MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 113957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002929	GGC	2	6	21026	21031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591291
502	NC_002929	GGA	2	6	21086	21091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33591291
503	NC_002929	CCTG	2	8	21093	21100	0 %	25 %	25 %	50 %	33591291
504	NC_002929	CG	3	6	21103	21108	0 %	0 %	50 %	50 %	33591291
505	NC_002929	GCC	3	9	21163	21171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591291
506	NC_002929	GCG	2	6	21177	21182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591291
507	NC_002929	ACG	2	6	21199	21204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591291
508	NC_002929	GC	3	6	21257	21262	0 %	0 %	50 %	50 %	33591291
509	NC_002929	GAGCCG	2	12	21330	21341	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	33591291
510	NC_002929	CCG	2	6	21343	21348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591291
511	NC_002929	CCG	2	6	21375	21380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591291
512	NC_002929	CGA	2	6	21386	21391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591291
513	NC_002929	ACG	2	6	21397	21402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591291
514	NC_002929	CGG	2	6	21424	21429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591291
515	NC_002929	GCA	2	6	21433	21438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591291
516	NC_002929	CTG	2	6	21453	21458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591291
517	NC_002929	TGG	2	6	21489	21494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591291
518	NC_002929	GCG	2	6	21517	21522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591291
519	NC_002929	GAC	2	6	21545	21550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591291
520	NC_002929	CCG	2	6	21594	21599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591291
521	NC_002929	GCC	2	6	21600	21605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591291
522	NC_002929	CGC	2	6	21616	21621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591291
523	NC_002929	GCG	2	6	21625	21630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591291
524	NC_002929	GCC	2	6	21662	21667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591291
525	NC_002929	CGC	2	6	21692	21697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591291
526	NC_002929	GGA	2	6	21719	21724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33591291
527	NC_002929	GCC	2	6	21756	21761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591291
528	NC_002929	GCG	2	6	21842	21847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591291
529	NC_002929	GCCC	2	8	21856	21863	0 %	0 %	25 %	75 %	33591291
530	NC_002929	GTC	2	6	21900	21905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591291
531	NC_002929	GCC	2	6	21923	21928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591291
532	NC_002929	CACG	2	8	21974	21981	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
533	NC_002929	GCA	2	6	22037	22042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_002929	CGG	2	6	22055	22060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_002929	TGA	2	6	22082	22087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_002929	CGGCC	2	10	22091	22100	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
537	NC_002929	GCC	2	6	22149	22154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_002929	TTCG	2	8	22158	22165	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
539	NC_002929	CGG	2	6	22169	22174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_002929	CG	3	6	22181	22186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
541	NC_002929	CGT	2	6	22235	22240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_002929	CACG	2	8	22271	22278	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
543	NC_002929	CGGA	2	8	22301	22308	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
544	NC_002929	CAG	2	6	22329	22334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_002929	CTG	2	6	22347	22352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_002929	GTC	2	6	22362	22367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_002929	TCG	2	6	22396	22401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_002929	CG	5	10	22418	22427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
549	NC_002929	TCG	2	6	22442	22447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_002929	GCA	2	6	22458	22463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_002929	CG	3	6	22507	22512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
552	NC_002929	TCG	2	6	22529	22534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_002929	CTG	2	6	22588	22593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_002929	CCA	2	6	22623	22628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_002929	GCG	2	6	22647	22652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_002929	CG	3	6	22651	22656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
557	NC_002929	TCG	2	6	22760	22765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_002929	GC	3	6	22776	22781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
559	NC_002929	GCG	2	6	22857	22862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_002929	TCG	2	6	22901	22906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_002929	GC	3	6	22913	22918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
562	NC_002929	CGG	2	6	22929	22934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_002929	GGCGC	2	10	22947	22956	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
564	NC_002929	CGC	2	6	22987	22992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_002929	GCCG	2	8	23010	23017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
566	NC_002929	CG	3	6	23016	23021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
567	NC_002929	GCGTC	2	10	23034	23043	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
568	NC_002929	CG	3	6	23091	23096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
