MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 113957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_002929	GCCTGC	2	12	153572	153583	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	33591403
4002	NC_002929	GAC	2	6	153592	153597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591403
4003	NC_002929	CGC	2	6	153653	153658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591403
4004	NC_002929	GCGG	2	8	153684	153691	0 %	0 %	75 %	25 %	33591403
4005	NC_002929	G	13	13	153715	153727	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_002929	GC	3	6	153931	153936	0 %	0 %	50 %	50 %	33591404
4007	NC_002929	GC	3	6	153940	153945	0 %	0 %	50 %	50 %	33591404
4008	NC_002929	GAT	2	6	153968	153973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33591404
4009	NC_002929	GCC	2	6	153980	153985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591404
4010	NC_002929	TGG	2	6	154030	154035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591404
4011	NC_002929	TGC	2	6	154105	154110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591404
4012	NC_002929	GCG	2	6	154120	154125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591404
4013	NC_002929	ACG	2	6	154131	154136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591404
4014	NC_002929	TCG	2	6	154170	154175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591404
4015	NC_002929	TCGG	2	8	154188	154195	0 %	25 %	50 %	25 %	33591404
4016	NC_002929	GCGCC	2	10	154207	154216	0 %	0 %	40 %	60 %	33591404
4017	NC_002929	CGT	2	6	154240	154245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591404
4018	NC_002929	CCA	2	6	154261	154266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591404
4019	NC_002929	CG	3	6	154273	154278	0 %	0 %	50 %	50 %	33591404
4020	NC_002929	TGA	2	6	154285	154290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33591404
4021	NC_002929	CGCGC	2	10	154295	154304	0 %	0 %	40 %	60 %	33591404
4022	NC_002929	GC	3	6	154310	154315	0 %	0 %	50 %	50 %	33591404
4023	NC_002929	GCC	2	6	154352	154357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591404
4024	NC_002929	GAC	2	6	154373	154378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591404
4025	NC_002929	CAG	2	6	154391	154396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591404
4026	NC_002929	CGG	2	6	154411	154416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591404
4027	NC_002929	CG	4	8	154417	154424	0 %	0 %	50 %	50 %	33591404
4028	NC_002929	GAA	2	6	154454	154459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33591404
4029	NC_002929	CAC	2	6	154460	154465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591404
4030	NC_002929	CGA	2	6	154522	154527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591404
4031	NC_002929	CGG	2	6	154561	154566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591404
4032	NC_002929	TTC	2	6	154602	154607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33591404
4033	NC_002929	GCA	3	9	154621	154629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591404
4034	NC_002929	CAT	2	6	154706	154711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591404
4035	NC_002929	GGC	2	6	154712	154717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591404
4036	NC_002929	TGGT	2	8	154731	154738	0 %	50 %	50 %	0 %	33591404
4037	NC_002929	CAC	2	6	154757	154762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591404
4038	NC_002929	GCC	2	6	154779	154784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591404
4039	NC_002929	CAC	2	6	154823	154828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591404
4040	NC_002929	GCC	2	6	154872	154877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591404
4041	NC_002929	CGA	2	6	154885	154890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591404
4042	NC_002929	GCCG	2	8	154901	154908	0 %	0 %	50 %	50 %	33591404
4043	NC_002929	GAACA	2	10	154946	154955	60 %	0 %	20 %	20 %	33591404
4044	NC_002929	ACA	2	6	154981	154986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33591404
4045	NC_002929	C	10	10	154998	155007	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4046	NC_002929	GCG	2	6	155025	155030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_002929	CAG	2	6	155116	155121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591405
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4050	NC_002929	GGCCG	2	10	155152	155161	0 %	0 %	60 %	40 %	33591405
4051	NC_002929	GC	3	6	155210	155215	0 %	0 %	50 %	50 %	33591405
4052	NC_002929	GCA	2	6	155226	155231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591405
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4054	NC_002929	CG	4	8	155283	155290	0 %	0 %	50 %	50 %	33591405
4055	NC_002929	TGC	2	6	155382	155387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591405
4056	NC_002929	TGC	2	6	155393	155398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591405
4057	NC_002929	GCA	2	6	155410	155415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591405
4058	NC_002929	GT	3	6	155454	155459	0 %	50 %	50 %	0 %	33591405
4059	NC_002929	CGGC	2	8	155472	155479	0 %	0 %	50 %	50 %	33591405
4060	NC_002929	CAG	2	6	155497	155502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591405
4061	NC_002929	GCG	2	6	155506	155511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591405
