MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bordetella bronchiseptica RB50 chromosome

Total Repeats: 16350

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002927	GGGC	2	8	517	524	0 %	0 %	75 %	25 %	33598994
2	NC_002927	GACG	2	8	616	623	25 %	0 %	50 %	25 %	33598994
3	NC_002927	CGCA	2	8	751	758	25 %	0 %	25 %	50 %	33598994
4	NC_002927	CATC	2	8	836	843	25 %	25 %	0 %	50 %	33598994
5	NC_002927	GCCT	2	8	947	954	0 %	25 %	25 %	50 %	33598994
6	NC_002927	GCTG	2	8	1602	1609	0 %	25 %	50 %	25 %	33598994
7	NC_002927	GCAA	2	8	1904	1911	50 %	0 %	25 %	25 %	33598994
8	NC_002927	GCCG	2	8	1988	1995	0 %	0 %	50 %	50 %	33598995
9	NC_002927	GTCG	2	8	2120	2127	0 %	25 %	50 %	25 %	33598995
10	NC_002927	GGCC	2	8	2363	2370	0 %	0 %	50 %	50 %	33598995
11	NC_002927	CCGC	2	8	2571	2578	0 %	0 %	25 %	75 %	33598996
12	NC_002927	GCCC	2	8	2946	2953	0 %	0 %	25 %	75 %	33598996
13	NC_002927	GCTG	2	8	2980	2987	0 %	25 %	50 %	25 %	33598996
14	NC_002927	TGCT	2	8	3360	3367	0 %	50 %	25 %	25 %	33598997
15	NC_002927	GCCA	2	8	4016	4023	25 %	0 %	25 %	50 %	33598997
16	NC_002927	CCTG	2	8	4322	4329	0 %	25 %	25 %	50 %	33598998
17	NC_002927	GTGC	2	8	4440	4447	0 %	25 %	50 %	25 %	33598998
18	NC_002927	GGCC	2	8	4517	4524	0 %	0 %	50 %	50 %	33598998
19	NC_002927	GGCG	2	8	4769	4776	0 %	0 %	75 %	25 %	33598998
20	NC_002927	GGCC	2	8	5250	5257	0 %	0 %	50 %	50 %	33598999
21	NC_002927	CGAC	2	8	5366	5373	25 %	0 %	25 %	50 %	33598999
22	NC_002927	CGGC	2	8	5682	5689	0 %	0 %	50 %	50 %	33598999
23	NC_002927	GGCG	2	8	7522	7529	0 %	0 %	75 %	25 %	33599000
24	NC_002927	TATG	2	8	7965	7972	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002927	TTGC	2	8	8301	8308	0 %	50 %	25 %	25 %	33599001
26	NC_002927	AAGG	2	8	8922	8929	50 %	0 %	50 %	0 %	33599002
27	NC_002927	CCCG	2	8	9341	9348	0 %	0 %	25 %	75 %	33599003
28	NC_002927	CCTA	2	8	11747	11754	25 %	25 %	0 %	50 %	33599007
29	NC_002927	TCGT	2	8	12061	12068	0 %	50 %	25 %	25 %	33599007
30	NC_002927	GTCG	2	8	13647	13654	0 %	25 %	50 %	25 %	33599007
31	NC_002927	TCGC	2	8	14180	14187	0 %	25 %	25 %	50 %	33599007
32	NC_002927	GGCC	2	8	14901	14908	0 %	0 %	50 %	50 %	33599007
33	NC_002927	TCGC	2	8	15720	15727	0 %	25 %	25 %	50 %	33599007
34	NC_002927	CAAG	2	8	15782	15789	50 %	0 %	25 %	25 %	33599008
35	NC_002927	ATGG	2	8	16463	16470	25 %	25 %	50 %	0 %	33599008
36	NC_002927	AAGG	2	8	17706	17713	50 %	0 %	50 %	0 %	33599008
37	NC_002927	ATCG	2	8	18521	18528	25 %	25 %	25 %	25 %	33599008
38	NC_002927	GGTG	2	8	19064	19071	0 %	25 %	75 %	0 %	33599008
39	NC_002927	ACTG	2	8	20010	20017	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_002927	CCTG	2	8	21078	21085	0 %	25 %	25 %	50 %	33599010
41	NC_002927	GACA	2	8	21101	21108	50 %	0 %	25 %	25 %	33599010
42	NC_002927	GCCC	2	8	21853	21860	0 %	0 %	25 %	75 %	33599010
43	NC_002927	CACG	2	8	21971	21978	25 %	0 %	25 %	50 %	33599010
44	NC_002927	TTCG	2	8	22155	22162	0 %	50 %	25 %	25 %	33599011
45	NC_002927	CACG	2	8	22268	22275	25 %	0 %	25 %	50 %	33599011
46	NC_002927	CGGA	2	8	22298	22305	25 %	0 %	50 %	25 %	33599011
47	NC_002927	GCCG	2	8	23009	23016	0 %	0 %	50 %	50 %	33599011
48	NC_002927	CGCC	2	8	23522	23529	0 %	0 %	25 %	75 %	33599011
