MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 113957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_002929	GCC	2	6	430240	430245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591648
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12004	NC_002929	ACC	2	6	430262	430267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591648
12005	NC_002929	GCG	3	9	430319	430327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591648
12006	NC_002929	CTGGT	2	10	430385	430394	0 %	40 %	40 %	20 %	33591648
12007	NC_002929	CGA	2	6	430395	430400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591648
12008	NC_002929	CGT	2	6	430410	430415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591648
12009	NC_002929	GGAC	2	8	430440	430447	25 %	0 %	50 %	25 %	33591648
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12011	NC_002929	TGG	2	6	430476	430481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591648
12012	NC_002929	CGG	2	6	430494	430499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591648
12013	NC_002929	GTC	2	6	430537	430542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591648
12014	NC_002929	GCC	2	6	430549	430554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591648
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12017	NC_002929	GC	3	6	430739	430744	0 %	0 %	50 %	50 %	33591648
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12247	NC_002929	CAC	2	6	440014	440019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591653
12248	NC_002929	ACC	2	6	440024	440029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591653
12249	NC_002929	GCA	2	6	440050	440055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591653
12250	NC_002929	CGTC	2	8	440093	440100	0 %	25 %	25 %	50 %	33591653
12251	NC_002929	TGA	2	6	440187	440192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33591653
12252	NC_002929	GGC	2	6	440199	440204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591653
12253	NC_002929	GCG	2	6	440216	440221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591653
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12255	NC_002929	CCG	2	6	440381	440386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591653
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12257	NC_002929	G	6	6	440481	440486	0 %	0 %	100 %	0 %	33591653
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12259	NC_002929	GAC	2	6	440607	440612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591654
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12263	NC_002929	GC	3	6	440700	440705	0 %	0 %	50 %	50 %	33591654
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12272	NC_002929	TTA	2	6	441085	441090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12273	NC_002929	ATT	2	6	441108	441113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12274	NC_002929	GC	3	6	441145	441150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12275	NC_002929	AAAGA	2	10	441176	441185	80 %	0 %	20 %	0 %	33591655
12276	NC_002929	GCT	2	6	441214	441219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591655
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12291	NC_002929	GCT	4	12	441769	441780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591655
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12352	NC_002929	GC	3	6	444526	444531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12353	NC_002929	TCC	2	6	444538	444543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12354	NC_002929	AGCCC	2	10	444566	444575	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12355	NC_002929	CCG	2	6	444580	444585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12357	NC_002929	CG	3	6	444678	444683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12358	NC_002929	GCA	2	6	444725	444730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12361	NC_002929	ATG	2	6	444882	444887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12362	NC_002929	TTACGT	2	12	444899	444910	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12363	NC_002929	AAACGT	2	12	444911	444922	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12364	NC_002929	CAG	2	6	445005	445010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591658
12365	NC_002929	CTG	2	6	445029	445034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591658
12366	NC_002929	TGT	3	9	445069	445077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33591658
12367	NC_002929	GC	4	8	445224	445231	0 %	0 %	50 %	50 %	33591658
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12369	NC_002929	CGTG	2	8	445308	445315	0 %	25 %	50 %	25 %	33591658
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12496	NC_002929	TCA	2	6	450495	450500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591661
12497	NC_002929	TGC	2	6	450510	450515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591661
12498	NC_002929	GGCC	2	8	450517	450524	0 %	0 %	50 %	50 %	33591661
12499	NC_002929	GCCC	2	8	450535	450542	0 %	0 %	25 %	75 %	33591661
12500	NC_002929	CAC	2	6	450586	450591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591661

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