MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bordetella parapertussis 12822 chromosome

Total Repeats: 14664

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002928	GGGC	2	8	517	524	0 %	0 %	75 %	25 %	33594724
2	NC_002928	GACG	2	8	616	623	25 %	0 %	50 %	25 %	33594724
3	NC_002928	CGCA	2	8	751	758	25 %	0 %	25 %	50 %	33594724
4	NC_002928	CATC	2	8	836	843	25 %	25 %	0 %	50 %	33594724
5	NC_002928	GCCT	2	8	947	954	0 %	25 %	25 %	50 %	33594724
6	NC_002928	GCTG	2	8	1602	1609	0 %	25 %	50 %	25 %	33594724
7	NC_002928	GCAA	2	8	1904	1911	50 %	0 %	25 %	25 %	33594724
8	NC_002928	GCCG	2	8	1988	1995	0 %	0 %	50 %	50 %	33594725
9	NC_002928	GTCG	2	8	2120	2127	0 %	25 %	50 %	25 %	33594725
10	NC_002928	GGCC	2	8	2423	2430	0 %	0 %	50 %	50 %	33594725
11	NC_002928	CCGC	2	8	2631	2638	0 %	0 %	25 %	75 %	33594726
12	NC_002928	GCCC	2	8	3006	3013	0 %	0 %	25 %	75 %	33594726
13	NC_002928	GCTG	2	8	3040	3047	0 %	25 %	50 %	25 %	33594726
14	NC_002928	TGCT	2	8	3420	3427	0 %	50 %	25 %	25 %	33594727
15	NC_002928	GCCA	2	8	4076	4083	25 %	0 %	25 %	50 %	33594727
16	NC_002928	CCTG	2	8	4382	4389	0 %	25 %	25 %	50 %	33594728
17	NC_002928	GTGC	2	8	4500	4507	0 %	25 %	50 %	25 %	33594728
18	NC_002928	GGCC	2	8	4577	4584	0 %	0 %	50 %	50 %	33594728
19	NC_002928	GGCG	2	8	4829	4836	0 %	0 %	75 %	25 %	33594728
20	NC_002928	GGCC	2	8	5310	5317	0 %	0 %	50 %	50 %	33594729
21	NC_002928	CGAC	2	8	5426	5433	25 %	0 %	25 %	50 %	33594729
22	NC_002928	CGGC	2	8	5742	5749	0 %	0 %	50 %	50 %	33594729
23	NC_002928	GGCG	2	8	7582	7589	0 %	0 %	75 %	25 %	33594730
24	NC_002928	TATG	2	8	8025	8032	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002928	TTGC	2	8	8361	8368	0 %	50 %	25 %	25 %	33594731
26	NC_002928	AAGG	2	8	8982	8989	50 %	0 %	50 %	0 %	33594732
27	NC_002928	CCCG	2	8	9401	9408	0 %	0 %	25 %	75 %	33594733
28	NC_002928	CCTA	2	8	11807	11814	25 %	25 %	0 %	50 %	33594737
29	NC_002928	TCGT	2	8	12121	12128	0 %	50 %	25 %	25 %	33594737
30	NC_002928	CCGC	2	8	12844	12851	0 %	0 %	25 %	75 %	33594737
31	NC_002928	GTCG	2	8	13707	13714	0 %	25 %	50 %	25 %	33594737
32	NC_002928	TCGC	2	8	14240	14247	0 %	25 %	25 %	50 %	33594737
33	NC_002928	GGCC	2	8	14961	14968	0 %	0 %	50 %	50 %	33594737
34	NC_002928	TCGC	2	8	15780	15787	0 %	25 %	25 %	50 %	33594737
35	NC_002928	CAAG	2	8	15842	15849	50 %	0 %	25 %	25 %	33594738
36	NC_002928	ATGG	2	8	16523	16530	25 %	25 %	50 %	0 %	33594738
37	NC_002928	AAGG	2	8	17766	17773	50 %	0 %	50 %	0 %	33594738
38	NC_002928	ATCG	2	8	18581	18588	25 %	25 %	25 %	25 %	33594738
39	NC_002928	GGTG	2	8	19124	19131	0 %	25 %	75 %	0 %	33594738
40	NC_002928	ACTG	2	8	20070	20077	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_002928	CCTG	2	8	21138	21145	0 %	25 %	25 %	50 %	33594740
42	NC_002928	CGGC	2	8	21651	21658	0 %	0 %	50 %	50 %	33594740
43	NC_002928	GCCC	2	8	21907	21914	0 %	0 %	25 %	75 %	33594740
44	NC_002928	CACG	2	8	22025	22032	25 %	0 %	25 %	50 %	33594740
45	NC_002928	TTCG	2	8	22209	22216	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_002928	CACG	2	8	22322	22329	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_002928	CGGA	2	8	22352	22359	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_002928	GCCG	2	8	23063	23070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_002928	CGCC	2	8	23576	23583	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
