MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella bronchiseptica RB50 chromosome

Total Repeats: 153496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_002927	TG	3	6	161909	161914	0 %	50 %	50 %	0 %	33599142
4002	NC_002927	GGT	3	9	161915	161923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599142
4003	NC_002927	TCG	2	6	161931	161936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599142
4004	NC_002927	CGG	2	6	161977	161982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599142
4005	NC_002927	ACGGCC	2	12	161994	162005	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	33599142
4006	NC_002927	GGT	2	6	162065	162070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599142
4007	NC_002927	CAGC	2	8	162071	162078	25 %	0 %	25 %	50 %	33599142
4008	NC_002927	GGGCA	2	10	162128	162137	20 %	0 %	60 %	20 %	33599142
4009	NC_002927	GC	3	6	162185	162190	0 %	0 %	50 %	50 %	33599142
4010	NC_002927	CGG	2	6	162194	162199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599142
4011	NC_002927	GC	3	6	162233	162238	0 %	0 %	50 %	50 %	33599143
4012	NC_002927	TGC	2	6	162272	162277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599143
4013	NC_002927	GGCG	2	8	162297	162304	0 %	0 %	75 %	25 %	33599143
4014	NC_002927	CGG	3	9	162345	162353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599143
4015	NC_002927	GC	3	6	162359	162364	0 %	0 %	50 %	50 %	33599143
4016	NC_002927	GGC	2	6	162388	162393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599143
4017	NC_002927	CCG	2	6	162402	162407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599143
4018	NC_002927	CGC	2	6	162417	162422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599143
4019	NC_002927	TCGA	2	8	162455	162462	25 %	25 %	25 %	25 %	33599143
4020	NC_002927	TTG	2	6	162503	162508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33599143
4021	NC_002927	CGG	2	6	162588	162593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599143
4022	NC_002927	GGCC	2	8	162639	162646	0 %	0 %	50 %	50 %	33599143
4023	NC_002927	CAG	2	6	162682	162687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599143
4024	NC_002927	CGTG	2	8	162759	162766	0 %	25 %	50 %	25 %	33599143
4025	NC_002927	CCG	2	6	162901	162906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599143
4026	NC_002927	GCA	2	6	162948	162953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599143
4027	NC_002927	ATC	2	6	163013	163018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33599143
4028	NC_002927	GCC	2	6	163036	163041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599143
4029	NC_002927	CAG	2	6	163042	163047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599143
4030	NC_002927	GGCG	2	8	163089	163096	0 %	0 %	75 %	25 %	33599143
4031	NC_002927	CGT	2	6	163131	163136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599143
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4033	NC_002927	GCC	2	6	163177	163182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599143
4034	NC_002927	GC	4	8	163207	163214	0 %	0 %	50 %	50 %	33599143
4035	NC_002927	GCA	2	6	163221	163226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599143
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4038	NC_002927	CG	3	6	163305	163310	0 %	0 %	50 %	50 %	33599143
4039	NC_002927	GCCG	2	8	163314	163321	0 %	0 %	50 %	50 %	33599143
4040	NC_002927	CCTG	2	8	163322	163329	0 %	25 %	25 %	50 %	33599143
4041	NC_002927	G	6	6	163329	163334	0 %	0 %	100 %	0 %	33599143
4042	NC_002927	CG	3	6	163335	163340	0 %	0 %	50 %	50 %	33599143
4043	NC_002927	GCC	2	6	163364	163369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599143
4044	NC_002927	ATGCCC	2	12	163381	163392	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	33599143
4045	NC_002927	CAG	2	6	163465	163470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599143
4046	NC_002927	TAC	2	6	163491	163496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_002927	GGC	2	6	163509	163514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599144
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4049	NC_002927	CGG	2	6	163626	163631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599144
4050	NC_002927	TCG	2	6	163678	163683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599144
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4053	NC_002927	GCG	2	6	163756	163761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599144
4054	NC_002927	TCG	2	6	163828	163833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599144
4055	NC_002927	GAC	2	6	163884	163889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599144
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4057	NC_002927	GC	4	8	163916	163923	0 %	0 %	50 %	50 %	33599144
4058	NC_002927	GTC	2	6	163930	163935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599144
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4070	NC_002927	GAAC	2	8	164214	164221	50 %	0 %	25 %	25 %	33599144
4071	NC_002927	GGCC	2	8	164225	164232	0 %	0 %	50 %	50 %	33599144
