MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 113957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_002929	AAAT	2	8	226702	226709	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_002929	CGC	2	6	226806	226811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6003	NC_002929	CGC	2	6	226828	226833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6004	NC_002929	GTC	2	6	226884	226889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591461
6005	NC_002929	GTG	2	6	226947	226952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591461
6006	NC_002929	CG	3	6	226981	226986	0 %	0 %	50 %	50 %	33591461
6007	NC_002929	CCA	2	6	227188	227193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591461
6008	NC_002929	CGC	2	6	227238	227243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591461
6009	NC_002929	TCG	2	6	227251	227256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591461
6010	NC_002929	CTT	2	6	227264	227269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33591461
6011	NC_002929	GCCG	2	8	227273	227280	0 %	0 %	50 %	50 %	33591461
6012	NC_002929	TGG	2	6	227293	227298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591461
6013	NC_002929	GGT	2	6	227300	227305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591461
6014	NC_002929	ACG	2	6	227311	227316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591461
6015	NC_002929	TGC	2	6	227353	227358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591461
6016	NC_002929	GC	3	6	227357	227362	0 %	0 %	50 %	50 %	33591461
6017	NC_002929	CGG	2	6	227363	227368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591461
6018	NC_002929	GC	3	6	227436	227441	0 %	0 %	50 %	50 %	33591461
6019	NC_002929	CTG	2	6	227454	227459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591461
6020	NC_002929	CGA	2	6	227489	227494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591461
6021	NC_002929	GTC	2	6	227496	227501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591461
6022	NC_002929	AGC	2	6	227545	227550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591461
6023	NC_002929	CAC	2	6	227618	227623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591461
6024	NC_002929	GCAG	2	8	227651	227658	25 %	0 %	50 %	25 %	33591461
6025	NC_002929	GCC	2	6	227699	227704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591461
6026	NC_002929	TGC	2	6	227722	227727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591461
6027	NC_002929	CGC	2	6	227738	227743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591461
6028	NC_002929	GCC	2	6	227757	227762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591461
6029	NC_002929	C	6	6	227799	227804	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6030	NC_002929	GCC	2	6	227811	227816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6031	NC_002929	C	6	6	227849	227854	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6032	NC_002929	ACGCAA	2	12	227860	227871	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_002929	CTG	2	6	228066	228071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591462
6034	NC_002929	CAC	2	6	228077	228082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591462
6035	NC_002929	CGC	2	6	228127	228132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591462
6036	NC_002929	GACC	2	8	228134	228141	25 %	0 %	25 %	50 %	33591462
6037	NC_002929	CAT	2	6	228188	228193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591462
6038	NC_002929	CGG	2	6	228209	228214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591462
6039	NC_002929	CGG	2	6	228254	228259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591462
6040	NC_002929	ATC	2	6	228312	228317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591462
6041	NC_002929	GCC	3	9	228318	228326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591462
6042	NC_002929	GGCCTG	2	12	228348	228359	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	33591462
6043	NC_002929	CAC	2	6	228383	228388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591462
6044	NC_002929	ATC	2	6	228477	228482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591462
6045	NC_002929	GCT	2	6	228494	228499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591462
6046	NC_002929	GTC	2	6	228534	228539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591462
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6048	NC_002929	GC	3	6	228568	228573	0 %	0 %	50 %	50 %	33591462
6049	NC_002929	CCG	2	6	228583	228588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591462
6050	NC_002929	CCG	2	6	228598	228603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591462
6051	NC_002929	GCC	2	6	228619	228624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591462
6052	NC_002929	AAC	2	6	228627	228632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33591462
6053	NC_002929	CTG	2	6	228648	228653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591462
6054	NC_002929	CTG	2	6	228660	228665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591462
6055	NC_002929	ACCTGA	2	12	228712	228723	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33591462
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6057	NC_002929	CAT	2	6	228749	228754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591462
6058	NC_002929	CTG	2	6	228756	228761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591462
6059	NC_002929	CAT	2	6	228818	228823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591462
6060	NC_002929	CAT	2	6	228848	228853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591462
6061	NC_002929	CAT	2	6	228857	228862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591462
6062	NC_002929	CAT	2	6	228866	228871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591462
6063	NC_002929	TGG	2	6	228886	228891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591462
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6065	NC_002929	TCG	2	6	228910	228915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591462
6066	NC_002929	TCGCC	2	10	228919	228928	0 %	20 %	20 %	60 %	33591462
6067	NC_002929	TCGT	2	8	228960	228967	0 %	50 %	25 %	25 %	33591462
