MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella parapertussis 12822 chromosome

Total Repeats: 137474

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_002928	ACTG	2	8	160464	160471	25 %	25 %	25 %	25 %	33594865
4002	NC_002928	TGC	2	6	160475	160480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594865
4003	NC_002928	GGACG	2	10	160493	160502	20 %	0 %	60 %	20 %	33594865
4004	NC_002928	CGC	2	6	160600	160605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594865
4005	NC_002928	CAGC	2	8	160648	160655	25 %	0 %	25 %	50 %	33594865
4006	NC_002928	CCAC	2	8	160665	160672	25 %	0 %	0 %	75 %	33594865
4007	NC_002928	GCG	2	6	160713	160718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594865
4008	NC_002928	CGTC	2	8	160731	160738	0 %	25 %	25 %	50 %	33594865
4009	NC_002928	CCA	2	6	160789	160794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33594865
4010	NC_002928	TCG	2	6	160934	160939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594865
4011	NC_002928	ATG	2	6	161032	161037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33594865
4012	NC_002928	GCG	2	6	161048	161053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594865
4013	NC_002928	AGC	2	6	161066	161071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594865
4014	NC_002928	GC	3	6	161070	161075	0 %	0 %	50 %	50 %	33594865
4015	NC_002928	CAG	2	6	161080	161085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594865
4016	NC_002928	CG	3	6	161111	161116	0 %	0 %	50 %	50 %	33594865
4017	NC_002928	CAG	2	6	161122	161127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594865
4018	NC_002928	CAG	2	6	161131	161136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594865
4019	NC_002928	GCG	2	6	161167	161172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594865
4020	NC_002928	TGT	2	6	161286	161291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33594865
4021	NC_002928	CGC	2	6	161298	161303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594865
4022	NC_002928	CGT	2	6	161349	161354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594865
4023	NC_002928	GGC	2	6	161365	161370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594865
4024	NC_002928	CGG	3	9	161423	161431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594865
4025	NC_002928	CAG	2	6	161470	161475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594865
4026	NC_002928	CAG	2	6	161530	161535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594865
4027	NC_002928	CCG	2	6	161538	161543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594865
4028	NC_002928	GCCA	2	8	161552	161559	25 %	0 %	25 %	50 %	33594865
4029	NC_002928	GCG	2	6	161630	161635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594865
4030	NC_002928	GC	3	6	161754	161759	0 %	0 %	50 %	50 %	33594866
4031	NC_002928	GAA	2	6	161783	161788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33594866
4032	NC_002928	CGT	2	6	161857	161862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594866
4033	NC_002928	CG	3	6	161871	161876	0 %	0 %	50 %	50 %	33594866
4034	NC_002928	CAG	2	6	162047	162052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594866
4035	NC_002928	T	6	6	162062	162067	0 %	100 %	0 %	0 %	33594866
4036	NC_002928	TTC	2	6	162104	162109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33594866
4037	NC_002928	GGC	2	6	162120	162125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594866
4038	NC_002928	CG	3	6	162131	162136	0 %	0 %	50 %	50 %	33594866
4039	NC_002928	AGC	2	6	162156	162161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594866
4040	NC_002928	CAG	2	6	162191	162196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594866
4041	NC_002928	CAG	2	6	162200	162205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594866
4042	NC_002928	CGC	2	6	162206	162211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594866
4043	NC_002928	CAG	2	6	162281	162286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594866
4044	NC_002928	AGA	2	6	162304	162309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33594866
4045	NC_002928	GTG	3	9	162321	162329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594866
4046	NC_002928	CG	4	8	162382	162389	0 %	0 %	50 %	50 %	33594866
4047	NC_002928	TAG	2	6	162390	162395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33594866
4048	NC_002928	GATG	2	8	162412	162419	25 %	25 %	50 %	0 %	33594866
4049	NC_002928	CAG	2	6	162440	162445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594866
4050	NC_002928	TCA	2	6	162457	162462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594866
4051	NC_002928	CAT	2	6	162520	162525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594867
4052	NC_002928	GCCC	2	8	162566	162573	0 %	0 %	25 %	75 %	33594867
