MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella bronchiseptica RB50 chromosome

Total Repeats: 153496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_002927	GCG	3	9	41046	41054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599033
1002	NC_002927	CAC	2	6	41126	41131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33599033
1003	NC_002927	GCG	2	6	41155	41160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599033
1004	NC_002927	GCG	2	6	41180	41185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599033
1005	NC_002927	TTC	2	6	41189	41194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33599033
1006	NC_002927	CG	3	6	41302	41307	0 %	0 %	50 %	50 %	33599033
1007	NC_002927	CG	3	6	41336	41341	0 %	0 %	50 %	50 %	33599033
1008	NC_002927	GCG	2	6	41385	41390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599033
1009	NC_002927	GAC	2	6	41462	41467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599033
1010	NC_002927	TGCG	2	8	41472	41479	0 %	25 %	50 %	25 %	33599033
1011	NC_002927	GTG	3	9	41564	41572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_002927	T	6	6	41573	41578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_002927	TCG	2	6	41600	41605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_002927	G	7	7	41607	41613	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_002927	ATG	2	6	41641	41646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_002927	GC	4	8	41650	41657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_002927	TTCGTG	2	12	41730	41741	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1018	NC_002927	CTG	2	6	41799	41804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_002927	TGC	2	6	41892	41897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_002927	GCC	2	6	41976	41981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_002927	GCCGCG	2	12	41983	41994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1022	NC_002927	TTG	2	6	42090	42095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_002927	TTGG	2	8	42113	42120	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_002927	AAACG	2	10	42147	42156	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1025	NC_002927	CAGG	2	8	42192	42199	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1026	NC_002927	CAGG	2	8	42209	42216	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1027	NC_002927	CGG	2	6	42275	42280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_002927	TCGT	2	8	42329	42336	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1029	NC_002927	CAG	2	6	42340	42345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_002927	ACA	2	6	42469	42474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33599034
1031	NC_002927	CAT	2	6	42545	42550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33599034
1032	NC_002927	CG	3	6	42577	42582	0 %	0 %	50 %	50 %	33599034
1033	NC_002927	TGG	2	6	42616	42621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599034
1034	NC_002927	GCC	2	6	42681	42686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599034
1035	NC_002927	AAC	2	6	42817	42822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33599035
1036	NC_002927	CGA	2	6	42834	42839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599035
1037	NC_002927	AAG	2	6	42865	42870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33599035
1038	NC_002927	CGT	2	6	42930	42935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599035
1039	NC_002927	GAA	2	6	42936	42941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33599035
1040	NC_002927	CAA	2	6	42966	42971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33599035
1041	NC_002927	GGC	2	6	42976	42981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599035
1042	NC_002927	TCG	2	6	42983	42988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599035
1043	NC_002927	GTTCC	2	10	43095	43104	0 %	40 %	20 %	40 %	33599035
1044	NC_002927	GACA	2	8	43140	43147	50 %	0 %	25 %	25 %	33599036
1045	NC_002927	AAG	2	6	43285	43290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33599036
1046	NC_002927	GTG	2	6	43342	43347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599036
1047	NC_002927	CG	3	6	43472	43477	0 %	0 %	50 %	50 %	33599036
1048	NC_002927	ACA	2	6	43529	43534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33599036
1049	NC_002927	ATC	2	6	43552	43557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33599036
1050	NC_002927	CAC	3	9	43614	43622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33599036
1051	NC_002927	GAC	2	6	43633	43638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599036
1052	NC_002927	TGA	2	6	43692	43697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_002927	TCA	2	6	43715	43720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33599037
1054	NC_002927	GC	3	6	43734	43739	0 %	0 %	50 %	50 %	33599037
1055	NC_002927	GCTG	2	8	43743	43750	0 %	25 %	50 %	25 %	33599037
1056	NC_002927	GCC	2	6	43759	43764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599037
1057	NC_002927	GC	3	6	43767	43772	0 %	0 %	50 %	50 %	33599037
