MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella parapertussis 12822 chromosome

Total Repeats: 137474

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_002928	GC	5	10	509412	509421	0 %	0 %	50 %	50 %	33595183
14003	NC_002928	CCG	2	6	509456	509461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595183
14004	NC_002928	ACG	2	6	509476	509481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595183
14005	NC_002928	GGCC	2	8	509507	509514	0 %	0 %	50 %	50 %	33595183
14006	NC_002928	GGC	2	6	509536	509541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595183
14007	NC_002928	GCCA	2	8	509563	509570	25 %	0 %	25 %	50 %	33595183
14008	NC_002928	GCA	3	9	509624	509632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595183
14009	NC_002928	GCGG	2	8	509636	509643	0 %	0 %	75 %	25 %	33595183
14010	NC_002928	GC	4	8	509660	509667	0 %	0 %	50 %	50 %	33595183
14011	NC_002928	CG	3	6	509676	509681	0 %	0 %	50 %	50 %	33595183
14012	NC_002928	CAG	2	6	509736	509741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595183
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14014	NC_002928	CCG	2	6	509831	509836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595183
14015	NC_002928	GCC	2	6	509844	509849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595183
14016	NC_002928	GCG	2	6	509871	509876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595183
14017	NC_002928	ACC	2	6	509926	509931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33595183
14018	NC_002928	CCA	2	6	509951	509956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33595183
14019	NC_002928	CAG	3	9	510042	510050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595183
14020	NC_002928	GCC	2	6	510054	510059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595183
14021	NC_002928	GCTG	2	8	510065	510072	0 %	25 %	50 %	25 %	33595183
14022	NC_002928	CCT	2	6	510080	510085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33595183
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14030	NC_002928	CG	3	6	510333	510338	0 %	0 %	50 %	50 %	33595183
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14032	NC_002928	CG	3	6	510428	510433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14033	NC_002928	GCG	3	9	510431	510439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14034	NC_002928	GGC	2	6	510440	510445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14035	NC_002928	GCGA	2	8	510465	510472	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14036	NC_002928	AGCCA	2	10	510494	510503	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
14037	NC_002928	GC	4	8	510570	510577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14038	NC_002928	GATT	2	8	510583	510590	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_002928	ATT	2	6	510615	510620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_002928	GTTT	2	8	510622	510629	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14041	NC_002928	ATG	2	6	510662	510667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33595184
14042	NC_002928	GAA	2	6	510696	510701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33595184
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14049	NC_002928	TCG	2	6	510965	510970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595184
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14052	NC_002928	CG	3	6	511140	511145	0 %	0 %	50 %	50 %	33595184
14053	NC_002928	CGTC	2	8	511149	511156	0 %	25 %	25 %	50 %	33595184
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14057	NC_002928	TGC	2	6	511383	511388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595184
14058	NC_002928	CGA	2	6	511398	511403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595184
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14062	NC_002928	ACC	2	6	511568	511573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33595184
14063	NC_002928	CGA	2	6	511585	511590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595184
14064	NC_002928	TCG	2	6	511635	511640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595184
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14066	NC_002928	GGCC	2	8	511699	511706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14067	NC_002928	ACGT	2	8	511717	511724	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14068	NC_002928	CGA	2	6	511740	511745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595185
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14071	NC_002928	CGT	2	6	511873	511878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595185
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14098	NC_002928	GATG	2	8	513169	513176	25 %	25 %	50 %	0 %	33595185
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14105	NC_002928	GCG	2	6	513719	513724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595186
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14119	NC_002928	CGC	2	6	514437	514442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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14122	NC_002928	CCG	2	6	514636	514641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595187
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14124	NC_002928	GC	3	6	514712	514717	0 %	0 %	50 %	50 %	33595187
14125	NC_002928	GCA	2	6	514744	514749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595187
14126	NC_002928	GCC	2	6	514796	514801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595187
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14128	NC_002928	CAGC	2	8	514832	514839	25 %	0 %	25 %	50 %	33595187
14129	NC_002928	GCG	2	6	514843	514848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595187
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14131	NC_002928	CAT	2	6	514979	514984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33595187
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14140	NC_002928	TCG	2	6	515329	515334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595187
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14150	NC_002928	CGC	2	6	515678	515683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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14153	NC_002928	GC	3	6	515790	515795	0 %	0 %	50 %	50 %	33595188
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14164	NC_002928	GCGCC	2	10	516078	516087	0 %	0 %	40 %	60 %	33595188
14165	NC_002928	CGC	2	6	516088	516093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595188
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14168	NC_002928	CG	3	6	516138	516143	0 %	0 %	50 %	50 %	33595188
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14228	NC_002928	CTC	2	6	519488	519493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33595192
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14230	NC_002928	TGCA	2	8	519664	519671	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14231	NC_002928	TAT	2	6	519727	519732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14232	NC_002928	TCT	2	6	519827	519832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14233	NC_002928	T	7	7	519840	519846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14234	NC_002928	AGC	2	6	519865	519870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33595193
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14238	NC_002928	TCCG	2	8	520122	520129	0 %	25 %	25 %	50 %	33595193
14239	NC_002928	CTTAC	2	10	520230	520239	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
14240	NC_002928	ACC	2	6	520332	520337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14241	NC_002928	TTC	2	6	520344	520349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14242	NC_002928	TTC	2	6	520399	520404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33595194
14243	NC_002928	TTC	2	6	520441	520446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33595194
14244	NC_002928	CTG	2	6	520449	520454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33595194
14245	NC_002928	GCGT	2	8	520489	520496	0 %	25 %	50 %	25 %	33595194
14246	NC_002928	TAGT	2	8	520545	520552	25 %	50 %	25 %	0 %	33595194
14247	NC_002928	CG	3	6	520560	520565	0 %	0 %	50 %	50 %	33595194
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14249	NC_002928	GCC	2	6	520732	520737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33595195
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14493	NC_002928	GCGCA	2	10	533250	533259	20 %	0 %	40 %	40 %	33595207
14494	NC_002928	GCTG	2	8	533266	533273	0 %	25 %	50 %	25 %	33595207
14495	NC_002928	GCG	2	6	533274	533279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595207
14496	NC_002928	GGGCG	3	15	533284	533298	0 %	0 %	80 %	20 %	33595207
14497	NC_002928	GC	3	6	533304	533309	0 %	0 %	50 %	50 %	33595207
14498	NC_002928	GC	3	6	533313	533318	0 %	0 %	50 %	50 %	33595207
14499	NC_002928	GGC	2	6	533324	533329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33595207
14500	NC_002928	GC	3	6	533345	533350	0 %	0 %	50 %	50 %	33595207

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