MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella bronchiseptica RB50 chromosome

Total Repeats: 153496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002927	GGC	2	6	21011	21016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599010
502	NC_002927	GGA	2	6	21071	21076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33599010
503	NC_002927	CCTG	2	8	21078	21085	0 %	25 %	25 %	50 %	33599010
504	NC_002927	CG	3	6	21088	21093	0 %	0 %	50 %	50 %	33599010
505	NC_002927	GACA	2	8	21101	21108	50 %	0 %	25 %	25 %	33599010
506	NC_002927	GCC	3	9	21148	21156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599010
507	NC_002927	GCG	2	6	21162	21167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599010
508	NC_002927	ACG	2	6	21184	21189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599010
509	NC_002927	GC	3	6	21242	21247	0 %	0 %	50 %	50 %	33599010
510	NC_002927	GAGCCG	2	12	21327	21338	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	33599010
511	NC_002927	CCG	2	6	21340	21345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599010
512	NC_002927	CCG	2	6	21372	21377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599010
513	NC_002927	CGA	2	6	21383	21388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599010
514	NC_002927	CGA	2	6	21395	21400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599010
515	NC_002927	CGG	2	6	21421	21426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599010
516	NC_002927	GCA	2	6	21430	21435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599010
517	NC_002927	TGG	2	6	21486	21491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599010
518	NC_002927	GCG	2	6	21514	21519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599010
519	NC_002927	GAC	2	6	21542	21547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599010
520	NC_002927	GCC	2	6	21590	21595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599010
521	NC_002927	GCC	2	6	21597	21602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599010
522	NC_002927	GCGCC	2	10	21604	21613	0 %	0 %	40 %	60 %	33599010
523	NC_002927	GCG	2	6	21622	21627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599010
524	NC_002927	GCC	2	6	21659	21664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599010
525	NC_002927	GGCGCA	2	12	21665	21676	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	33599010
526	NC_002927	CGC	2	6	21689	21694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599010
527	NC_002927	GCC	2	6	21753	21758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599010
528	NC_002927	GCG	2	6	21839	21844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599010
529	NC_002927	GCCC	2	8	21853	21860	0 %	0 %	25 %	75 %	33599010
530	NC_002927	GTC	2	6	21897	21902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599010
531	NC_002927	GCC	2	6	21920	21925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599010
532	NC_002927	CACG	2	8	21971	21978	25 %	0 %	25 %	50 %	33599010
533	NC_002927	GCA	2	6	22034	22039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599011
534	NC_002927	CGG	2	6	22052	22057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599011
535	NC_002927	TGA	2	6	22079	22084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33599011
536	NC_002927	CGGCC	2	10	22088	22097	0 %	0 %	40 %	60 %	33599011
537	NC_002927	GCC	2	6	22146	22151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599011
538	NC_002927	TTCG	2	8	22155	22162	0 %	50 %	25 %	25 %	33599011
539	NC_002927	CGG	2	6	22166	22171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599011
540	NC_002927	CG	3	6	22178	22183	0 %	0 %	50 %	50 %	33599011
541	NC_002927	CGT	2	6	22232	22237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599011
542	NC_002927	CACG	2	8	22268	22275	25 %	0 %	25 %	50 %	33599011
543	NC_002927	CGGA	2	8	22298	22305	25 %	0 %	50 %	25 %	33599011
544	NC_002927	CAG	2	6	22326	22331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599011
545	NC_002927	GCA	2	6	22349	22354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599011
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547	NC_002927	CG	6	12	22415	22426	0 %	0 %	50 %	50 %	33599011
548	NC_002927	TCG	2	6	22441	22446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599011
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550	NC_002927	CG	3	6	22506	22511	0 %	0 %	50 %	50 %	33599011
551	NC_002927	TCG	2	6	22528	22533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599011
552	NC_002927	CTG	2	6	22587	22592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599011
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554	NC_002927	GCG	2	6	22646	22651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599011
555	NC_002927	CG	3	6	22650	22655	0 %	0 %	50 %	50 %	33599011
556	NC_002927	TCG	2	6	22759	22764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599011
557	NC_002927	GC	3	6	22775	22780	0 %	0 %	50 %	50 %	33599011
558	NC_002927	GCG	2	6	22856	22861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599011
559	NC_002927	TCG	2	6	22900	22905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599011
560	NC_002927	GC	3	6	22912	22917	0 %	0 %	50 %	50 %	33599011
561	NC_002927	CGG	2	6	22928	22933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599011
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567	NC_002927	GCGTC	2	10	23033	23042	0 %	20 %	40 %	40 %	33599011
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569	NC_002927	CAG	2	6	23145	23150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599011
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612	NC_002927	CAC	2	6	24559	24564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33599012
613	NC_002927	CG	3	6	24582	24587	0 %	0 %	50 %	50 %	33599012
614	NC_002927	TA	3	6	24598	24603	50 %	50 %	0 %	0 %	33599012
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618	NC_002927	G	6	6	24678	24683	0 %	0 %	100 %	0 %	33599012
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620	NC_002927	CGGCG	2	10	24769	24778	0 %	0 %	60 %	40 %	33599012
