MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella parapertussis 12822 chromosome

Total Repeats: 137474

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_002928	CGATCA	2	12	195563	195574	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33594901
5003	NC_002928	TGATCA	2	12	195575	195586	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33594901
5004	NC_002928	CAT	4	12	195591	195602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594901
5005	NC_002928	GC	3	6	195654	195659	0 %	0 %	50 %	50 %	33594901
5006	NC_002928	CG	4	8	195665	195672	0 %	0 %	50 %	50 %	33594901
5007	NC_002928	GC	3	6	195716	195721	0 %	0 %	50 %	50 %	33594901
5008	NC_002928	GC	3	6	195735	195740	0 %	0 %	50 %	50 %	33594901
5009	NC_002928	GC	3	6	195792	195797	0 %	0 %	50 %	50 %	33594901
5010	NC_002928	GTC	2	6	195804	195809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594901
5011	NC_002928	ACG	2	6	195817	195822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594901
5012	NC_002928	GCTG	2	8	195866	195873	0 %	25 %	50 %	25 %	33594901
5013	NC_002928	GCC	2	6	195900	195905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594901
5014	NC_002928	GC	3	6	195912	195917	0 %	0 %	50 %	50 %	33594901
5015	NC_002928	ATC	2	6	195918	195923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594901
5016	NC_002928	CGG	2	6	195949	195954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594901
5017	NC_002928	TCG	2	6	195958	195963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594901
5018	NC_002928	GCA	2	6	195989	195994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594901
5019	NC_002928	G	6	6	196022	196027	0 %	0 %	100 %	0 %	33594901
5020	NC_002928	GCCG	2	8	196064	196071	0 %	0 %	50 %	50 %	33594901
5021	NC_002928	TACC	2	8	196073	196080	25 %	25 %	0 %	50 %	33594901
5022	NC_002928	GCA	2	6	196103	196108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594901
5023	NC_002928	CGC	3	9	196112	196120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594901
5024	NC_002928	GC	3	6	196143	196148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5025	NC_002928	CGGC	2	8	196155	196162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5026	NC_002928	GTG	2	6	196202	196207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594902
5027	NC_002928	GCC	2	6	196217	196222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594902
5028	NC_002928	CGG	2	6	196233	196238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594902
5029	NC_002928	CGA	2	6	196258	196263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594902
5030	NC_002928	CGG	3	9	196306	196314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594902
5031	NC_002928	GCC	2	6	196318	196323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594902
5032	NC_002928	TGC	2	6	196329	196334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594902
5033	NC_002928	GC	4	8	196407	196414	0 %	0 %	50 %	50 %	33594902
5034	NC_002928	CCG	2	6	196430	196435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594902
5035	NC_002928	CG	3	6	196434	196439	0 %	0 %	50 %	50 %	33594902
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5037	NC_002928	GGC	2	6	196495	196500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594902
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5039	NC_002928	CGG	2	6	196524	196529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594902
5040	NC_002928	CGA	2	6	196570	196575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594902
5041	NC_002928	GGCG	2	8	196576	196583	0 %	0 %	75 %	25 %	33594902
5042	NC_002928	GC	3	6	196599	196604	0 %	0 %	50 %	50 %	33594902
5043	NC_002928	CCG	2	6	196605	196610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594902
5044	NC_002928	GCC	2	6	196630	196635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594902
5045	NC_002928	CCA	2	6	196653	196658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33594902
5046	NC_002928	GCA	2	6	196660	196665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594902
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5052	NC_002928	G	6	6	196828	196833	0 %	0 %	100 %	0 %	33594903
5053	NC_002928	GC	3	6	196862	196867	0 %	0 %	50 %	50 %	33594903
5054	NC_002928	GGCT	2	8	196870	196877	0 %	25 %	50 %	25 %	33594903
5055	NC_002928	GCG	2	6	196964	196969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594903
5056	NC_002928	CGT	2	6	197051	197056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594903
5057	NC_002928	GC	3	6	197080	197085	0 %	0 %	50 %	50 %	33594903
5058	NC_002928	TGT	2	6	197105	197110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33594903
5059	NC_002928	TGG	2	6	197129	197134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594903
5060	NC_002928	CCG	2	6	197216	197221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594903
