MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Buchnera aphidicola str. APS (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 20901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002528	TAT	2	6	16075	16080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616645
502	NC_002528	TGCG	2	8	16134	16141	0 %	25 %	50 %	25 %	15616645
503	NC_002528	AAC	2	6	16188	16193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15616645
504	NC_002528	TA	3	6	16218	16223	50 %	50 %	0 %	0 %	15616645
505	NC_002528	A	6	6	16223	16228	100 %	0 %	0 %	0 %	15616645
506	NC_002528	A	6	6	16230	16235	100 %	0 %	0 %	0 %	15616645
507	NC_002528	TAT	2	6	16295	16300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616645
508	NC_002528	T	6	6	16336	16341	0 %	100 %	0 %	0 %	15616645
509	NC_002528	CCTG	2	8	16384	16391	0 %	25 %	25 %	50 %	15616645
510	NC_002528	T	6	6	16412	16417	0 %	100 %	0 %	0 %	15616645
511	NC_002528	TCT	2	6	16430	16435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15616645
512	NC_002528	A	7	7	16461	16467	100 %	0 %	0 %	0 %	15616645
513	NC_002528	T	8	8	16502	16509	0 %	100 %	0 %	0 %	15616645
514	NC_002528	TA	3	6	16538	16543	50 %	50 %	0 %	0 %	15616645
515	NC_002528	TAT	2	6	16561	16566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616645
516	NC_002528	ACA	2	6	16567	16572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15616645
517	NC_002528	TATCT	2	10	16579	16588	20 %	60 %	0 %	20 %	15616645
518	NC_002528	A	7	7	16596	16602	100 %	0 %	0 %	0 %	15616645
519	NC_002528	AT	4	8	16626	16633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_002528	ATG	2	6	16648	16653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28952039
521	NC_002528	CTAG	2	8	16771	16778	25 %	25 %	25 %	25 %	28952039
522	NC_002528	AAT	2	6	16810	16815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28952039
523	NC_002528	CTC	2	6	16853	16858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28952039
524	NC_002528	TAA	2	6	16910	16915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28952039
525	NC_002528	TAA	2	6	16925	16930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28952039
526	NC_002528	TAA	2	6	16947	16952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28952039
527	NC_002528	T	6	6	16992	16997	0 %	100 %	0 %	0 %	28952039
528	NC_002528	GAT	2	6	17035	17040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28952039
529	NC_002528	TTAA	2	8	17041	17048	50 %	50 %	0 %	0 %	28952039
530	NC_002528	T	7	7	17106	17112	0 %	100 %	0 %	0 %	28952039
531	NC_002528	TGA	2	6	17123	17128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28952039
532	NC_002528	ATT	2	6	17134	17139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28952039
533	NC_002528	AGA	3	9	17178	17186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28952039
534	NC_002528	ATTAAT	2	12	17188	17199	50 %	50 %	0 %	0 %	28952039
535	NC_002528	TAAT	2	8	17210	17217	50 %	50 %	0 %	0 %	28952039
536	NC_002528	A	7	7	17296	17302	100 %	0 %	0 %	0 %	28952039
537	NC_002528	TTA	2	6	17341	17346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28952039
538	NC_002528	TAC	2	6	17394	17399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28952039
539	NC_002528	TCT	2	6	17406	17411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28952039
540	NC_002528	AATT	2	8	17447	17454	50 %	50 %	0 %	0 %	28952039
541	NC_002528	CAG	2	6	17459	17464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28952039
542	NC_002528	GAT	2	6	17479	17484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28952039
543	NC_002528	CAAAA	2	10	17576	17585	80 %	0 %	0 %	20 %	28952039
544	NC_002528	A	9	9	17582	17590	100 %	0 %	0 %	0 %	28952039
545	NC_002528	TGA	2	6	17595	17600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28952039
546	NC_002528	TAAA	2	8	17648	17655	75 %	25 %	0 %	0 %	28952039
547	NC_002528	TAA	2	6	17663	17668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28952039
548	NC_002528	TTA	2	6	17708	17713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28952039
549	NC_002528	ATA	2	6	17761	17766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28952039
550	NC_002528	A	7	7	17774	17780	100 %	0 %	0 %	0 %	28952039
551	NC_002528	AAT	2	6	17785	17790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28952039
552	NC_002528	TCG	3	9	17808	17816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28952039
553	NC_002528	AAC	2	6	17825	17830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28952039
554	NC_002528	GA	3	6	17874	17879	50 %	0 %	50 %	0 %	28952039
555	NC_002528	TAT	2	6	17916	17921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28952039
556	NC_002528	AAGT	2	8	17922	17929	50 %	25 %	25 %	0 %	28952039
557	NC_002528	ATA	2	6	17941	17946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28952039
558	NC_002528	TTA	2	6	17968	17973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28952039
559	NC_002528	AAAT	2	8	18004	18011	75 %	25 %	0 %	0 %	28952039
