MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella parapertussis 12822 chromosome

Total Repeats: 137474

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_002928	TCCG	2	8	135323	135330	0 %	25 %	25 %	50 %	33594847
3502	NC_002928	AT	3	6	135333	135338	50 %	50 %	0 %	0 %	33594847
3503	NC_002928	GC	3	6	135350	135355	0 %	0 %	50 %	50 %	33594847
3504	NC_002928	ATG	2	6	135398	135403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33594847
3505	NC_002928	GAT	2	6	135477	135482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33594847
3506	NC_002928	ACG	2	6	135515	135520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594847
3507	NC_002928	TGC	2	6	135534	135539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594847
3508	NC_002928	GCT	2	6	135540	135545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594847
3509	NC_002928	ATG	2	6	135590	135595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33594847
3510	NC_002928	GAC	2	6	135628	135633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594847
3511	NC_002928	TCG	2	6	135653	135658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594847
3512	NC_002928	GGC	2	6	135753	135758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594847
3513	NC_002928	CTTG	2	8	135759	135766	0 %	50 %	25 %	25 %	33594847
3514	NC_002928	GAA	2	6	135810	135815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33594847
3515	NC_002928	GCC	2	6	135818	135823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594847
3516	NC_002928	CGG	2	6	135827	135832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594847
3517	NC_002928	GC	3	6	135888	135893	0 %	0 %	50 %	50 %	33594847
3518	NC_002928	GGA	2	6	135910	135915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33594847
3519	NC_002928	GCGG	2	8	135931	135938	0 %	0 %	75 %	25 %	33594847
3520	NC_002928	GCG	2	6	135990	135995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594847
3521	NC_002928	TG	3	6	136001	136006	0 %	50 %	50 %	0 %	33594847
3522	NC_002928	CTGG	2	8	136008	136015	0 %	25 %	50 %	25 %	33594847
3523	NC_002928	AGG	2	6	136016	136021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33594847
3524	NC_002928	GC	3	6	136041	136046	0 %	0 %	50 %	50 %	33594848
3525	NC_002928	CTT	2	6	136070	136075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33594848
3526	NC_002928	TGC	2	6	136123	136128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594848
3527	NC_002928	GAT	3	9	136181	136189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33594848
3528	NC_002928	GCA	2	6	136332	136337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594848
3529	NC_002928	AG	3	6	136344	136349	50 %	0 %	50 %	0 %	33594848
3530	NC_002928	ATGA	2	8	136377	136384	50 %	25 %	25 %	0 %	33594848
3531	NC_002928	AGT	2	6	136452	136457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33594848
3532	NC_002928	TTGA	2	8	136509	136516	25 %	50 %	25 %	0 %	33594848
3533	NC_002928	CGTT	2	8	136538	136545	0 %	50 %	25 %	25 %	33594848
3534	NC_002928	TG	3	6	136549	136554	0 %	50 %	50 %	0 %	33594848
3535	NC_002928	ATG	2	6	136654	136659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33594848
3536	NC_002928	CGT	2	6	136710	136715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594848
3537	NC_002928	ATT	2	6	136727	136732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33594848
3538	NC_002928	GTGCT	2	10	136748	136757	0 %	40 %	40 %	20 %	33594849
3539	NC_002928	AAG	2	6	136795	136800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33594849
3540	NC_002928	GGCTG	2	10	136934	136943	0 %	20 %	60 %	20 %	33594849
3541	NC_002928	GAA	2	6	137029	137034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33594849
3542	NC_002928	AGC	2	6	137045	137050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594849
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3544	NC_002928	AAG	2	6	137197	137202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33594849
3545	NC_002928	GAC	2	6	137244	137249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594849
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3547	NC_002928	GT	3	6	137275	137280	0 %	50 %	50 %	0 %	33594849
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3549	NC_002928	GAT	2	6	137407	137412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33594849
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3552	NC_002928	AAGA	2	8	137494	137501	75 %	0 %	25 %	0 %	33594849
3553	NC_002928	CACG	2	8	137586	137593	25 %	0 %	25 %	50 %	33594849
3554	NC_002928	GATC	2	8	137607	137614	25 %	25 %	25 %	25 %	33594849
3555	NC_002928	CGTT	2	8	137676	137683	0 %	50 %	25 %	25 %	33594849
3556	NC_002928	TCTT	2	8	137705	137712	0 %	75 %	0 %	25 %	33594849
3557	NC_002928	TGT	2	6	137717	137722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33594849
3558	NC_002928	T	7	7	137730	137736	0 %	100 %	0 %	0 %	33594849
