MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella parapertussis 12822 chromosome

Total Repeats: 137474

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_002928	CGG	2	6	40726	40731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594761
1002	NC_002928	TCG	2	6	40749	40754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594761
1003	NC_002928	GCC	2	6	40775	40780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594761
1004	NC_002928	GC	3	6	40807	40812	0 %	0 %	50 %	50 %	33594761
1005	NC_002928	GGC	2	6	40820	40825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594761
1006	NC_002928	TTGC	2	8	40829	40836	0 %	50 %	25 %	25 %	33594761
1007	NC_002928	CAC	2	6	41015	41020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33594761
1008	NC_002928	GCG	3	9	41040	41048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594761
1009	NC_002928	CAC	2	6	41120	41125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33594761
1010	NC_002928	GCG	2	6	41149	41154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594761
1011	NC_002928	GCG	2	6	41174	41179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594761
1012	NC_002928	TTC	2	6	41183	41188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33594761
1013	NC_002928	CG	3	6	41296	41301	0 %	0 %	50 %	50 %	33594761
1014	NC_002928	CG	3	6	41330	41335	0 %	0 %	50 %	50 %	33594761
1015	NC_002928	GCG	2	6	41379	41384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594761
1016	NC_002928	GAC	2	6	41456	41461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594761
1017	NC_002928	TGCG	2	8	41466	41473	0 %	25 %	50 %	25 %	33594761
1018	NC_002928	GTG	3	9	41558	41566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_002928	T	6	6	41567	41572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_002928	TCG	2	6	41594	41599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_002928	G	9	9	41601	41609	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_002928	ATG	2	6	41637	41642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_002928	GC	4	8	41646	41653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_002928	TTCGTG	2	12	41726	41737	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1025	NC_002928	CTG	2	6	41795	41800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_002928	TGC	2	6	41888	41893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_002928	GCC	2	6	41972	41977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_002928	TTG	2	6	42080	42085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_002928	TTGG	2	8	42103	42110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_002928	AAACG	2	10	42137	42146	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1031	NC_002928	CAGG	2	8	42182	42189	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1032	NC_002928	CAGG	2	8	42199	42206	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_002928	CGG	2	6	42265	42270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_002928	TCGT	2	8	42319	42326	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1035	NC_002928	CAG	2	6	42330	42335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_002928	ACA	2	6	42459	42464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33594762
1037	NC_002928	CAT	2	6	42535	42540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594762
1038	NC_002928	CG	3	6	42567	42572	0 %	0 %	50 %	50 %	33594762
1039	NC_002928	TGG	2	6	42606	42611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594762
1040	NC_002928	GCC	2	6	42671	42676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594762
1041	NC_002928	AAC	2	6	42807	42812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33594763
1042	NC_002928	CGA	2	6	42824	42829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594763
1043	NC_002928	AAG	2	6	42855	42860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33594763
1044	NC_002928	CGT	2	6	42920	42925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594763
1045	NC_002928	GAA	2	6	42926	42931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33594763
1046	NC_002928	CAA	2	6	42956	42961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33594763
1047	NC_002928	GGC	2	6	42966	42971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594763
1048	NC_002928	TCG	2	6	42973	42978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594763
1049	NC_002928	GTTCC	2	10	43085	43094	0 %	40 %	20 %	40 %	33594763
1050	NC_002928	GACA	2	8	43130	43137	50 %	0 %	25 %	25 %	33594764
1051	NC_002928	AAG	2	6	43275	43280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33594764
1052	NC_002928	GTG	2	6	43332	43337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594764
1053	NC_002928	CG	3	6	43462	43467	0 %	0 %	50 %	50 %	33594764
1054	NC_002928	ACA	2	6	43519	43524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33594764
1055	NC_002928	ATC	2	6	43542	43547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594764
1056	NC_002928	CAC	3	9	43604	43612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33594764
1057	NC_002928	GAC	2	6	43623	43628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594764
1058	NC_002928	TGA	2	6	43682	43687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_002928	TCA	2	6	43705	43710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594765
1060	NC_002928	GC	3	6	43724	43729	0 %	0 %	50 %	50 %	33594765
1061	NC_002928	GCTG	2	8	43733	43740	0 %	25 %	50 %	25 %	33594765
1062	NC_002928	GCC	2	6	43749	43754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594765
1063	NC_002928	GC	3	6	43757	43762	0 %	0 %	50 %	50 %	33594765
1064	NC_002928	ATC	2	6	43776	43781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594765
1065	NC_002928	GAC	2	6	43782	43787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594765
1066	NC_002928	CGA	2	6	43799	43804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594765
1067	NC_002928	GTC	2	6	43891	43896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594765
1068	NC_002928	CG	3	6	43897	43902	0 %	0 %	50 %	50 %	33594765
1069	NC_002928	ATGAGC	2	12	44005	44016	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33594766
1070	NC_002928	GCA	2	6	44055	44060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594766
1071	NC_002928	TAC	2	6	44200	44205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594766
1072	NC_002928	GCCG	2	8	44206	44213	0 %	0 %	50 %	50 %	33594766
1073	NC_002928	CG	3	6	44327	44332	0 %	0 %	50 %	50 %	33594766
1074	NC_002928	TGA	2	6	44336	44341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33594766