569	NC_002929	CAG	2	6	23146	23151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_002929	CGG	2	6	23179	23184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_002929	GCA	2	6	23226	23231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_002929	CCAGCA	2	12	23274	23285	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
573	NC_002929	CGG	2	6	23296	23301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_002929	GCC	2	6	23381	23386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_002929	CAG	3	9	23416	23424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_002929	GCAGC	2	10	23430	23439	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
577	NC_002929	GC	3	6	23488	23493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
578	NC_002929	GCA	2	6	23499	23504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_002929	GAT	2	6	23512	23517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_002929	CGCC	2	8	23523	23530	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
581	NC_002929	CCA	2	6	23595	23600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_002929	GCA	2	6	23643	23648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_002929	G	7	7	23680	23686	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
584	NC_002929	GGCC	2	8	23709	23716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
585	NC_002929	CGC	2	6	23757	23762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_002929	TCA	2	6	23769	23774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_002929	GCA	2	6	23835	23840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_002929	TGA	2	6	23865	23870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_002929	GCG	3	9	23879	23887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_002929	GCG	2	6	23907	23912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_002929	CG	4	8	23926	23933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
592	NC_002929	CAC	2	6	23947	23952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
593	NC_002929	GCA	2	6	23955	23960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_002929	GCG	2	6	23974	23979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_002929	GAT	2	6	24037	24042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_002929	CAG	2	6	24079	24084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_002929	GTC	3	9	24136	24144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_002929	GCTG	2	8	24169	24176	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
599	NC_002929	GCCG	2	8	24177	24184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
600	NC_002929	GCC	2	6	24232	24237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_002929	CAG	2	6	24247	24252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_002929	ATG	2	6	24284	24289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_002929	GC	3	6	24295	24300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
604	NC_002929	GCCA	2	8	24302	24309	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
605	NC_002929	CGGG	2	8	24314	24321	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
606	NC_002929	GCG	4	12	24337	24348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_002929	AGC	2	6	24366	24371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591292
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609	NC_002929	GTA	2	6	24497	24502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33591292
610	NC_002929	GC	3	6	24517	24522	0 %	0 %	50 %	50 %	33591292
611	NC_002929	CCA	2	6	24559	24564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591292
612	NC_002929	CG	3	6	24583	24588	0 %	0 %	50 %	50 %	33591292
613	NC_002929	TA	3	6	24599	24604	50 %	50 %	0 %	0 %	33591292
614	NC_002929	GCC	2	6	24644	24649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591292
615	NC_002929	GGC	2	6	24653	24658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591292
616	NC_002929	GC	4	8	24657	24664	0 %	0 %	50 %	50 %	33591292
617	NC_002929	G	6	6	24679	24684	0 %	0 %	100 %	0 %	33591292
618	NC_002929	GCA	2	6	24688	24693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591292
619	NC_002929	GCG	2	6	24774	24779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591292
620	NC_002929	GCT	2	6	24824	24829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591292
621	NC_002929	GCC	2	6	24923	24928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591292
622	NC_002929	CG	3	6	24937	24942	0 %	0 %	50 %	50 %	33591292
623	NC_002929	GGC	2	6	25016	25021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591292
624	NC_002929	TGC	2	6	25105	25110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591292
625	NC_002929	CGA	2	6	25114	25119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591292
626	NC_002929	CGG	2	6	25150	25155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591292
627	NC_002929	ACC	2	6	25176	25181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591292
628	NC_002929	GCC	2	6	25191	25196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591292
629	NC_002929	GTC	2	6	25256	25261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591292
630	NC_002929	TGCT	2	8	25315	25322	0 %	50 %	25 %	25 %	33591292
631	NC_002929	TC	3	6	25366	25371	0 %	50 %	0 %	50 %	33591292
632	NC_002929	GGGCT	2	10	25385	25394	0 %	20 %	60 %	20 %	33591292
633	NC_002929	CA	3	6	25420	25425	50 %	0 %	0 %	50 %	33591292
634	NC_002929	TC	3	6	25465	25470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
635	NC_002929	GTC	2	6	25480	25485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_002929	CGT	2	6	25491	25496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_002929	CTGCGG	2	12	25501	25512	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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645	NC_002929	CGG	2	6	25880	25885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
646	NC_002929	GTC	2	6	25908	25913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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