347
73	NC_002929	CTTCG	2	10	89858	89867	0 %	40 %	20 %	40 %	33591349
74	NC_002929	CAGCG	2	10	91161	91170	20 %	0 %	40 %	40 %	33591351
75	NC_002929	GGCCG	2	10	92481	92490	0 %	0 %	60 %	40 %	33591352
76	NC_002929	GGCCT	2	10	93856	93865	0 %	20 %	40 %	40 %	33591353
77	NC_002929	CAGCG	2	10	96064	96073	20 %	0 %	40 %	40 %	33591356
78	NC_002929	CGGGC	2	10	99072	99081	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
79	NC_002929	GCCGC	2	10	99181	99190	0 %	0 %	40 %	60 %	33591359
80	NC_002929	GCCCA	2	10	102131	102140	20 %	0 %	20 %	60 %	33591362
81	NC_002929	GCGCC	2	10	103349	103358	0 %	0 %	40 %	60 %	33591364
82	NC_002929	GCGCG	2	10	106179	106188	0 %	0 %	60 %	40 %	33591367
83	NC_002929	GGCCG	2	10	106513	106522	0 %	0 %	60 %	40 %	33591368
84	NC_002929	CGGCC	2	10	108989	108998	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
85	NC_002929	CCGGG	2	10	109034	109043	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
86	NC_002929	GGCCT	2	10	110156	110165	0 %	20 %	40 %	40 %	33591370
87	NC_002929	CGAAT	2	10	110730	110739	40 %	20 %	20 %	20 %	33591371
88	NC_002929	CGTCC	2	10	111699	111708	0 %	20 %	20 %	60 %	33591372
89	NC_002929	TCCGG	2	10	111942	111951	0 %	20 %	40 %	40 %	33591373
90	NC_002929	CGGCG	2	10	112359	112368	0 %	0 %	60 %	40 %	33591373
91	NC_002929	AGGCC	2	10	112842	112851	20 %	0 %	40 %	40 %	33591373
92	NC_002929	GCGCG	2	10	113269	113278	0 %	0 %	60 %	40 %	33591373
93	NC_002929	CATTC	2	10	113917	113926	20 %	40 %	0 %	40 %	33591374
94	NC_002929	GACCT	2	10	114222	114231	20 %	20 %	20 %	40 %	33591374
95	NC_002929	GCGCT	2	10	115260	115269	0 %	20 %	40 %	40 %	33591376
96	NC_002929	ACGCG	2	10	115380	115389	20 %	0 %	40 %	40 %	33591376
97	NC_002929	CGGCG	2	10	116667	116676	0 %	0 %	60 %	40 %	33591377
98	NC_002929	GCCAG	2	10	119102	119111	20 %	0 %	40 %	40 %	33591380
99	NC_002929	GGTGC	2	10	120426	120435	0 %	20 %	60 %	20 %	33591381
100	NC_002929	GCCAG	2	10	124487	124496	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_002929	CGGCG	2	10	126501	126510	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
102	NC_002929	GCGCG	2	10	126939	126948	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
103	NC_002929	GGCGT	2	10	129465	129474	0 %	20 %	60 %	20 %	33591386
104	NC_002929	GCGCA	2	10	130438	130447	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_002929	CCGCG	2	10	131524	131533	0 %	0 %	40 %	60 %	33591388
106	NC_002929	GGCCG	2	10	131926	131935	0 %	0 %	60 %	40 %	33591388
107	NC_002929	ATGCG	2	10	133249	133258	20 %	20 %	40 %	20 %	33591390
108	NC_002929	TCGGG	2	10	133339	133348	0 %	20 %	60 %	20 %	33591390
109	NC_002929	GGTGC	2	10	133784	133793	0 %	20 %	60 %	20 %	33591390
110	NC_002929	GGCGC	2	10	134036	134045	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
111	NC_002929	CGGCT	2	10	136893	136902	0 %	20 %	40 %	40 %	33591392
112	NC_002929	GCCGT	2	10	137338	137347	0 %	20 %	40 %	40 %	33591392
113	NC_002929	CAGCC	2	10	137761	137770	20 %	0 %	20 %	60 %	33591392
114	NC_002929	CCGCG	2	10	139148	139157	0 %	0 %	40 %	60 %	33591393
115	NC_002929	CCTGG	2	10	139750	139759	0 %	20 %	40 %	40 %	33591393
116	NC_002929	AGGCC	2	10	142525	142534	20 %	0 %	40 %	40 %	33591393
117	NC_002929	GCGCC	2	10	142702	142711	0 %	0 %	40 %	60 %	33591393
118	NC_002929	GCGGG	2	10	143045	143054	0 %	0 %	80 %	20 %	33591394
119	NC_002929	CGGCG	2	10	143456	143465	0 %	0 %	60 %	40 %	33591394
120	NC_002929	GCACG	2	10	143919	143928	20 %	0 %	40 %	40 %	33591395
121	NC_002929	GCGGT	2	10	146853	146862	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
122	NC_002929	GCGCT	2	10	147246	147255	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
123	NC_002929	CGGCC	2	10	147902	147911	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
124	NC_002929	GGCTG	2	10	149346	149355	0 %	20 %	60 %	20 %	33591399
125	NC_002929	GCTCG	2	10	149719	149728	0 %	20 %	40 %	40 %	33591399
126	NC_002929	GGCGC	2	10	150349	150358	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
127	NC_002929	AGCGC	2	10	150704	150713	20 %	0 %	40 %	40 %	33591400
128	NC_002929	GGCCG	2	10	151235	151244	0 %	0 %	60 %	40 %	33591400
129	NC_002929	GGCGC	2	10	151775	151784	0 %	0 %	60 %	40 %	33591401
130	NC_002929	CCGGG	2	10	152059	152068	0 %	0 %	60 %	40 %	33591401
131	NC_002929	GCGCC	2	10	154207	154216	0 %	0 %	40 %	60 %	33591404
132	NC_002929	CGCGC	2	10	154295	154304	0 %	0 %	40 %	60 %	33591404
133	NC_002929	GAACA	2	10	154946	154955	60 %	0 %	20 %	20 %	33591404
134	NC_002929	GGCCG	2	10	155152	155161	0 %	0 %	60 %	40 %	33591405
135	NC_002929	GGCGT	2	10	156737	156746	0 %	20 %	60 %	20 %	33591406
136	NC_002929	GCGCC	2	10	158030	158039	0 %	0 %	40 %	60 %	33591408
137	NC_002929	GCGCC	2	10	158311	158320	0 %	0 %	40 %	60 %	33591408
138	NC_002929	GCGCC	2	10	158698	158707	0 %	0 %	40 %	60 %	33591408
139	NC_002929	CGGCG	2	10	159813	159822	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
140	NC_002929	GGCTG	2	10	160715	160724	0 %	20 %	60 %	20 %	33591410
141	NC_002929	CGGCG	2	10	161361	161370	0 %	0 %	60 %	40 %	33591411
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