560	NC_002528	ACC	2	6	18048	18053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_002528	T	7	7	18102	18108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_002528	ATC	2	6	18116	18121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_002528	TGT	2	6	18132	18137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_002528	T	6	6	18143	18148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_002528	T	6	6	18159	18164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_002528	ATATTT	2	12	18165	18176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_002528	T	7	7	18182	18188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_002528	A	8	8	18189	18196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_002528	T	6	6	18201	18206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_002528	TAAA	2	8	18233	18240	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_002528	A	7	7	18238	18244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_002528	A	7	7	18246	18252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_002528	TAA	2	6	18275	18280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_002528	ATTAA	2	10	18311	18320	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_002528	A	6	6	18322	18327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_002528	T	6	6	18331	18336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_002528	AAT	2	6	18339	18344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_002528	ATT	2	6	18353	18358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_002528	AAG	2	6	18419	18424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15616647
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581	NC_002528	CTG	2	6	18464	18469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15616647
582	NC_002528	TGT	2	6	18564	18569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15616647
583	NC_002528	A	6	6	18602	18607	100 %	0 %	0 %	0 %	15616647
584	NC_002528	GAA	2	6	18616	18621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15616647
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589	NC_002528	GCA	2	6	18964	18969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15616648
590	NC_002528	ATT	2	6	18993	18998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616648
591	NC_002528	AGC	2	6	19035	19040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15616648
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593	NC_002528	TTA	2	6	19235	19240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616648
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595	NC_002528	TATC	2	8	19309	19316	25 %	50 %	0 %	25 %	15616648
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598	NC_002528	A	7	7	19387	19393	100 %	0 %	0 %	0 %	15616648
599	NC_002528	ATTA	2	8	19455	19462	50 %	50 %	0 %	0 %	15616648
600	NC_002528	TAG	2	6	19499	19504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15616648
601	NC_002528	GCA	2	6	19534	19539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15616648
602	NC_002528	TCG	2	6	19563	19568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15616648
603	NC_002528	TGG	2	6	19602	19607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15616648
604	NC_002528	GAA	2	6	19621	19626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15616648
605	NC_002528	AGA	2	6	19656	19661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15616648
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607	NC_002528	TAT	2	6	19707	19712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616648
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610	NC_002528	GAAA	2	8	19881	19888	75 %	0 %	25 %	0 %	15616648
611	NC_002528	A	8	8	19886	19893	100 %	0 %	0 %	0 %	15616648
612	NC_002528	AGA	2	6	19935	19940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15616648
613	NC_002528	GGT	2	6	19957	19962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15616648
614	NC_002528	GAA	2	6	20092	20097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15616648
615	NC_002528	ACAA	2	8	20110	20117	75 %	0 %	0 %	25 %	15616648
616	NC_002528	TGA	2	6	20160	20165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15616648
617	NC_002528	TGC	2	6	20232	20237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15616648
618	NC_002528	AGA	2	6	20292	20297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15616648
619	NC_002528	TCT	2	6	20302	20307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15616648
620	NC_002528	TTC	2	6	20316	20321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15616648
621	NC_002528	CAG	2	6	20324	20329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15616648
622	NC_002528	ATG	2	6	20353	20358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15616648
623	NC_002528	TAA	2	6	20359	20364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15616648
624	NC_002528	TTTAT	2	10	20369	20378	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_002528	T	6	6	20384	20389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_002528	T	6	6	20438	20443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_002528	ATT	2	6	20463	20468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_002528	AAAT	2	8	20478	20485	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_002528	TAA	2	6	20502	20507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_002528	AAT	2	6	20516	20521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_002528	AT	3	6	20544	20549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_002528	A	9	9	20566	20574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_002528	T	7	7	20583	20589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_002528	TAT	2	6	20597	20602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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636	NC_002528	T	6	6	20648	20653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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