1058	NC_002927	ATC	2	6	43786	43791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33599037
1059	NC_002927	GAC	2	6	43792	43797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599037
1060	NC_002927	CGA	2	6	43809	43814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599037
1061	NC_002927	GTC	2	6	43901	43906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599037
1062	NC_002927	CG	3	6	43907	43912	0 %	0 %	50 %	50 %	33599037
1063	NC_002927	ATGAGC	2	12	44015	44026	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33599038
1064	NC_002927	GCA	2	6	44065	44070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599038
1065	NC_002927	TAC	2	6	44210	44215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33599038
1066	NC_002927	GCCG	2	8	44216	44223	0 %	0 %	50 %	50 %	33599038
1067	NC_002927	CG	3	6	44337	44342	0 %	0 %	50 %	50 %	33599038
1068	NC_002927	TGA	2	6	44346	44351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33599038
1069	NC_002927	GCG	2	6	44382	44387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599038
1070	NC_002927	GCC	2	6	44593	44598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599039
1071	NC_002927	GC	3	6	44624	44629	0 %	0 %	50 %	50 %	33599039
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1073	NC_002927	CCCA	2	8	44796	44803	25 %	0 %	0 %	75 %	33599039
1074	NC_002927	TCA	2	6	44815	44820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33599039
1075	NC_002927	CAAG	2	8	44831	44838	50 %	0 %	25 %	25 %	33599039
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1083	NC_002927	CAT	2	6	45089	45094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33599040
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1085	NC_002927	GCG	2	6	45163	45168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599040
1086	NC_002927	CCG	3	9	45190	45198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599040
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1088	NC_002927	AAGGCC	2	12	45225	45236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599040
1089	NC_002927	CG	4	8	45311	45318	0 %	0 %	50 %	50 %	33599040
1090	NC_002927	CTA	2	6	45358	45363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33599041
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1098	NC_002927	CGC	2	6	45579	45584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599041
1099	NC_002927	GAA	2	6	45605	45610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33599041
1100	NC_002927	GTG	2	6	45630	45635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599041
1101	NC_002927	GCCG	2	8	45668	45675	0 %	0 %	50 %	50 %	33599041
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1103	NC_002927	GC	3	6	45710	45715	0 %	0 %	50 %	50 %	33599041
1104	NC_002927	GC	3	6	45809	45814	0 %	0 %	50 %	50 %	33599041
1105	NC_002927	CGG	2	6	45826	45831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599041
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1108	NC_002927	CAG	2	6	45983	45988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599042
1109	NC_002927	GAT	2	6	46022	46027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33599042
1110	NC_002927	CGTCTC	2	12	46046	46057	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	33599042
1111	NC_002927	CCG	2	6	46108	46113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599043
1112	NC_002927	GCA	2	6	46117	46122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599043
1113	NC_002927	CCG	2	6	46174	46179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599043
1114	NC_002927	GGC	2	6	46212	46217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599043
1115	NC_002927	GGC	2	6	46239	46244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599043
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1117	NC_002927	GCGT	2	8	46396	46403	0 %	25 %	50 %	25 %	33599043
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1122	NC_002927	GCTT	2	8	46508	46515	0 %	50 %	25 %	25 %	33599043
1123	NC_002927	TGG	2	6	46614	46619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599044
1124	NC_002927	CATC	2	8	46788	46795	25 %	25 %	0 %	50 %	33599044
1125	NC_002927	GGT	3	9	46813	46821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599044
1126	NC_002927	AAGA	2	8	46841	46848	75 %	0 %	25 %	0 %	33599044
1127	NC_002927	GGCC	2	8	46855	46862	0 %	0 %	50 %	50 %	33599044
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1129	NC_002927	TCG	2	6	47100	47105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599044
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1240	NC_002927	CCG	2	6	52058	52063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1246	NC_002927	CTGT	2	8	52246	52253	0 %	50 %	25 %	25 %	33599053
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1253	NC_002927	ATG	2	6	52472	52477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33599054
1254	NC_002927	GCCGC	2	10	52524	52533	0 %	0 %	40 %	60 %	33599054
1255	NC_002927	GCTG	2	8	52545	52552	0 %	25 %	50 %	25 %	33599054
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