49	NC_002927	GGCC	2	8	23708	23715	0 %	0 %	50 %	50 %	33599011
50	NC_002927	GCTG	2	8	24168	24175	0 %	25 %	50 %	25 %	33599011
51	NC_002927	GCCG	2	8	24176	24183	0 %	0 %	50 %	50 %	33599011
52	NC_002927	GCCA	2	8	24301	24308	25 %	0 %	25 %	50 %	33599011
53	NC_002927	CGGG	2	8	24313	24320	0 %	0 %	75 %	25 %	33599011
54	NC_002927	GACC	2	8	25282	25289	25 %	0 %	25 %	50 %	33599012
55	NC_002927	TGCT	2	8	25314	25321	0 %	50 %	25 %	25 %	33599012
56	NC_002927	GCCT	2	8	25914	25921	0 %	25 %	25 %	50 %	33599013
57	NC_002927	GCCG	2	8	26537	26544	0 %	0 %	50 %	50 %	33599014
58	NC_002927	TGAG	2	8	26700	26707	25 %	25 %	50 %	0 %	33599014
59	NC_002927	CTGC	2	8	26845	26852	0 %	25 %	25 %	50 %	33599014
60	NC_002927	GCCG	2	8	26881	26888	0 %	0 %	50 %	50 %	33599014
61	NC_002927	CGGC	2	8	27090	27097	0 %	0 %	50 %	50 %	33599014
62	NC_002927	GCTG	2	8	27130	27137	0 %	25 %	50 %	25 %	33599014
63	NC_002927	GGCC	2	8	27301	27308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_002927	CTGG	2	8	27376	27383	0 %	25 %	50 %	25 %	33599015
65	NC_002927	GTCG	2	8	27868	27875	0 %	25 %	50 %	25 %	33599015
66	NC_002927	GCCG	2	8	28212	28219	0 %	0 %	50 %	50 %	33599015
67	NC_002927	AGCG	2	8	28441	28448	25 %	0 %	50 %	25 %	33599016
68	NC_002927	AGCC	2	8	28789	28796	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_002927	ATCG	2	8	28893	28900	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_002927	AACG	2	8	28974	28981	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_002927	CTAC	2	8	30123	30130	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_002927	TGGA	2	8	30285	30292	25 %	25 %	50 %	0 %	33599019
73	NC_002927	GCCA	2	8	30717	30724	25 %	0 %	25 %	50 %	33599019
74	NC_002927	AAGA	2	8	31191	31198	75 %	0 %	25 %	0 %	33599019
75	NC_002927	ATGC	2	8	31221	31228	25 %	25 %	25 %	25 %	33599019
76	NC_002927	CGAA	2	8	31879	31886	50 %	0 %	25 %	25 %	33599019
77	NC_002927	AAGG	2	8	31920	31927	50 %	0 %	50 %	0 %	33599019
78	NC_002927	AAGT	2	8	32229	32236	50 %	25 %	25 %	0 %	33599019
79	NC_002927	GGCG	2	8	33126	33133	0 %	0 %	75 %	25 %	33599020
80	NC_002927	GATC	2	8	33615	33622	25 %	25 %	25 %	25 %	33599021
81	NC_002927	GTAA	2	8	34920	34927	50 %	25 %	25 %	0 %	161609283
82	NC_002927	GCTG	2	8	35335	35342	0 %	25 %	50 %	25 %	33599023
83	NC_002927	CGGC	2	8	36308	36315	0 %	0 %	50 %	50 %	33599025
84	NC_002927	CGAT	2	8	36518	36525	25 %	25 %	25 %	25 %	33599025
85	NC_002927	GGTC	2	8	36876	36883	0 %	25 %	50 %	25 %	33599026
86	NC_002927	GTCG	2	8	37450	37457	0 %	25 %	50 %	25 %	33599028
87	NC_002927	GCAC	2	8	38161	38168	25 %	0 %	25 %	50 %	33599029
88	NC_002927	TTCG	2	8	38171	38178	0 %	50 %	25 %	25 %	33599029
89	NC_002927	GCCG	2	8	38321	38328	0 %	0 %	50 %	50 %	33599029
90	NC_002927	CCAG	2	8	38636	38643	25 %	0 %	25 %	50 %	33599030
91	NC_002927	CGTC	2	8	39442	39449	0 %	25 %	25 %	50 %	33599032
92	NC_002927	GCCG	2	8	39796	39803	0 %	0 %	50 %	50 %	33599032
93	NC_002927	GCAG	2	8	40000	40007	25 %	0 %	50 %	25 %	33599032
94	NC_002927	GGCC	2	8	40048	40055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_002927	TGAT	2	8	40230	40237	25 %	50 %	25 %	0 %	33599033
96	NC_002927	TGCG	2	8	41472	41479	0 %	25 %	50 %	25 %	33599033