4053	NC_002928	GGC	2	6	162574	162579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594867
4054	NC_002928	GC	3	6	162803	162808	0 %	0 %	50 %	50 %	33594867
4055	NC_002928	GGCCTG	2	12	162874	162885	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	33594867
4056	NC_002928	CG	3	6	162886	162891	0 %	0 %	50 %	50 %	33594867
4057	NC_002928	GCTG	3	12	162954	162965	0 %	25 %	50 %	25 %	33594867
4058	NC_002928	GCCT	2	8	162971	162978	0 %	25 %	25 %	50 %	33594867
4059	NC_002928	AGC	2	6	162980	162985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594867
4060	NC_002928	CGGC	2	8	163065	163072	0 %	0 %	50 %	50 %	33594867
4061	NC_002928	TCG	2	6	163106	163111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594867
4062	NC_002928	TGG	2	6	163179	163184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594867
4063	NC_002928	GCA	2	6	163218	163223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594867
4064	NC_002928	CAG	2	6	163282	163287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594867
4065	NC_002928	GCGCG	2	10	163304	163313	0 %	0 %	60 %	40 %	33594867
4066	NC_002928	AGGCG	2	10	163385	163394	20 %	0 %	60 %	20 %	33594867
4067	NC_002928	GC	3	6	163418	163423	0 %	0 %	50 %	50 %	33594867
4068	NC_002928	TCG	2	6	163451	163456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594867
4069	NC_002928	GA	3	6	163463	163468	50 %	0 %	50 %	0 %	33594867
4070	NC_002928	GCGT	2	8	163581	163588	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4071	NC_002928	ATC	2	6	163638	163643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_002928	GC	3	6	163658	163663	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4073	NC_002928	GC	3	6	163740	163745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4074	NC_002928	GCG	2	6	163783	163788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_002928	CAG	2	6	163843	163848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594868
4076	NC_002928	GAA	2	6	163926	163931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33594868
4077	NC_002928	TGC	2	6	164112	164117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594868
4078	NC_002928	TGC	2	6	164247	164252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594868
4079	NC_002928	CGC	2	6	164277	164282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594868
4080	NC_002928	GATGGC	2	12	164335	164346	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	33594868
4081	NC_002928	AGC	2	6	164357	164362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594868
4082	NC_002928	CAG	2	6	164374	164379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594868
4083	NC_002928	ACG	2	6	164396	164401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594868
4084	NC_002928	GCA	2	6	164426	164431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594869
4085	NC_002928	CGATG	2	10	164442	164451	20 %	20 %	40 %	20 %	33594869
4086	NC_002928	CATCGG	2	12	164462	164473	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	33594869
4087	NC_002928	GTC	2	6	164640	164645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594869
4088	NC_002928	GCG	2	6	164654	164659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594869
4089	NC_002928	GGAT	2	8	164665	164672	25 %	25 %	50 %	0 %	33594869
4090	NC_002928	TCG	4	12	164701	164712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594869
4091	NC_002928	CG	3	6	164721	164726	0 %	0 %	50 %	50 %	33594869
4092	NC_002928	G	6	6	164754	164759	0 %	0 %	100 %	0 %	33594869
4093	NC_002928	GC	3	6	164812	164817	0 %	0 %	50 %	50 %	33594869
4094	NC_002928	TGC	2	6	164830	164835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594869
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4096	NC_002928	TGT	2	6	164882	164887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33594869
4097	NC_002928	CGA	2	6	164903	164908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594869
4098	NC_002928	GTA	2	6	164913	164918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33594869
4099	NC_002928	CTT	2	6	164928	164933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33594869
4100	NC_002928	CG	3	6	165011	165016	0 %	0 %	50 %	50 %	33594869
4101	NC_002928	ACC	2	6	165019	165024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33594869
4102	NC_002928	TGG	2	6	165053	165058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594869
4103	NC_002928	AGG	2	6	165116	165121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33594869
4104	NC_002928	GCG	2	6	165136	165141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594869
4105	NC_002928	GCC	2	6	165207	165212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594869
4106	NC_002928	GCG	2	6	165242	165247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594869
4107	NC_002928	GGC	2	6	165264	165269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594869