1075	NC_002928	GCG	2	6	44372	44377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594766
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1077	NC_002928	GC	3	6	44614	44619	0 %	0 %	50 %	50 %	33594767
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1081	NC_002928	CAAG	2	8	44821	44828	50 %	0 %	25 %	25 %	33594767
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1083	NC_002928	CGT	2	6	44914	44919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594767
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1086	NC_002928	CGT	2	6	44990	44995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594768
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1090	NC_002928	GCG	2	6	45153	45158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594768
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1095	NC_002928	CTA	2	6	45348	45353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594769
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1101	NC_002928	GGCGAT	2	12	45485	45496	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	33594769
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1108	NC_002928	GC	3	6	45700	45705	0 %	0 %	50 %	50 %	33594769
1109	NC_002928	CGG	2	6	45816	45821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594769
1110	NC_002928	TGC	2	6	45826	45831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594769
1111	NC_002928	GGCCTG	2	12	45950	45961	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	33594770
1112	NC_002928	CAG	2	6	45973	45978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594770
1113	NC_002928	GAT	2	6	46012	46017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33594770
1114	NC_002928	CGTCTC	2	12	46036	46047	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	33594770
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1116	NC_002928	GCA	2	6	46107	46112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594771
1117	NC_002928	CCG	2	6	46164	46169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594771
1118	NC_002928	GGC	2	6	46202	46207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594771
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1125	NC_002928	CGC	2	6	46471	46476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594771
1126	NC_002928	GCTT	2	8	46498	46505	0 %	50 %	25 %	25 %	33594771
1127	NC_002928	TGG	2	6	46604	46609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594772
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1257	NC_002928	GCTG	2	8	52535	52542	0 %	25 %	50 %	25 %	33594782
1258	NC_002928	GTT	2	6	52569	52574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33594782
1259	NC_002928	CGCC	2	8	52575	52582	0 %	0 %	25 %	75 %	33594782
1260	NC_002928	GCC	2	6	52588	52593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594782
1261	NC_002928	GAC	2	6	52603	52608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594782
1262	NC_002928	GCC	2	6	52614	52619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594782
1263	NC_002928	GCC	2	6	52642	52647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594782
1264	NC_002928	TAC	2	6	52696	52701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594782
1265	NC_002928	GGC	2	6	52761	52766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594782
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1267	NC_002928	CCG	2	6	52927	52932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594782
1268	NC_002928	CGG	2	6	52982	52987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594782
1269	NC_002928	CGC	2	6	53000	53005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594782
1270	NC_002928	GGC	3	9	53008	53016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594782
1271	NC_002928	CGG	4	12	53067	53078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594782
1272	NC_002928	CGGC	2	8	53090	53097	0 %	0 %	50 %	50 %	33594782
1273	NC_002928	CTG	3	9	53104	53112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594782
1274	NC_002928	TGC	2	6	53117	53122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594782
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1279	NC_002928	GCG	2	6	53291	53296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594782
1280	NC_002928	CTGGC	2	10	53297	53306	0 %	20 %	40 %	40 %	33594782
1281	NC_002928	CTG	2	6	53350	53355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594782
1282	NC_002928	CTGGCG	2	12	53362	53373	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	33594782
1283	NC_002928	CGG	2	6	53402	53407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594782
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1285	NC_002928	TCG	2	6	53498	53503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594782
1286	NC_002928	GCCGC	2	10	53515	53524	0 %	0 %	40 %	60 %	33594782
1287	NC_002928	GGCG	2	8	53526	53533	0 %	0 %	75 %	25 %	33594782
1288	NC_002928	GCG	2	6	53573	53578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594782
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1292	NC_002928	TGG	2	6	53719	53724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594782
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1294	NC_002928	GCTGG	2	10	53760	53769	0 %	20 %	60 %	20 %	33594782
1295	NC_002928	GGT	2	6	53781	53786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594782
1296	NC_002928	GC	3	6	53802	53807	0 %	0 %	50 %	50 %	33594782
1297	NC_002928	CGG	2	6	53822	53827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594782
1298	NC_002928	GC	3	6	53834	53839	0 %	0 %	50 %	50 %	33594782
1299	NC_002928	CTG	3	9	53866	53874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594782
1300	NC_002928	GCG	2	6	53912	53917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594782
1301	NC_002928	GGC	2	6	53949	53954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594782
1302	NC_002928	GC	5	10	53953	53962	0 %	0 %	50 %	50 %	33594782
1303	NC_002928	CGG	2	6	53963	53968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594782
1304	NC_002928	GCC	3	9	53980	53988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594782
1305	NC_002928	CGG	2	6	53993	53998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594782
1306	NC_002928	CGTGCG	2	12	54018	54029	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	33594782
1307	NC_002928	CGCA	2	8	54156	54163	25 %	0 %	25 %	50 %	33594782
1308	NC_002928	TGC	2	6	54173	54178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594782