5061	NC_002928	CTG	2	6	197239	197244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594903
5062	NC_002928	GTG	2	6	197280	197285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594903
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5071	NC_002928	GC	4	8	197600	197607	0 %	0 %	50 %	50 %	33594903
5072	NC_002928	CGC	2	6	197617	197622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594903
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5081	NC_002928	GC	3	6	197888	197893	0 %	0 %	50 %	50 %	33594904
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5088	NC_002928	CG	3	6	198137	198142	0 %	0 %	50 %	50 %	33594904
5089	NC_002928	CAC	2	6	198207	198212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33594904
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5099	NC_002928	GC	3	6	198387	198392	0 %	0 %	50 %	50 %	33594904
5100	NC_002928	CCG	2	6	198410	198415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594904
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5108	NC_002928	GC	3	6	198789	198794	0 %	0 %	50 %	50 %	33594904
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5111	NC_002928	CGT	2	6	198980	198985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594904
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5114	NC_002928	GC	4	8	199100	199107	0 %	0 %	50 %	50 %	33594904
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5124	NC_002928	CGG	2	6	199538	199543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594904
5125	NC_002928	GCG	3	9	199580	199588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594904
5126	NC_002928	CG	3	6	199611	199616	0 %	0 %	50 %	50 %	33594904
5127	NC_002928	GC	3	6	199626	199631	0 %	0 %	50 %	50 %	33594904
5128	NC_002928	G	6	6	199656	199661	0 %	0 %	100 %	0 %	33594904
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5133	NC_002928	CTG	2	6	199807	199812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594904
5134	NC_002928	CGT	2	6	199835	199840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594904
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5136	NC_002928	GC	4	8	199964	199971	0 %	0 %	50 %	50 %	33594905
5137	NC_002928	GGT	2	6	200005	200010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594905
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5139	NC_002928	TGGC	2	8	200075	200082	0 %	25 %	50 %	25 %	33594905
5140	NC_002928	GCA	2	6	200094	200099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594905
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5143	NC_002928	CAGCTG	2	12	200149	200160	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	33594905
5144	NC_002928	CAC	2	6	200161	200166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33594905
5145	NC_002928	GCGCG	2	10	200167	200176	0 %	0 %	60 %	40 %	33594905
5146	NC_002928	GCCG	2	8	200181	200188	0 %	0 %	50 %	50 %	33594905
5147	NC_002928	CGA	2	6	200196	200201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594905
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5149	NC_002928	CCGGCG	2	12	200225	200236	0 %	0 %	50 %	50 %	33594905
5150	NC_002928	GC	3	6	200251	200256	0 %	0 %	50 %	50 %	33594905
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5154	NC_002928	CGT	2	6	200346	200351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594905
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5157	NC_002928	GC	3	6	200497	200502	0 %	0 %	50 %	50 %	33594905
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5161	NC_002928	CGG	2	6	200610	200615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594905
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5165	NC_002928	GGCG	2	8	200697	200704	0 %	0 %	75 %	25 %	33594905
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5190	NC_002928	GCG	2	6	201975	201980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594907
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5194	NC_002928	CGG	2	6	202142	202147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594907
5195	NC_002928	TGC	2	6	202159	202164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594907
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5197	NC_002928	GC	3	6	202244	202249	0 %	0 %	50 %	50 %	33594907
5198	NC_002928	GC	4	8	202286	202293	0 %	0 %	50 %	50 %	33594907
5199	NC_002928	CAG	2	6	202379	202384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594907
5200	NC_002928	GC	3	6	202423	202428	0 %	0 %	50 %	50 %	33594907
5201	NC_002928	GC	3	6	202431	202436	0 %	0 %	50 %	50 %	33594907
5202	NC_002928	GACG	2	8	202459	202466	25 %	0 %	50 %	25 %	33594907
5203	NC_002928	ACG	2	6	202476	202481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594907
5204	NC_002928	CAT	2	6	202520	202525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594907