4108	NC_002928	TG	3	6	165357	165362	0 %	50 %	50 %	0 %	33594869
4109	NC_002928	GGT	3	9	165363	165371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594869
4110	NC_002928	TCG	2	6	165379	165384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594869
4111	NC_002928	CGG	2	6	165425	165430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594869
4112	NC_002928	ACGGCC	2	12	165442	165453	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	33594869
4113	NC_002928	GGT	2	6	165513	165518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594869
4114	NC_002928	CAGC	2	8	165519	165526	25 %	0 %	25 %	50 %	33594869
4115	NC_002928	GGGCA	2	10	165576	165585	20 %	0 %	60 %	20 %	33594869
4116	NC_002928	GC	3	6	165633	165638	0 %	0 %	50 %	50 %	33594869
4117	NC_002928	CGG	2	6	165642	165647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594869
4118	NC_002928	GC	3	6	165681	165686	0 %	0 %	50 %	50 %	33594870
4119	NC_002928	TGC	2	6	165720	165725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594870
4120	NC_002928	GGCG	2	8	165745	165752	0 %	0 %	75 %	25 %	33594870
4121	NC_002928	CGG	3	9	165793	165801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594870
4122	NC_002928	GC	3	6	165807	165812	0 %	0 %	50 %	50 %	33594870
4123	NC_002928	GGC	2	6	165836	165841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594870
4124	NC_002928	CCG	2	6	165850	165855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594870
4125	NC_002928	CGC	2	6	165865	165870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594870
4126	NC_002928	TCGA	2	8	165903	165910	25 %	25 %	25 %	25 %	33594870
4127	NC_002928	TTG	2	6	165951	165956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33594870
4128	NC_002928	CGG	2	6	166036	166041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594870
4129	NC_002928	GGCC	2	8	166087	166094	0 %	0 %	50 %	50 %	33594870
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4132	NC_002928	GC	3	6	166264	166269	0 %	0 %	50 %	50 %	33594870
4133	NC_002928	CCG	2	6	166349	166354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594870
4134	NC_002928	AGGGC	2	10	166381	166390	20 %	0 %	60 %	20 %	33594870
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4140	NC_002928	CGT	2	6	166579	166584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594870
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4144	NC_002928	GCA	2	6	166669	166674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594870
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4148	NC_002928	GCCG	2	8	166762	166769	0 %	0 %	50 %	50 %	33594870
4149	NC_002928	CCTG	2	8	166770	166777	0 %	25 %	25 %	50 %	33594870
4150	NC_002928	G	6	6	166777	166782	0 %	0 %	100 %	0 %	33594870
4151	NC_002928	CG	3	6	166783	166788	0 %	0 %	50 %	50 %	33594870
4152	NC_002928	GCC	2	6	166812	166817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594870
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4155	NC_002928	TAC	2	6	166939	166944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4156	NC_002928	GGC	2	6	166957	166962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594871
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4158	NC_002928	CGG	2	6	167074	167079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594871
4159	NC_002928	TCG	2	6	167126	167131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594871
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4188	NC_002928	GGC	2	6	167968	167973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4189	NC_002928	GAC	2	6	167977	167982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4190	NC_002928	TGA	2	6	167991	167996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4191	NC_002928	TCT	2	6	168027	168032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4192	NC_002928	CGA	2	6	168073	168078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594872
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4200	NC_002928	GC	4	8	168377	168384	0 %	0 %	50 %	50 %	33594872
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4204	NC_002928	TCG	3	9	168546	168554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594872
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4242	NC_002928	CAGCG	2	10	170097	170106	20 %	0 %	40 %	40 %	33594874
4243	NC_002928	GCG	2	6	170135	170140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594874
4244	NC_002928	CCAG	2	8	170185	170192	25 %	0 %	25 %	50 %	33594874
4245	NC_002928	CAG	2	6	170195	170200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594874
4246	NC_002928	TGGC	2	8	170211	170218	0 %	25 %	50 %	25 %	33594874
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4500	NC_002928	TGGCCA	2	12	178845	178856	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	33594881

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