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625	NC_002927	GGC	2	6	25015	25020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599012
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629	NC_002927	ACC	2	6	25175	25180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33599012
630	NC_002927	GCC	2	6	25190	25195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599012
631	NC_002927	GTC	2	6	25255	25260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599012
632	NC_002927	GACC	2	8	25282	25289	25 %	0 %	25 %	50 %	33599012
633	NC_002927	TGCT	2	8	25314	25321	0 %	50 %	25 %	25 %	33599012
634	NC_002927	TC	3	6	25365	25370	0 %	50 %	0 %	50 %	33599012
635	NC_002927	GGGCT	2	10	25384	25393	0 %	20 %	60 %	20 %	33599012
636	NC_002927	TC	3	6	25464	25469	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
637	NC_002927	GTC	2	6	25479	25484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599013
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655	NC_002927	CG	3	6	26277	26282	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
656	NC_002927	TCG	2	6	26292	26297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
657	NC_002927	GC	4	8	26507	26514	0 %	0 %	50 %	50 %	33599014
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752	NC_002927	CTT	2	6	30581	30586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33599019
753	NC_002927	GC	3	6	30617	30622	0 %	0 %	50 %	50 %	33599019
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759	NC_002927	TGA	2	6	30829	30834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33599019
760	NC_002927	GAC	2	6	30867	30872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599019
761	NC_002927	CGG	2	6	30997	31002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599019
762	NC_002927	GAC	2	6	31026	31031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599019
763	NC_002927	AGCGC	2	10	31048	31057	20 %	0 %	40 %	40 %	33599019
764	NC_002927	CGA	2	6	31058	31063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599019
765	NC_002927	TGA	2	6	31096	31101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33599019
766	NC_002927	AAGA	2	8	31191	31198	75 %	0 %	25 %	0 %	33599019
767	NC_002927	GTC	2	6	31207	31212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599019
768	NC_002927	TGC	2	6	31213	31218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599019
769	NC_002927	ATGC	2	8	31221	31228	25 %	25 %	25 %	25 %	33599019
770	NC_002927	AAC	2	6	31230	31235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33599019
771	NC_002927	CGC	2	6	31271	31276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599019
772	NC_002927	GTG	2	6	31278	31283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599019
773	NC_002927	CAC	2	6	31298	31303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33599019
774	NC_002927	CGT	2	6	31453	31458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599019
775	NC_002927	CGA	2	6	31472	31477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599019
776	NC_002927	CAT	2	6	31493	31498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33599019
777	NC_002927	CGT	2	6	31545	31550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599019
778	NC_002927	CGA	2	6	31619	31624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599019
779	NC_002927	GCGGCC	2	12	31654	31665	0 %	0 %	50 %	50 %	33599019
780	NC_002927	GTG	2	6	31677	31682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599019
781	NC_002927	GCG	2	6	31708	31713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599019
782	NC_002927	GCG	2	6	31741	31746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599019
783	NC_002927	CG	3	6	31753	31758	0 %	0 %	50 %	50 %	33599019
784	NC_002927	CGG	2	6	31768	31773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599019
785	NC_002927	TTC	2	6	31851	31856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33599019
786	NC_002927	CGAA	2	8	31879	31886	50 %	0 %	25 %	25 %	33599019
787	NC_002927	GCT	2	6	31902	31907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599019
788	NC_002927	AAGG	2	8	31920	31927	50 %	0 %	50 %	0 %	33599019
789	NC_002927	CTG	2	6	31950	31955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599019
790	NC_002927	GAT	2	6	31961	31966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33599019
791	NC_002927	GTC	2	6	32021	32026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599019
792	NC_002927	CCG	2	6	32027	32032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599019
793	NC_002927	GAC	2	6	32052	32057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599019
794	NC_002927	CGG	3	9	32063	32071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599019
795	NC_002927	CCA	2	6	32119	32124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33599019
796	NC_002927	CGC	2	6	32216	32221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599019
797	NC_002927	AAGT	2	8	32229	32236	50 %	25 %	25 %	0 %	33599019
798	NC_002927	CGC	2	6	32243	32248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
799	NC_002927	CAA	2	6	32272	32277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
800	NC_002927	ACG	2	6	32386	32391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599020
801	NC_002927	CGG	2	6	32396	32401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599020
802	NC_002927	ACG	2	6	32407	32412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599020
803	NC_002927	CGG	2	6	32430	32435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599020
804	NC_002927	GAGACG	2	12	32521	32532	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	33599020
805	NC_002927	GAA	2	6	32577	32582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33599020
806	NC_002927	TGC	2	6	32595	32600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599020
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809	NC_002927	CAT	2	6	32700	32705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33599020