50	NC_002928	GGCC	2	8	23709	23716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_002928	GCTG	2	8	24169	24176	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_002928	GCCG	2	8	24177	24184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_002928	GCCA	2	8	24302	24309	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_002928	CGGG	2	8	24314	24321	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55	NC_002928	CCGG	2	8	24548	24555	0 %	0 %	50 %	50 %	33594741
56	NC_002928	GACC	2	8	25283	25290	25 %	0 %	25 %	50 %	33594741
57	NC_002928	TGCT	2	8	25315	25322	0 %	50 %	25 %	25 %	33594741
58	NC_002928	GCCT	2	8	25915	25922	0 %	25 %	25 %	50 %	33594742
59	NC_002928	GCCG	2	8	26538	26545	0 %	0 %	50 %	50 %	33594743
60	NC_002928	TGAG	2	8	26701	26708	25 %	25 %	50 %	0 %	33594743
61	NC_002928	CTGC	2	8	26846	26853	0 %	25 %	25 %	50 %	33594743
62	NC_002928	GCCG	2	8	26882	26889	0 %	0 %	50 %	50 %	33594743
63	NC_002928	CGGC	2	8	27091	27098	0 %	0 %	50 %	50 %	33594743
64	NC_002928	GCTG	2	8	27131	27138	0 %	25 %	50 %	25 %	33594743
65	NC_002928	GGCC	2	8	27302	27309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_002928	CTGG	2	8	27377	27384	0 %	25 %	50 %	25 %	33594744
67	NC_002928	GTCG	2	8	27869	27876	0 %	25 %	50 %	25 %	33594744
68	NC_002928	GCCG	2	8	28213	28220	0 %	0 %	50 %	50 %	33594744
69	NC_002928	AGCG	2	8	28442	28449	25 %	0 %	50 %	25 %	33594745
70	NC_002928	AGCC	2	8	28790	28797	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_002928	ATCG	2	8	28894	28901	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_002928	AACG	2	8	28975	28982	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_002928	CTAC	2	8	30124	30131	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_002928	TGGA	2	8	30286	30293	25 %	25 %	50 %	0 %	33594748
75	NC_002928	GCCA	2	8	30718	30725	25 %	0 %	25 %	50 %	33594748
76	NC_002928	AAGA	2	8	31192	31199	75 %	0 %	25 %	0 %	33594748
77	NC_002928	ATGC	2	8	31222	31229	25 %	25 %	25 %	25 %	33594748
78	NC_002928	CGAA	2	8	31880	31887	50 %	0 %	25 %	25 %	33594748
79	NC_002928	AAGG	2	8	31921	31928	50 %	0 %	50 %	0 %	33594748
80	NC_002928	AAGT	2	8	32230	32237	50 %	25 %	25 %	0 %	33594748
81	NC_002928	GGCG	2	8	33127	33134	0 %	0 %	75 %	25 %	33594749
82	NC_002928	GATC	2	8	33616	33623	25 %	25 %	25 %	25 %	33594750
83	NC_002928	GTAA	2	8	34915	34922	50 %	25 %	25 %	0 %	161610405
84	NC_002928	GCTG	2	8	35330	35337	0 %	25 %	50 %	25 %	33594752
85	NC_002928	CGGC	2	8	36303	36310	0 %	0 %	50 %	50 %	33594754
86	NC_002928	CGAT	2	8	36513	36520	25 %	25 %	25 %	25 %	33594754
87	NC_002928	GGTC	2	8	36871	36878	0 %	25 %	50 %	25 %	33594755
88	NC_002928	GTCG	2	8	37445	37452	0 %	25 %	50 %	25 %	33594757
89	NC_002928	GCAC	2	8	38156	38163	25 %	0 %	25 %	50 %	33594758
90	NC_002928	TTCG	2	8	38166	38173	0 %	50 %	25 %	25 %	33594758
91	NC_002928	GCCG	2	8	38316	38323	0 %	0 %	50 %	50 %	33594758
92	NC_002928	CCAG	2	8	38631	38638	25 %	0 %	25 %	50 %	33594759
93	NC_002928	CGTC	2	8	39436	39443	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_002928	GCCG	2	8	39790	39797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_002928	GCAG	2	8	39994	40001	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_002928	GGCC	2	8	40042	40049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_002928	TGAT	2	8	40224	40231	25 %	50 %	25 %	0 %	33594761
98	NC_002928	TTGC	2	8	40829	40836	0 %	50 %	25 %	25 %	33594761