4062	NC_002929	G	6	6	155558	155563	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_002929	GC	3	6	155566	155571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4064	NC_002929	TGCG	2	8	155587	155594	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4065	NC_002929	CGA	2	6	155613	155618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4069	NC_002929	GC	3	6	155762	155767	0 %	0 %	50 %	50 %	33591406
4070	NC_002929	CCAGGC	2	12	155775	155786	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	33591406
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4077	NC_002929	GCG	2	6	155918	155923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591406
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4081	NC_002929	CAG	2	6	155974	155979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591406
4082	NC_002929	GCG	2	6	155992	155997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591406
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4095	NC_002929	GCG	2	6	156499	156504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591406
4096	NC_002929	GCC	2	6	156515	156520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591406
4097	NC_002929	CAC	2	6	156523	156528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591406
4098	NC_002929	GC	3	6	156546	156551	0 %	0 %	50 %	50 %	33591406
4099	NC_002929	CAG	2	6	156556	156561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591406
4100	NC_002929	GC	3	6	156589	156594	0 %	0 %	50 %	50 %	33591406
4101	NC_002929	CGGG	2	8	156639	156646	0 %	0 %	75 %	25 %	33591406
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4105	NC_002929	GGCGT	2	10	156737	156746	0 %	20 %	60 %	20 %	33591406
4106	NC_002929	GGCC	2	8	156801	156808	0 %	0 %	50 %	50 %	33591406
4107	NC_002929	CCA	2	6	156861	156866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591406
4108	NC_002929	CG	3	6	156891	156896	0 %	0 %	50 %	50 %	33591406
4109	NC_002929	CAG	2	6	156943	156948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591406
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4111	NC_002929	GCC	2	6	157002	157007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591406
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4119	NC_002929	CAG	2	6	157236	157241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591407
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4122	NC_002929	GCA	2	6	157328	157333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591407
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4247	NC_002929	GCG	3	9	161324	161332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591411
4248	NC_002929	CGC	2	6	161333	161338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591411
4249	NC_002929	CGGCG	2	10	161361	161370	0 %	0 %	60 %	40 %	33591411
4250	NC_002929	GGC	2	6	161371	161376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591411
4251	NC_002929	GCA	2	6	161397	161402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591411
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4269	NC_002929	TGC	2	6	162101	162106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591412
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4356	NC_002929	GCTG	2	8	165543	165550	0 %	25 %	50 %	25 %	33591414
4357	NC_002929	GC	3	6	165573	165578	0 %	0 %	50 %	50 %	33591414
4358	NC_002929	GCG	2	6	165594	165599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591414
4359	NC_002929	CA	3	6	165762	165767	50 %	0 %	0 %	50 %	33591414
4360	NC_002929	CCGG	2	8	165846	165853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4361	NC_002929	G	7	7	165870	165876	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4362	NC_002929	GC	3	6	165947	165952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4363	NC_002929	CTG	2	6	165960	165965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4364	NC_002929	CGA	2	6	165980	165985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4365	NC_002929	GGC	2	6	166026	166031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4366	NC_002929	GTG	2	6	166044	166049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4367	NC_002929	TCA	2	6	166081	166086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4368	NC_002929	CGA	2	6	166091	166096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4369	NC_002929	ACC	2	6	166101	166106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4370	NC_002929	GAT	2	6	166178	166183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4371	NC_002929	CAT	2	6	166184	166189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4372	NC_002929	CACG	2	8	166190	166197	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4373	NC_002929	ACCG	2	8	166221	166228	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4374	NC_002929	ACC	2	6	166297	166302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4375	NC_002929	CCG	2	6	166324	166329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4376	NC_002929	GCG	2	6	166352	166357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4377	NC_002929	GTG	2	6	166365	166370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4379	NC_002929	GCG	2	6	166436	166441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4395	NC_002929	CGA	2	6	167000	167005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4498	NC_002929	CGC	2	6	170824	170829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591418
4499	NC_002929	TGG	2	6	170880	170885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591418
4500	NC_002929	CTG	2	6	170933	170938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591418

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