1309	NC_002928	CAT	2	6	54258	54263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594782
1310	NC_002928	TTC	2	6	54265	54270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33594782
1311	NC_002928	CGG	2	6	54276	54281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594782
1312	NC_002928	CG	3	6	54321	54326	0 %	0 %	50 %	50 %	33594782
1313	NC_002928	GC	3	6	54368	54373	0 %	0 %	50 %	50 %	33594782
1314	NC_002928	GC	3	6	54421	54426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1315	NC_002928	CGG	2	6	54482	54487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594783
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1317	NC_002928	TGC	2	6	54573	54578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594783
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1320	NC_002928	GTG	2	6	54668	54673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594783
1321	NC_002928	CTG	2	6	54698	54703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594783
1322	NC_002928	GGCT	2	8	54746	54753	0 %	25 %	50 %	25 %	33594783
1323	NC_002928	GCT	2	6	54766	54771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594783
1324	NC_002928	GGT	2	6	54772	54777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594783
1325	NC_002928	CTG	2	6	54794	54799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594783
1326	NC_002928	GGT	2	6	54868	54873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594783
1327	NC_002928	GGC	2	6	54877	54882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594783
1328	NC_002928	T	6	6	54883	54888	0 %	100 %	0 %	0 %	33594783
1329	NC_002928	GCG	2	6	54926	54931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594783
1330	NC_002928	GCG	2	6	54942	54947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594783
1331	NC_002928	TGG	3	9	54954	54962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594783
1332	NC_002928	CGG	2	6	54964	54969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594783
1333	NC_002928	CGG	2	6	55039	55044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594783
1334	NC_002928	ATC	2	6	55049	55054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594783
1335	NC_002928	GCG	2	6	55136	55141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594783
1336	NC_002928	CTAC	2	8	55152	55159	25 %	25 %	0 %	50 %	33594783
1337	NC_002928	CGT	3	9	55164	55172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594783
1338	NC_002928	TGG	2	6	55197	55202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594783
1339	NC_002928	CTG	2	6	55241	55246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594783
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1342	NC_002928	GCC	2	6	55325	55330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594783
1343	NC_002928	CTGG	2	8	55399	55406	0 %	25 %	50 %	25 %	33594783
1344	NC_002928	CGCC	2	8	55419	55426	0 %	0 %	25 %	75 %	33594783
1345	NC_002928	CGG	3	9	55428	55436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594783
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1347	NC_002928	GCT	3	9	55479	55487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594784
1348	NC_002928	GCA	2	6	55488	55493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594784
1349	NC_002928	GGC	2	6	55498	55503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594784
1350	NC_002928	CAT	2	6	55567	55572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594784
1351	NC_002928	AGCC	2	8	55589	55596	25 %	0 %	25 %	50 %	33594784
1352	NC_002928	GGC	4	12	55600	55611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594784
1353	NC_002928	CGC	2	6	55629	55634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594784
1354	NC_002928	CAC	2	6	55684	55689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33594784
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1356	NC_002928	TCG	2	6	55769	55774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594784
1357	NC_002928	GCCGA	2	10	55829	55838	20 %	0 %	40 %	40 %	33594784
1358	NC_002928	ATG	2	6	55892	55897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33594784
1359	NC_002928	TGC	2	6	55910	55915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594784
1360	NC_002928	CAT	2	6	55957	55962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594784
1361	NC_002928	CGA	2	6	55974	55979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594784
1362	NC_002928	CGG	3	9	55989	55997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594784
1363	NC_002928	TGA	2	6	56016	56021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33594784
1364	NC_002928	CGG	2	6	56055	56060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594784
1365	NC_002928	CAC	2	6	56155	56160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33594784
1366	NC_002928	GCC	2	6	56186	56191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594784
1367	NC_002928	GCA	2	6	56283	56288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594784
1368	NC_002928	CGAG	2	8	56295	56302	25 %	0 %	50 %	25 %	33594784
1369	NC_002928	CAC	2	6	56308	56313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33594784
1370	NC_002928	CTG	2	6	56335	56340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594784
1371	NC_002928	TGCCTT	2	12	56343	56354	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	33594784
1372	NC_002928	GGC	2	6	56412	56417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594784
1373	NC_002928	TCG	2	6	56426	56431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594784
1374	NC_002928	GGC	2	6	56439	56444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594784
1375	NC_002928	GCG	2	6	56465	56470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594784
1376	NC_002928	GA	3	6	56504	56509	50 %	0 %	50 %	0 %	33594785
1377	NC_002928	GGC	2	6	56711	56716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594785
1378	NC_002928	CGC	2	6	56732	56737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594785
1379	NC_002928	GCC	2	6	56793	56798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594785
1380	NC_002928	CATAGC	2	12	56843	56854	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33594785
1381	NC_002928	CGA	2	6	57020	57025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594785
1382	NC_002928	GC	3	6	57038	57043	0 %	0 %	50 %	50 %	33594785
1383	NC_002928	GGC	2	6	57049	57054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594785
1384	NC_002928	AGG	2	6	57100	57105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33594785
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