99	NC_002928	TGCG	2	8	41466	41473	0 %	25 %	50 %	25 %	33594761
100	NC_002928	TTGG	2	8	42103	42110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_002928	CAGG	2	8	42182	42189	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_002928	CAGG	2	8	42199	42206	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_002928	TCGT	2	8	42319	42326	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_002928	GACA	2	8	43130	43137	50 %	0 %	25 %	25 %	33594764
105	NC_002928	GCTG	2	8	43733	43740	0 %	25 %	50 %	25 %	33594765
106	NC_002928	GCCG	2	8	44206	44213	0 %	0 %	50 %	50 %	33594766
107	NC_002928	CCCA	2	8	44786	44793	25 %	0 %	0 %	75 %	33594767
108	NC_002928	CAAG	2	8	44821	44828	50 %	0 %	25 %	25 %	33594767
109	NC_002928	GCCG	2	8	45658	45665	0 %	0 %	50 %	50 %	33594769
110	NC_002928	GCGT	2	8	46386	46393	0 %	25 %	50 %	25 %	33594771
111	NC_002928	CGGC	2	8	46458	46465	0 %	0 %	50 %	50 %	33594771
112	NC_002928	GCTT	2	8	46498	46505	0 %	50 %	25 %	25 %	33594771
113	NC_002928	CATC	2	8	46778	46785	25 %	25 %	0 %	50 %	33594772
114	NC_002928	AAGA	2	8	46831	46838	75 %	0 %	25 %	0 %	33594772
115	NC_002928	GGCC	2	8	46845	46852	0 %	0 %	50 %	50 %	33594772
116	NC_002928	TCCG	2	8	47573	47580	0 %	25 %	25 %	50 %	33594772
117	NC_002928	GCTG	2	8	47628	47635	0 %	25 %	50 %	25 %	33594772
118	NC_002928	TGCT	2	8	47659	47666	0 %	50 %	25 %	25 %	33594772
119	NC_002928	ACCG	2	8	48760	48767	25 %	0 %	25 %	50 %	33594776
120	NC_002928	CGCT	2	8	49134	49141	0 %	25 %	25 %	50 %	33594777
121	NC_002928	GTGG	2	8	49568	49575	0 %	25 %	75 %	0 %	33594777
122	NC_002928	CCGA	2	8	50056	50063	25 %	0 %	25 %	50 %	33594778
123	NC_002928	CGCA	2	8	50377	50384	25 %	0 %	25 %	50 %	33594778
124	NC_002928	GATC	2	8	50637	50644	25 %	25 %	25 %	25 %	33594778
125	NC_002928	GAAC	2	8	50751	50758	50 %	0 %	25 %	25 %	33594778
126	NC_002928	CACG	2	8	51128	51135	25 %	0 %	25 %	50 %	33594779
127	NC_002928	GGCA	2	8	51836	51843	25 %	0 %	50 %	25 %	33594780
128	NC_002928	GATG	2	8	51904	51911	25 %	25 %	50 %	0 %	33594780
129	NC_002928	CTGT	2	8	52236	52243	0 %	50 %	25 %	25 %	33594781
130	NC_002928	GCTG	2	8	52535	52542	0 %	25 %	50 %	25 %	33594782
131	NC_002928	CGCC	2	8	52575	52582	0 %	0 %	25 %	75 %	33594782
132	NC_002928	CCAG	2	8	52892	52899	25 %	0 %	25 %	50 %	33594782
133	NC_002928	CGGC	2	8	53090	53097	0 %	0 %	50 %	50 %	33594782
134	NC_002928	GTCG	2	8	53250	53257	0 %	25 %	50 %	25 %	33594782
135	NC_002928	GAGC	2	8	53424	53431	25 %	0 %	50 %	25 %	33594782
136	NC_002928	GGCG	2	8	53526	53533	0 %	0 %	75 %	25 %	33594782
137	NC_002928	TGGA	2	8	53668	53675	25 %	25 %	50 %	0 %	33594782
138	NC_002928	CGCA	2	8	54156	54163	25 %	0 %	25 %	50 %	33594782
139	NC_002928	GGCT	2	8	54746	54753	0 %	25 %	50 %	25 %	33594783
140	NC_002928	CTAC	2	8	55152	55159	25 %	25 %	0 %	50 %	33594783
141	NC_002928	CTGG	2	8	55399	55406	0 %	25 %	50 %	25 %	33594783
142	NC_002928	CGCC	2	8	55419	55426	0 %	0 %	25 %	75 %	33594783
143	NC_002928	CGGC	2	8	55451	55458	0 %	0 %	50 %	50 %	33594783
144	NC_002928	AGCC	2	8	55589	55596	25 %	0 %	25 %	50 %	33594784
145	NC_002928	CGAG	2	8	56295	56302	25 %	0 %	50 %	25 %	33594784
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265	NC_002928	GCCG	2	8	97629	97636	0 %	0 %	50 %	50 %	33594818
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279	NC_002928	CCTG	2	8	102061	102068	0 %	25 %	25 %	50 %	33594823
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