5205	NC_002928	GCC	2	6	202577	202582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5206	NC_002928	GCG	2	6	202625	202630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594908
5207	NC_002928	CTGG	2	8	202646	202653	0 %	25 %	50 %	25 %	33594908
5208	NC_002928	GCAGC	2	10	202655	202664	20 %	0 %	40 %	40 %	33594908
5209	NC_002928	GC	3	6	202691	202696	0 %	0 %	50 %	50 %	33594908
5210	NC_002928	GCA	2	6	202798	202803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594908
5211	NC_002928	GC	3	6	202820	202825	0 %	0 %	50 %	50 %	33594908
5212	NC_002928	CAG	2	6	202841	202846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594908
5213	NC_002928	CGG	2	6	202852	202857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594908
5214	NC_002928	A	6	6	202866	202871	100 %	0 %	0 %	0 %	33594908
5215	NC_002928	GTA	2	6	202916	202921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33594908
5216	NC_002928	GC	3	6	203000	203005	0 %	0 %	50 %	50 %	33594908
5217	NC_002928	CCGG	2	8	203006	203013	0 %	0 %	50 %	50 %	33594908
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5223	NC_002928	CGC	2	6	203233	203238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594908
5224	NC_002928	CGA	2	6	203242	203247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594908
5225	NC_002928	CG	3	6	203275	203280	0 %	0 %	50 %	50 %	33594908
5226	NC_002928	CG	3	6	203350	203355	0 %	0 %	50 %	50 %	33594908
5227	NC_002928	GC	3	6	203357	203362	0 %	0 %	50 %	50 %	33594908
5228	NC_002928	CAGC	2	8	203375	203382	25 %	0 %	25 %	50 %	33594908
5229	NC_002928	CCA	2	6	203383	203388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33594908
5230	NC_002928	TGCG	2	8	203422	203429	0 %	25 %	50 %	25 %	33594908
5231	NC_002928	GCA	2	6	203437	203442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594908
5232	NC_002928	GC	3	6	203452	203457	0 %	0 %	50 %	50 %	33594908
5233	NC_002928	CG	3	6	203492	203497	0 %	0 %	50 %	50 %	33594909
5234	NC_002928	CGG	2	6	203509	203514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594909
5235	NC_002928	CGCGC	2	10	203515	203524	0 %	0 %	40 %	60 %	33594909
5236	NC_002928	GGC	2	6	203605	203610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594909
5237	NC_002928	CGCC	2	8	203672	203679	0 %	0 %	25 %	75 %	33594909
5238	NC_002928	CGG	2	6	203694	203699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594909
5239	NC_002928	GAA	2	6	203770	203775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33594909
5240	NC_002928	GCA	2	6	203817	203822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594909
5241	NC_002928	CGC	2	6	203835	203840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594909
5242	NC_002928	TGG	2	6	203877	203882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594909
5243	NC_002928	CCG	2	6	203898	203903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594909
5244	NC_002928	GC	3	6	203911	203916	0 %	0 %	50 %	50 %	33594909
5245	NC_002928	GCG	2	6	203949	203954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594909
5246	NC_002928	GC	3	6	203983	203988	0 %	0 %	50 %	50 %	33594909
5247	NC_002928	GC	3	6	203995	204000	0 %	0 %	50 %	50 %	33594909
5248	NC_002928	AGC	2	6	204012	204017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594909
5249	NC_002928	GCG	2	6	204024	204029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594909
5250	NC_002928	GC	4	8	204056	204063	0 %	0 %	50 %	50 %	33594909
5251	NC_002928	CGA	2	6	204069	204074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594909
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5375	NC_002928	CGC	2	6	209424	209429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594915
5376	NC_002928	GC	3	6	209445	209450	0 %	0 %	50 %	50 %	33594915
5377	NC_002928	GCGG	2	8	209503	209510	0 %	0 %	75 %	25 %	33594915
5378	NC_002928	CG	3	6	209516	209521	0 %	0 %	50 %	50 %	33594915
5379	NC_002928	CG	3	6	209600	209605	0 %	0 %	50 %	50 %	33594915
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5382	NC_002928	GCG	2	6	209693	209698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594915
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5388	NC_002928	GC	4	8	209919	209926	0 %	0 %	50 %	50 %	33594915
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5391	NC_002928	CGCCTG	2	12	210037	210048	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	33594915
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5397	NC_002928	GC	3	6	210229	210234	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5498	NC_002928	GGC	2	6	213557	213562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594918
5499	NC_002928	CGA	2	6	213607	213612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594918
5500	NC_002928	GCG	2	6	213615	213620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594918

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