3559	NC_002928	GC	3	6	137814	137819	0 %	0 %	50 %	50 %	33594849
3560	NC_002928	GTC	2	6	137851	137856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594849
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3562	NC_002928	CCG	2	6	138003	138008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594849
3563	NC_002928	GTT	2	6	138009	138014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33594849
3564	NC_002928	ACG	2	6	138029	138034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594849
3565	NC_002928	TGC	2	6	138179	138184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594850
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3571	NC_002928	CGA	2	6	138572	138577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594850
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3573	NC_002928	CAG	2	6	138702	138707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594850
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3577	NC_002928	GGCG	2	8	138845	138852	0 %	0 %	75 %	25 %	33594850
3578	NC_002928	GTATCG	2	12	138931	138942	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	33594850
3579	NC_002928	TGC	2	6	138955	138960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594850
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3585	NC_002928	CGG	2	6	139454	139459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594851
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3590	NC_002928	ATGG	2	8	139894	139901	25 %	25 %	50 %	0 %	33594851
3591	NC_002928	GCT	2	6	139962	139967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594851
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3594	NC_002928	GGAC	2	8	140163	140170	25 %	0 %	50 %	25 %	33594851
3595	NC_002928	GTC	2	6	140173	140178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594851
3596	NC_002928	AGGC	2	8	140213	140220	25 %	0 %	50 %	25 %	33594851
3597	NC_002928	GC	3	6	140224	140229	0 %	0 %	50 %	50 %	33594851
3598	NC_002928	CGC	2	6	140286	140291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594851
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3602	NC_002928	ACA	2	6	140614	140619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33594852
3603	NC_002928	CGT	2	6	140700	140705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594852
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3606	NC_002928	TCT	2	6	140999	141004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33594852
3607	NC_002928	ATG	2	6	141016	141021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33594852
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3609	NC_002928	ATC	2	6	141064	141069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594852
3610	NC_002928	TCA	2	6	141096	141101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594852
3611	NC_002928	TCTGG	2	10	141246	141255	0 %	40 %	40 %	20 %	33594853
3612	NC_002928	TCA	2	6	141274	141279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594853
3613	NC_002928	GGA	2	6	141302	141307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33594853
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3616	NC_002928	CTGG	2	8	141515	141522	0 %	25 %	50 %	25 %	33594853
3617	NC_002928	CG	3	6	141582	141587	0 %	0 %	50 %	50 %	33594853
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3621	NC_002928	T	6	6	141913	141918	0 %	100 %	0 %	0 %	33594853
3622	NC_002928	GCG	2	6	141919	141924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594853
3623	NC_002928	CCG	2	6	141925	141930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594853
3624	NC_002928	TGGC	2	8	142033	142040	0 %	25 %	50 %	25 %	33594853
3625	NC_002928	CGTCG	2	10	142072	142081	0 %	20 %	40 %	40 %	33594853
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3657	NC_002928	GGA	2	6	143856	143861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3658	NC_002928	TGC	2	6	143888	143893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594854
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3733	NC_002928	GC	3	6	148370	148375	0 %	0 %	50 %	50 %	33594855
3734	NC_002928	ATG	2	6	148415	148420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33594855
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3995	NC_002928	CAG	2	6	160240	160245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594864
3996	NC_002928	GGTC	2	8	160263	160270	0 %	25 %	50 %	25 %	33594864
3997	NC_002928	GAA	2	6	160273	160278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33594864
3998	NC_002928	CAG	2	6	160318	160323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594864
3999	NC_002928	CGA	2	6	160377	160382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594864
4000	NC_002928	GACG	2	8	160420	160427	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

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