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4080	NC_002927	GAC	2	6	164529	164534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_002927	TGA	2	6	164543	164548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_002927	TCT	2	6	164579	164584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_002927	CGA	2	6	164625	164630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599145
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4088	NC_002927	CCT	2	6	164796	164801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33599145
4089	NC_002927	GCC	2	6	164896	164901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599145
4090	NC_002927	CAG	2	6	164914	164919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599145
4091	NC_002927	GC	4	8	164929	164936	0 %	0 %	50 %	50 %	33599145
4092	NC_002927	CAC	2	6	164989	164994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33599145
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4094	NC_002927	GTA	2	6	165043	165048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33599145
4095	NC_002927	TCG	3	9	165098	165106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599145
4096	NC_002927	GC	3	6	165117	165122	0 %	0 %	50 %	50 %	33599145
4097	NC_002927	CGCCGT	2	12	165123	165134	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	33599145
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4100	NC_002927	GCG	2	6	165230	165235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599145
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4103	NC_002927	CTTCG	2	10	165346	165355	0 %	40 %	20 %	40 %	33599145
4104	NC_002927	TCGACG	2	12	165389	165400	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	33599145
4105	NC_002927	CAG	2	6	165418	165423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599145
4106	NC_002927	GGT	2	6	165460	165465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599145
4107	NC_002927	TCG	2	6	165473	165478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599145
4108	NC_002927	CAG	2	6	165511	165516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599145
4109	NC_002927	GGC	2	6	165574	165579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599145
4110	NC_002927	ATG	2	6	165605	165610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33599145
4111	NC_002927	GC	3	6	165763	165768	0 %	0 %	50 %	50 %	33599146
4112	NC_002927	GGC	2	6	165810	165815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599146
4113	NC_002927	GC	3	6	165832	165837	0 %	0 %	50 %	50 %	33599146
4114	NC_002927	ACC	2	6	165848	165853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33599146
4115	NC_002927	TTG	2	6	165875	165880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33599146
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4118	NC_002927	CGT	2	6	166059	166064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599146
4119	NC_002927	GTT	2	6	166096	166101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33599146
4120	NC_002927	CGA	2	6	166140	166145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599146
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4122	NC_002927	GCC	2	6	166186	166191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599146
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4124	NC_002927	GGT	2	6	166270	166275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599146
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4248	NC_002927	GC	4	8	170484	170491	0 %	0 %	50 %	50 %	33599150
4249	NC_002927	CGA	2	6	170502	170507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599150
4250	NC_002927	GGC	2	6	170523	170528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599150
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4253	NC_002927	GCT	2	6	170613	170618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599150
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4255	NC_002927	GCA	2	6	170807	170812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599151
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4259	NC_002927	CGA	2	6	170927	170932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599151
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4263	NC_002927	GC	3	6	170991	170996	0 %	0 %	50 %	50 %	33599152
4264	NC_002927	GCG	2	6	171002	171007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599152
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4495	NC_002927	CGG	2	6	178338	178343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599160
4496	NC_002927	GCCC	2	8	178352	178359	0 %	0 %	25 %	75 %	33599160
4497	NC_002927	CGA	2	6	178442	178447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599160
4498	NC_002927	GGC	2	6	178571	178576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599160
4499	NC_002927	CGC	2	6	178586	178591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599160
4500	NC_002927	CG	3	6	178602	178607	0 %	0 %	50 %	50 %	33599160

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