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817	NC_002927	GAAATC	2	12	33040	33051	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	33599020
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820	NC_002927	GGCG	2	8	33126	33133	0 %	0 %	75 %	25 %	33599020
821	NC_002927	TGC	2	6	33149	33154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599020
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824	NC_002927	CGG	2	6	33350	33355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599020
825	NC_002927	TGC	2	6	33368	33373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599020
826	NC_002927	GCT	2	6	33402	33407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599020
827	NC_002927	GAA	2	6	33424	33429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33599020
828	NC_002927	CGT	2	6	33477	33482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599020
829	NC_002927	ATC	2	6	33490	33495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33599020
830	NC_002927	CGC	2	6	33531	33536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
831	NC_002927	GATC	2	8	33615	33622	25 %	25 %	25 %	25 %	33599021
832	NC_002927	CGT	2	6	33703	33708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599021
833	NC_002927	ACG	2	6	33710	33715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599021
834	NC_002927	TGC	2	6	33716	33721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599021
835	NC_002927	CAA	2	6	33735	33740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33599021
836	NC_002927	CG	3	6	33746	33751	0 %	0 %	50 %	50 %	33599021
837	NC_002927	CGTCGA	2	12	33849	33860	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	33599021
838	NC_002927	GA	3	6	34078	34083	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
839	NC_002927	GC	4	8	34092	34099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
840	NC_002927	GCC	2	6	34105	34110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
841	NC_002927	GCG	2	6	34141	34146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
842	NC_002927	ACGCCC	2	12	34246	34257	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	161609283
843	NC_002927	GCC	2	6	34258	34263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161609283
844	NC_002927	TGG	2	6	34277	34282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161609283
845	NC_002927	GGA	2	6	34314	34319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161609283
846	NC_002927	AAC	2	6	34357	34362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161609283
847	NC_002927	CAAGT	2	10	34372	34381	40 %	20 %	20 %	20 %	161609283
848	NC_002927	GCC	2	6	34402	34407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161609283
849	NC_002927	CGC	2	6	34429	34434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161609283
850	NC_002927	CG	3	6	34439	34444	0 %	0 %	50 %	50 %	161609283
851	NC_002927	CGC	2	6	34530	34535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161609283
852	NC_002927	CAG	2	6	34588	34593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161609283
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854	NC_002927	CTG	2	6	34831	34836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161609283
855	NC_002927	CGG	2	6	34866	34871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161609283
856	NC_002927	AAG	2	6	34909	34914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161609283
857	NC_002927	GTAA	2	8	34920	34927	50 %	25 %	25 %	0 %	161609283
858	NC_002927	GTG	2	6	35030	35035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33599023
859	NC_002927	CCA	2	6	35100	35105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33599023
860	NC_002927	TCG	2	6	35156	35161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599023
861	NC_002927	CG	3	6	35183	35188	0 %	0 %	50 %	50 %	33599023
862	NC_002927	GAA	2	6	35204	35209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33599023
863	NC_002927	CAA	2	6	35227	35232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33599023
864	NC_002927	CGT	2	6	35296	35301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599023
865	NC_002927	GCTG	2	8	35335	35342	0 %	25 %	50 %	25 %	33599023
866	NC_002927	GCCTGG	2	12	35358	35369	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	33599023
867	NC_002927	ATC	2	6	35381	35386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33599023
868	NC_002927	GAG	2	6	35528	35533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33599023
869	NC_002927	CTG	2	6	35683	35688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599024
870	NC_002927	GTC	2	6	35762	35767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599024
871	NC_002927	GCC	2	6	35873	35878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599025
872	NC_002927	GTC	2	6	35893	35898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599025
873	NC_002927	CGCTG	2	10	35928	35937	0 %	20 %	40 %	40 %	33599025
874	NC_002927	GAA	2	6	35943	35948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33599025
875	NC_002927	AAC	3	9	35968	35976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33599025
876	NC_002927	GGC	2	6	36001	36006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33599025
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878	NC_002927	CAA	2	6	36045	36050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33599025
879	NC_002927	CTG	2	6	36115	36120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33599025
880	NC_002927	CAT	2	6	36147	36152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33599025
881	NC_002927	CGCGC	2	10	36153	36162	0 %	0 %	40 %	60 %	33599025
882	NC_002927	ACG	2	6	36253	36258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33599025
883	NC_002927	CGGC	2	8	36308	36315	0 %	0 %	50 %	50 %	33599025
884	NC_002927	CCG	2	6	36320	36325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33599025
885	NC_002927	CCA	2	6	36407	36412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33599025
886	NC_002927	GAA	2	6	36430	36435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33599025
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