97	NC_002927	TTGG	2	8	42113	42120	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002927	CAGG	2	8	42192	42199	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_002927	CAGG	2	8	42209	42216	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_002927	TCGT	2	8	42329	42336	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_002927	GACA	2	8	43140	43147	50 %	0 %	25 %	25 %	33599036
102	NC_002927	GCTG	2	8	43743	43750	0 %	25 %	50 %	25 %	33599037
103	NC_002927	GCCG	2	8	44216	44223	0 %	0 %	50 %	50 %	33599038
104	NC_002927	CCCA	2	8	44796	44803	25 %	0 %	0 %	75 %	33599039
105	NC_002927	CAAG	2	8	44831	44838	50 %	0 %	25 %	25 %	33599039
106	NC_002927	GCCG	2	8	45668	45675	0 %	0 %	50 %	50 %	33599041
107	NC_002927	GCGT	2	8	46396	46403	0 %	25 %	50 %	25 %	33599043
108	NC_002927	CGGC	2	8	46468	46475	0 %	0 %	50 %	50 %	33599043
109	NC_002927	GCTT	2	8	46508	46515	0 %	50 %	25 %	25 %	33599043
110	NC_002927	CATC	2	8	46788	46795	25 %	25 %	0 %	50 %	33599044
111	NC_002927	AAGA	2	8	46841	46848	75 %	0 %	25 %	0 %	33599044
112	NC_002927	GGCC	2	8	46855	46862	0 %	0 %	50 %	50 %	33599044
113	NC_002927	TCCG	2	8	47583	47590	0 %	25 %	25 %	50 %	33599044
114	NC_002927	GCTG	2	8	47638	47645	0 %	25 %	50 %	25 %	33599044
115	NC_002927	TGCT	2	8	47669	47676	0 %	50 %	25 %	25 %	33599044
116	NC_002927	ACCG	2	8	48770	48777	25 %	0 %	25 %	50 %	33599048
117	NC_002927	CGCT	2	8	49144	49151	0 %	25 %	25 %	50 %	33599049
118	NC_002927	GTGG	2	8	49578	49585	0 %	25 %	75 %	0 %	33599049
119	NC_002927	CCGA	2	8	50066	50073	25 %	0 %	25 %	50 %	33599050
120	NC_002927	CGCA	2	8	50387	50394	25 %	0 %	25 %	50 %	33599050
121	NC_002927	GATC	2	8	50647	50654	25 %	25 %	25 %	25 %	33599050
122	NC_002927	GAAC	2	8	50761	50768	50 %	0 %	25 %	25 %	33599050
123	NC_002927	CACG	2	8	51138	51145	25 %	0 %	25 %	50 %	33599051
124	NC_002927	GGCA	2	8	51846	51853	25 %	0 %	50 %	25 %	33599052
125	NC_002927	GATG	2	8	51914	51921	25 %	25 %	50 %	0 %	33599052
126	NC_002927	CTGT	2	8	52246	52253	0 %	50 %	25 %	25 %	33599053
127	NC_002927	GCTG	2	8	52545	52552	0 %	25 %	50 %	25 %	33599054
128	NC_002927	CGCC	2	8	52585	52592	0 %	0 %	25 %	75 %	33599054
129	NC_002927	CCAG	2	8	52902	52909	25 %	0 %	25 %	50 %	33599054
130	NC_002927	CGGC	2	8	53100	53107	0 %	0 %	50 %	50 %	33599054
131	NC_002927	GTCG	2	8	53260	53267	0 %	25 %	50 %	25 %	33599054
132	NC_002927	GAGC	2	8	53434	53441	25 %	0 %	50 %	25 %	33599054
133	NC_002927	GGCG	2	8	53536	53543	0 %	0 %	75 %	25 %	33599054
134	NC_002927	TGGA	2	8	53678	53685	25 %	25 %	50 %	0 %	33599054
135	NC_002927	CGCA	2	8	54166	54173	25 %	0 %	25 %	50 %	33599054
136	NC_002927	GGCT	2	8	54756	54763	0 %	25 %	50 %	25 %	33599055
137	NC_002927	CTAC	2	8	55162	55169	25 %	25 %	0 %	50 %	33599055
138	NC_002927	CTGG	2	8	55409	55416	0 %	25 %	50 %	25 %	33599055
139	NC_002927	CGCC	2	8	55429	55436	0 %	0 %	25 %	75 %	33599055
140	NC_002927	CGGC	2	8	55461	55468	0 %	0 %	50 %	50 %	33599055
141	NC_002927	AGCC	2	8	55599	55606	25 %	0 %	25 %	50 %	33599056
142	NC_002927	CGAG	2	8	56305	56312	25 %	0 %	50 %	25 %	33599056
143	NC_002927	GGTT	2	8	57136	57143	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_002927	GGCA	2	8	57287	57294	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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