MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 12359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002929	GGGC	2	8	517	524	0 %	0 %	75 %	25 %	33591276
2	NC_002929	GACG	2	8	616	623	25 %	0 %	50 %	25 %	33591276
3	NC_002929	CGCA	2	8	751	758	25 %	0 %	25 %	50 %	33591276
4	NC_002929	CATC	2	8	836	843	25 %	25 %	0 %	50 %	33591276
5	NC_002929	GCCT	2	8	947	954	0 %	25 %	25 %	50 %	33591276
6	NC_002929	GCTG	2	8	1602	1609	0 %	25 %	50 %	25 %	33591276
7	NC_002929	GCAA	2	8	1904	1911	50 %	0 %	25 %	25 %	33591276
8	NC_002929	GCCG	2	8	1988	1995	0 %	0 %	50 %	50 %	33591277
9	NC_002929	GTCG	2	8	2120	2127	0 %	25 %	50 %	25 %	33591277
10	NC_002929	GGCC	2	8	2423	2430	0 %	0 %	50 %	50 %	33591277
11	NC_002929	CCGC	2	8	2631	2638	0 %	0 %	25 %	75 %	33591278
12	NC_002929	GCCC	2	8	3006	3013	0 %	0 %	25 %	75 %	33591278
13	NC_002929	GCTG	2	8	3040	3047	0 %	25 %	50 %	25 %	33591278
14	NC_002929	TGCT	2	8	3420	3427	0 %	50 %	25 %	25 %	33591279
15	NC_002929	GCCA	2	8	4031	4038	25 %	0 %	25 %	50 %	33591279
16	NC_002929	CCTG	2	8	4337	4344	0 %	25 %	25 %	50 %	33591280
17	NC_002929	GTGC	2	8	4455	4462	0 %	25 %	50 %	25 %	33591280
18	NC_002929	GGCC	2	8	4532	4539	0 %	0 %	50 %	50 %	33591280
19	NC_002929	GGCG	2	8	4784	4791	0 %	0 %	75 %	25 %	33591280
20	NC_002929	GGCC	2	8	5265	5272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_002929	CGAC	2	8	5381	5388	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_002929	CGGC	2	8	5697	5704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_002929	GGCG	2	8	7537	7544	0 %	0 %	75 %	25 %	33591281
24	NC_002929	TATG	2	8	7980	7987	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002929	TTGC	2	8	8316	8323	0 %	50 %	25 %	25 %	33591282
26	NC_002929	AAGG	2	8	8937	8944	50 %	0 %	50 %	0 %	33591283
27	NC_002929	CCCG	2	8	9356	9363	0 %	0 %	25 %	75 %	33591284
28	NC_002929	CCTA	2	8	11762	11769	25 %	25 %	0 %	50 %	33591288
29	NC_002929	TCGT	2	8	12076	12083	0 %	50 %	25 %	25 %	33591288
30	NC_002929	GTCG	2	8	13662	13669	0 %	25 %	50 %	25 %	33591288
31	NC_002929	TCGC	2	8	14195	14202	0 %	25 %	25 %	50 %	33591288
32	NC_002929	GGCC	2	8	14916	14923	0 %	0 %	50 %	50 %	33591288
33	NC_002929	TCGC	2	8	15735	15742	0 %	25 %	25 %	50 %	33591288
34	NC_002929	CAAG	2	8	15797	15804	50 %	0 %	25 %	25 %	33591289
35	NC_002929	ATGG	2	8	16478	16485	25 %	25 %	50 %	0 %	33591289
36	NC_002929	AAGG	2	8	17721	17728	50 %	0 %	50 %	0 %	33591289
37	NC_002929	ATCG	2	8	18536	18543	25 %	25 %	25 %	25 %	33591289
38	NC_002929	GGTG	2	8	19079	19086	0 %	25 %	75 %	0 %	33591289
39	NC_002929	ACTG	2	8	20025	20032	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_002929	CCTG	2	8	21093	21100	0 %	25 %	25 %	50 %	33591291
41	NC_002929	GCCC	2	8	21856	21863	0 %	0 %	25 %	75 %	33591291
42	NC_002929	CACG	2	8	21974	21981	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_002929	TTCG	2	8	22158	22165	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_002929	CACG	2	8	22271	22278	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_002929	CGGA	2	8	22301	22308	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_002929	GCCG	2	8	23010	23017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_002929	CGCC	2	8	23523	23530	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48	NC_002929	GGCC	2	8	23709	23716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_002929	GCTG	2	8	24169	24176	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_002929	GCCG	2	8	24177	24184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_002929	GCCA	2	8	24302	24309	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_002929	CGGG	2	8	24314	24321	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_002929	TGCT	2	8	25315	25322	0 %	50 %	25 %	25 %	33591292