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6069	NC_002929	CGGC	2	8	228988	228995	0 %	0 %	50 %	50 %	33591462
6070	NC_002929	CGC	2	6	229031	229036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591462
6071	NC_002929	GC	3	6	229051	229056	0 %	0 %	50 %	50 %	33591462
6072	NC_002929	ACC	2	6	229065	229070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591462
6073	NC_002929	GCCC	2	8	229127	229134	0 %	0 %	25 %	75 %	33591462
6074	NC_002929	TCA	2	6	229180	229185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591462
6075	NC_002929	CGC	3	9	229251	229259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6076	NC_002929	CCTT	2	8	229261	229268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6077	NC_002929	GTC	2	6	229369	229374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591463
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6079	NC_002929	CGT	2	6	229418	229423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591463
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6081	NC_002929	CCG	2	6	229535	229540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591463
6082	NC_002929	CGT	2	6	229569	229574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591463
6083	NC_002929	GGC	2	6	229611	229616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591463
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6085	NC_002929	CG	4	8	229667	229674	0 %	0 %	50 %	50 %	33591463
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6088	NC_002929	CGCA	2	8	229846	229853	25 %	0 %	25 %	50 %	33591463
6089	NC_002929	CAT	2	6	229857	229862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591463
6090	NC_002929	GC	4	8	229906	229913	0 %	0 %	50 %	50 %	33591463
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6093	NC_002929	CGG	2	6	229974	229979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591463
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6099	NC_002929	CG	3	6	230135	230140	0 %	0 %	50 %	50 %	33591464
6100	NC_002929	CGCC	2	8	230185	230192	0 %	0 %	25 %	75 %	33591464
6101	NC_002929	CGA	2	6	230198	230203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591464
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6104	NC_002929	CGCC	2	8	230273	230280	0 %	0 %	25 %	75 %	33591464
6105	NC_002929	CAG	2	6	230349	230354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591464
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6108	NC_002929	AGGGC	2	10	230555	230564	20 %	0 %	60 %	20 %	33591464
6109	NC_002929	GCG	2	6	230576	230581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591464
6110	NC_002929	GCG	2	6	230618	230623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591464
6111	NC_002929	CAG	2	6	230676	230681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591464
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6113	NC_002929	GC	3	6	230698	230703	0 %	0 %	50 %	50 %	33591464
6114	NC_002929	GGC	3	9	230715	230723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591464
6115	NC_002929	CG	3	6	230783	230788	0 %	0 %	50 %	50 %	33591464
6116	NC_002929	CG	3	6	230881	230886	0 %	0 %	50 %	50 %	33591464
6117	NC_002929	GCCG	3	12	230913	230924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6118	NC_002929	CGC	2	6	230925	230930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6119	NC_002929	ACC	2	6	230955	230960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6120	NC_002929	TTC	2	6	230972	230977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_002929	AGA	2	6	230978	230983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_002929	GTT	2	6	230987	230992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_002929	CGA	2	6	231028	231033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_002929	GGC	2	6	231111	231116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591465
6125	NC_002929	CCG	2	6	231124	231129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591465
6126	NC_002929	TCA	3	9	231184	231192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591465
6127	NC_002929	ACA	2	6	231193	231198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33591465
6128	NC_002929	CAC	2	6	231212	231217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591465
6129	NC_002929	GCT	2	6	231230	231235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591465
6130	NC_002929	CGGG	2	8	231242	231249	0 %	0 %	75 %	25 %	33591465
6131	NC_002929	ATC	2	6	231258	231263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591465
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6133	NC_002929	CTT	2	6	231395	231400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33591465
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6138	NC_002929	GCGCG	2	10	231586	231595	0 %	0 %	60 %	40 %	33591465
6139	NC_002929	CGTGGC	2	12	231596	231607	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	33591465
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6159	NC_002929	CCG	2	6	232104	232109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591466
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6161	NC_002929	ATG	2	6	232157	232162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33591466
6162	NC_002929	CG	3	6	232239	232244	0 %	0 %	50 %	50 %	33591466
6163	NC_002929	GGCC	2	8	232276	232283	0 %	0 %	50 %	50 %	33591466
6164	NC_002929	GACC	2	8	232294	232301	25 %	0 %	25 %	50 %	33591466
6165	NC_002929	CG	3	6	232317	232322	0 %	0 %	50 %	50 %	33591466
6166	NC_002929	CGGC	2	8	232385	232392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6167	NC_002929	GCC	2	6	232458	232463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591467
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6182	NC_002929	CCG	3	9	232911	232919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591468
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6201	NC_002929	CGC	2	6	233532	233537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591469
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6498	NC_002929	GC	3	6	243867	243872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6500	NC_002929	GGA	2	6	243893	243898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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