MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 113957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_002929	CCA	2	6	189282	189287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591433
5003	NC_002929	GC	3	6	189316	189321	0 %	0 %	50 %	50 %	33591433
5004	NC_002929	GCC	2	6	189350	189355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591433
5005	NC_002929	CAG	2	6	189376	189381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591433
5006	NC_002929	CGG	2	6	189393	189398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591433
5007	NC_002929	CGCC	2	8	189399	189406	0 %	0 %	25 %	75 %	33591433
5008	NC_002929	CGC	2	6	189481	189486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591433
5009	NC_002929	GC	3	6	189557	189562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5010	NC_002929	GCGG	2	8	189568	189575	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5011	NC_002929	CAG	2	6	189593	189598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_002929	GCC	2	6	189602	189607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5013	NC_002929	GCG	2	6	189672	189677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_002929	CAG	2	6	189698	189703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_002929	GCC	2	6	189729	189734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5016	NC_002929	CAG	2	6	189740	189745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_002929	GC	3	6	189761	189766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5018	NC_002929	GCC	2	6	189770	189775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5019	NC_002929	GCG	2	6	189776	189781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_002929	GTT	2	6	189826	189831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_002929	TG	3	6	189836	189841	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_002929	CG	3	6	189844	189849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5023	NC_002929	CGC	2	6	189853	189858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5024	NC_002929	CAG	2	6	189893	189898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_002929	CG	3	6	189910	189915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5026	NC_002929	GGCG	2	8	189922	189929	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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5028	NC_002929	GGC	2	6	190001	190006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5031	NC_002929	GGC	2	6	190103	190108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_002929	GCA	2	6	190201	190206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591434
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5039	NC_002929	ACT	2	6	190299	190304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591434
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5042	NC_002929	GCG	2	6	190417	190422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591434
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5044	NC_002929	CGA	2	6	190450	190455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591434
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5046	NC_002929	GC	3	6	190598	190603	0 %	0 %	50 %	50 %	33591434
5047	NC_002929	CAT	2	6	190612	190617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591434
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5049	NC_002929	GC	3	6	190629	190634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5050	NC_002929	CGG	2	6	190635	190640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_002929	TCG	2	6	190688	190693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_002929	T	6	6	190704	190709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_002929	GCCC	2	8	190759	190766	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5054	NC_002929	TCA	2	6	190801	190806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591435
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5057	NC_002929	CAG	2	6	190932	190937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591435
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5059	NC_002929	GAG	2	6	190977	190982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33591435
5060	NC_002929	GGCG	2	8	191009	191016	0 %	0 %	75 %	25 %	33591435
5061	NC_002929	GC	3	6	191181	191186	0 %	0 %	50 %	50 %	33591435
5062	NC_002929	CAT	2	6	191189	191194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591435
5063	NC_002929	GC	3	6	191202	191207	0 %	0 %	50 %	50 %	33591435
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5074	NC_002929	CTT	2	6	191480	191485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33591435
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5110	NC_002929	GC	3	6	192705	192710	0 %	0 %	50 %	50 %	33591435
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5118	NC_002929	CGGCG	2	10	193088	193097	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5119	NC_002929	GCC	2	6	193155	193160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591436
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5122	NC_002929	GATC	2	8	193211	193218	25 %	25 %	25 %	25 %	33591436
5123	NC_002929	GCC	2	6	193221	193226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591436
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5126	NC_002929	GCC	2	6	193378	193383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591436
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5252	NC_002929	CTA	2	6	197713	197718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591440
5253	NC_002929	GTG	2	6	197741	197746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591440
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5361	NC_002929	C	6	6	201919	201924	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5362	NC_002929	CGTG	2	8	201963	201970	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5367	NC_002929	CG	3	6	202240	202245	0 %	0 %	50 %	50 %	33591443
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5372	NC_002929	GCG	2	6	202391	202396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591443
5373	NC_002929	ATC	2	6	202436	202441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591443
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5462	NC_002929	CGC	2	6	205383	205388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5463	NC_002929	CGG	3	9	205407	205415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5485	NC_002929	AGCT	2	8	206727	206734	25 %	25 %	25 %	25 %	33591447
5486	NC_002929	GC	3	6	206787	206792	0 %	0 %	50 %	50 %	33591447
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5497	NC_002929	GCTG	2	8	207377	207384	0 %	25 %	50 %	25 %	33591447
5498	NC_002929	GC	3	6	207407	207412	0 %	0 %	50 %	50 %	33591447
5499	NC_002929	GCG	2	6	207428	207433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591447
5500	NC_002929	CA	3	6	207596	207601	50 %	0 %	0 %	50 %	33591447

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