54	NC_002929	GCCT	2	8	25917	25924	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_002929	GCCG	2	8	26540	26547	0 %	0 %	50 %	50 %	33591293
56	NC_002929	TGAG	2	8	26703	26710	25 %	25 %	50 %	0 %	33591293
57	NC_002929	CGCC	2	8	26836	26843	0 %	0 %	25 %	75 %	33591293
58	NC_002929	CTGC	2	8	26848	26855	0 %	25 %	25 %	50 %	33591293
59	NC_002929	GCCG	2	8	26884	26891	0 %	0 %	50 %	50 %	33591293
60	NC_002929	CGGC	2	8	27096	27103	0 %	0 %	50 %	50 %	33591293
61	NC_002929	GCTG	2	8	27136	27143	0 %	25 %	50 %	25 %	33591293
62	NC_002929	CGGC	2	8	27870	27877	0 %	0 %	50 %	50 %	33591294
63	NC_002929	GCTG	2	8	27931	27938	0 %	25 %	50 %	25 %	33591294
64	NC_002929	CCGG	2	8	28234	28241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_002929	GGCC	2	8	28501	28508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_002929	CGAA	2	8	28727	28734	50 %	0 %	25 %	25 %	33591295
67	NC_002929	GGCC	2	8	28963	28970	0 %	0 %	50 %	50 %	33591295
68	NC_002929	CAGC	2	8	29177	29184	25 %	0 %	25 %	50 %	33591296
69	NC_002929	AGCC	2	8	29320	29327	25 %	0 %	25 %	50 %	33591296
70	NC_002929	GGCG	2	8	29513	29520	0 %	0 %	75 %	25 %	33591296
71	NC_002929	CGTG	2	8	29612	29619	0 %	25 %	50 %	25 %	33591296
72	NC_002929	GGCC	2	8	30044	30051	0 %	0 %	50 %	50 %	33591296
73	NC_002929	AATC	2	8	30635	30642	50 %	25 %	0 %	25 %	33591297
74	NC_002929	AGCA	2	8	31239	31246	50 %	0 %	25 %	25 %	33591298
75	NC_002929	GCCT	2	8	32007	32014	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_002929	TCGC	2	8	32791	32798	0 %	25 %	25 %	50 %	33591299
77	NC_002929	AAGG	2	8	32941	32948	50 %	0 %	50 %	0 %	33591299
78	NC_002929	CCCG	2	8	33075	33082	0 %	0 %	25 %	75 %	33591300
79	NC_002929	GCAC	2	8	33911	33918	25 %	0 %	25 %	50 %	33591300
80	NC_002929	CACC	2	8	34037	34044	25 %	0 %	0 %	75 %	33591300
81	NC_002929	CCGG	2	8	34618	34625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_002929	CAGC	2	8	34921	34928	25 %	0 %	25 %	50 %	33591301
83	NC_002929	GCCG	2	8	34982	34989	0 %	0 %	50 %	50 %	33591301
84	NC_002929	CCAC	2	8	35920	35927	25 %	0 %	0 %	75 %	33591302
85	NC_002929	TGCC	2	8	35953	35960	0 %	25 %	25 %	50 %	33591302
86	NC_002929	GGCC	2	8	36223	36230	0 %	0 %	50 %	50 %	33591302
87	NC_002929	CAAG	2	8	37060	37067	50 %	0 %	25 %	25 %	33591303
88	NC_002929	GCTC	2	8	37296	37303	0 %	25 %	25 %	50 %	33591303
89	NC_002929	GCCG	2	8	37892	37899	0 %	0 %	50 %	50 %	33591303
90	NC_002929	GGCC	2	8	38501	38508	0 %	0 %	50 %	50 %	33591304
91	NC_002929	GACC	2	8	38975	38982	25 %	0 %	25 %	50 %	33591304
92	NC_002929	GGCG	2	8	39881	39888	0 %	0 %	75 %	25 %	33591304
93	NC_002929	GCAG	2	8	40465	40472	25 %	0 %	50 %	25 %	33591305
94	NC_002929	AAGA	2	8	40898	40905	75 %	0 %	25 %	0 %	33591306
95	NC_002929	ATCG	2	8	40961	40968	25 %	25 %	25 %	25 %	33591306
96	NC_002929	CGGC	2	8	41409	41416	0 %	0 %	50 %	50 %	33591307
97	NC_002929	GCCG	2	8	41426	41433	0 %	0 %	50 %	50 %	33591307
98	NC_002929	TGGC	2	8	41826	41833	0 %	25 %	50 %	25 %	33591307
99	NC_002929	GGCC	2	8	42579	42586	0 %	0 %	50 %	50 %	33591308
100	NC_002929	GCCG	2	8	42903	42910	0 %	0 %	50 %	50 %	33591309
