MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 113957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_002929	CCGG	2	8	207680	207687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5502	NC_002929	G	7	7	207704	207710	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_002929	GC	3	6	207788	207793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5504	NC_002929	GC	4	8	207798	207805	0 %	0 %	50 %	50 %	33591448
5505	NC_002929	TCT	2	6	207868	207873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33591448
5506	NC_002929	CAG	2	6	207881	207886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591448
5507	NC_002929	TGCGC	2	10	207922	207931	0 %	20 %	40 %	40 %	33591448
5508	NC_002929	TCG	3	9	207954	207962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591448
5509	NC_002929	GCA	2	6	207973	207978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591448
5510	NC_002929	CG	3	6	207987	207992	0 %	0 %	50 %	50 %	33591448
5511	NC_002929	CCA	2	6	208039	208044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591448
5512	NC_002929	GCC	2	6	208086	208091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591448
5513	NC_002929	GC	3	6	208104	208109	0 %	0 %	50 %	50 %	33591448
5514	NC_002929	TGG	2	6	208152	208157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591448
5515	NC_002929	CAG	3	9	208190	208198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591448
5516	NC_002929	TTG	2	6	208203	208208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33591448
5517	NC_002929	GCTG	2	8	208228	208235	0 %	25 %	50 %	25 %	33591448
5518	NC_002929	ACG	2	6	208255	208260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591448
5519	NC_002929	CAG	2	6	208265	208270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591448
5520	NC_002929	AAT	2	6	208276	208281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33591448
5521	NC_002929	CTT	2	6	208310	208315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33591448
5522	NC_002929	CGC	2	6	208399	208404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591448
5523	NC_002929	GC	3	6	208474	208479	0 %	0 %	50 %	50 %	33591448
5524	NC_002929	CAG	2	6	208484	208489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591448
5525	NC_002929	CAG	2	6	208508	208513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591448
5526	NC_002929	CGA	2	6	208523	208528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591448
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5529	NC_002929	GAT	2	6	208577	208582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33591448
5530	NC_002929	CG	3	6	208588	208593	0 %	0 %	50 %	50 %	33591448
5531	NC_002929	GGCG	2	8	208618	208625	0 %	0 %	75 %	25 %	33591448
5532	NC_002929	CG	3	6	208629	208634	0 %	0 %	50 %	50 %	33591448
5533	NC_002929	CAC	2	6	208667	208672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591448
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5535	NC_002929	ACG	2	6	208680	208685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591448
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5539	NC_002929	ACA	2	6	208758	208763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33591448
5540	NC_002929	GGCG	2	8	208780	208787	0 %	0 %	75 %	25 %	33591448
5541	NC_002929	GCC	2	6	208797	208802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5542	NC_002929	CCAT	2	8	208814	208821	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5543	NC_002929	GCCG	3	12	208856	208867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5544	NC_002929	CGGC	2	8	208872	208879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5545	NC_002929	CGGC	2	8	208918	208925	0 %	0 %	50 %	50 %	33591449
5546	NC_002929	GCCG	2	8	208928	208935	0 %	0 %	50 %	50 %	33591449
5547	NC_002929	GC	3	6	208939	208944	0 %	0 %	50 %	50 %	33591449
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5553	NC_002929	TGC	2	6	209098	209103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591449
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5555	NC_002929	CGAC	2	8	209302	209309	25 %	0 %	25 %	50 %	33591449
5556	NC_002929	CTG	2	6	209321	209326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591449
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5559	NC_002929	TCT	2	6	209368	209373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33591449
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5563	NC_002929	AG	3	6	209476	209481	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_002929	A	6	6	209516	209521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_002929	GA	3	6	209647	209652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_002929	ATCC	2	8	209727	209734	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5567	NC_002929	CTT	2	6	209751	209756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_002929	GCC	2	6	209795	209800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591450
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5587	NC_002929	ATC	2	6	210626	210631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591450
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5593	NC_002929	ACG	2	6	210984	210989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591450
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5595	NC_002929	ACG	2	6	211056	211061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591450
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5599	NC_002929	ACGGC	2	10	211242	211251	20 %	0 %	40 %	40 %	33591450
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5601	NC_002929	CAT	2	6	211318	211323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591450
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5612	NC_002929	CG	3	6	211788	211793	0 %	0 %	50 %	50 %	33591451
5613	NC_002929	GCC	2	6	211816	211821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591451
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5625	NC_002929	CGA	2	6	212268	212273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591451
5626	NC_002929	CGT	2	6	212385	212390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591451
5627	NC_002929	CAC	2	6	212395	212400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591451
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5630	NC_002929	CGG	2	6	212468	212473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591451
5631	NC_002929	GTC	2	6	212518	212523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591451
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5634	NC_002929	CGGC	2	8	212640	212647	0 %	0 %	50 %	50 %	33591451
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5640	NC_002929	CTT	2	6	212892	212897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33591451
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5652	NC_002929	GCC	3	9	213236	213244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5653	NC_002929	GCGG	2	8	213250	213257	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5654	NC_002929	CG	3	6	213260	213265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5655	NC_002929	CAG	2	6	213272	213277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591452
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5658	NC_002929	TGC	2	6	213409	213414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591452
5659	NC_002929	GCA	2	6	213424	213429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591452
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5722	NC_002929	CGC	3	9	215461	215469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5725	NC_002929	CCGG	2	8	215604	215611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5740	NC_002929	CCGG	2	8	216653	216660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5748	NC_002929	CTTCGT	2	12	217161	217172	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	33591455
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5996	NC_002929	GC	3	6	226278	226283	0 %	0 %	50 %	50 %	33591460
5997	NC_002929	GC	3	6	226291	226296	0 %	0 %	50 %	50 %	33591460
5998	NC_002929	GCTGGG	2	12	226318	226329	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	33591460
5999	NC_002929	CCGC	2	8	226598	226605	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6000	NC_002929	GC	3	6	226634	226639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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