MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 113957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_002929	CAG	2	6	117086	117091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591378
3003	NC_002929	GGC	2	6	117143	117148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591378
3004	NC_002929	GGC	2	6	117179	117184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591378
3005	NC_002929	AGA	2	6	117190	117195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33591378
3006	NC_002929	CAT	2	6	117230	117235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591378
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3011	NC_002929	GCCACC	2	12	117354	117365	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	33591378
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3034	NC_002929	CTG	3	9	118041	118049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591379
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3126	NC_002929	CGGC	2	8	120929	120936	0 %	0 %	50 %	50 %	33591381
3127	NC_002929	CGGT	2	8	120946	120953	0 %	25 %	50 %	25 %	33591381
3128	NC_002929	GCC	2	6	121052	121057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3129	NC_002929	CAC	2	6	121060	121065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3130	NC_002929	GGC	2	6	121111	121116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_002929	GC	3	6	121181	121186	0 %	0 %	50 %	50 %	33591382
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3147	NC_002929	G	6	6	122098	122103	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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3151	NC_002929	GGCG	2	8	122270	122277	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3152	NC_002929	GCGG	2	8	122282	122289	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3153	NC_002929	TCG	2	6	122302	122307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3154	NC_002929	CAG	2	6	122316	122321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3155	NC_002929	CG	3	6	122327	122332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3156	NC_002929	CG	3	6	122337	122342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3157	NC_002929	CGA	2	6	122372	122377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3178	NC_002929	GCC	2	6	123021	123026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3247	NC_002929	GCC	2	6	125796	125801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3249	NC_002929	CAG	2	6	125862	125867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3250	NC_002929	CG	3	6	125978	125983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3251	NC_002929	CAG	2	6	126030	126035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3252	NC_002929	GGC	2	6	126069	126074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3253	NC_002929	CTG	2	6	126084	126089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3254	NC_002929	GC	4	8	126169	126176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3381	NC_002929	ACC	2	6	131046	131051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591387
3382	NC_002929	CAA	2	6	131087	131092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33591387
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3384	NC_002929	TCA	2	6	131146	131151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591387
3385	NC_002929	GTC	2	6	131255	131260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591388
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3480	NC_002929	CG	3	6	134237	134242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3481	NC_002929	CTG	2	6	134260	134265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3484	NC_002929	TTG	2	6	134362	134367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3491	NC_002929	GCT	2	6	134624	134629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3498	NC_002929	GC	4	8	134948	134955	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3499	NC_002929	CGGG	2	8	134989	134996	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3500	NC_002929	GC	4	8	135003	135010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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