101	NC_002929	CGGC	2	8	43128	43135	0 %	0 %	50 %	50 %	33591309
102	NC_002929	CCGC	2	8	43350	43357	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
103	NC_002929	CGCC	2	8	43400	43407	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
104	NC_002929	CCGG	2	8	43656	43663	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_002929	CAGC	2	8	43959	43966	25 %	0 %	25 %	50 %	33591310
106	NC_002929	GCCG	2	8	44020	44027	0 %	0 %	50 %	50 %	33591310
107	NC_002929	GGCC	2	8	44763	44770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_002929	GGGC	2	8	44839	44846	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
109	NC_002929	GGCC	2	8	44916	44923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_002929	GCCA	2	8	44988	44995	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_002929	CGGC	2	8	45015	45022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_002929	GCTC	2	8	45025	45032	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_002929	CGTG	2	8	45335	45342	0 %	25 %	50 %	25 %	33591311
114	NC_002929	CCGG	2	8	45352	45359	0 %	0 %	50 %	50 %	33591311
115	NC_002929	CGAC	2	8	45646	45653	25 %	0 %	25 %	50 %	33591311
116	NC_002929	GCGG	2	8	45871	45878	0 %	0 %	75 %	25 %	33591312
117	NC_002929	GCAG	2	8	45912	45919	25 %	0 %	50 %	25 %	33591312
118	NC_002929	CGGC	2	8	45986	45993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_002929	CTGG	2	8	46621	46628	0 %	25 %	50 %	25 %	33591313
120	NC_002929	AGGT	2	8	47142	47149	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002929	GGCC	2	8	47367	47374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_002929	CGCC	2	8	47526	47533	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
123	NC_002929	GGCC	2	8	47588	47595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_002929	GGCA	2	8	48014	48021	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_002929	TGCC	2	8	48176	48183	0 %	25 %	25 %	50 %	33591314
126	NC_002929	GGCC	2	8	48530	48537	0 %	0 %	50 %	50 %	33591314
127	NC_002929	ACCT	2	8	48898	48905	25 %	25 %	0 %	50 %	33591314
128	NC_002929	GCCG	2	8	48951	48958	0 %	0 %	50 %	50 %	33591314
129	NC_002929	CGAC	2	8	49172	49179	25 %	0 %	25 %	50 %	33591314
130	NC_002929	CCGG	2	8	50134	50141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_002929	CAGC	2	8	50437	50444	25 %	0 %	25 %	50 %	33591316
132	NC_002929	GCCG	2	8	50498	50505	0 %	0 %	50 %	50 %	33591316
133	NC_002929	GCTG	2	8	51646	51653	0 %	25 %	50 %	25 %	33591317
134	NC_002929	CGGC	2	8	51735	51742	0 %	0 %	50 %	50 %	33591317
135	NC_002929	CGCT	2	8	52008	52015	0 %	25 %	25 %	50 %	33591317
136	NC_002929	ACCT	2	8	52236	52243	25 %	25 %	0 %	50 %	33591317
137	NC_002929	GGCA	2	8	52532	52539	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_002929	TCGA	2	8	53669	53676	25 %	25 %	25 %	25 %	33591318
139	NC_002929	CAGC	2	8	55407	55414	25 %	0 %	25 %	50 %	33591319
140	NC_002929	CTGG	2	8	55970	55977	0 %	25 %	50 %	25 %	33591320
141	NC_002929	ACGT	2	8	56223	56230	25 %	25 %	25 %	25 %	33591320
142	NC_002929	TCGG	2	8	56533	56540	0 %	25 %	50 %	25 %	33591321
143	NC_002929	CAGC	2	8	56922	56929	25 %	0 %	25 %	50 %	33591321
144	NC_002929	GCCG	2	8	56943	56950	0 %	0 %	50 %	50 %	33591321
145	NC_002929	GGGC	2	8	57344	57351	0 %	0 %	75 %	25 %	33591321
146	NC_002929	GCCG	2	8	57437	57444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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