MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp54

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001857	ATTTTT	2	12	90	101	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001857	AAAAAT	2	12	107	118	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001857	ATTAAT	2	12	579	590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_001857	ATTAAT	2	12	669	680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_001857	AATTAA	2	12	1168	1179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_001857	TTAAAC	2	12	1641	1652	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	11496894
7	NC_001857	CTGTAT	2	12	3712	3723	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	11496896
8	NC_001857	AAATTT	2	12	4550	4561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_001857	CTTAAG	2	12	4622	4633	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_001857	TAAAAA	2	12	4653	4664	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_001857	ACAATA	2	12	5587	5598	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	11496898
12	NC_001857	ATTGAG	2	12	6117	6128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496899
13	NC_001857	AAAAGT	2	12	10947	10958	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	365823348
14	NC_001857	GAAAAA	2	12	12063	12074	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_001857	AAAAAC	2	12	12546	12557	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_001857	AAAGCA	2	12	13018	13029	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	11496913
17	NC_001857	GATAAA	2	12	14343	14354	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	11496915
18	NC_001857	TAAAGA	2	12	14493	14504	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	11496915
19	NC_001857	TAACTT	2	12	15849	15860	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_001857	TTTTTA	2	12	17115	17126	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	11496911
21	NC_001857	TTAAAT	2	12	17285	17296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_001857	TTTTAT	2	12	17422	17433	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_001857	TTCCAA	2	12	23165	23176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496929
24	NC_001857	TCTTTT	2	12	24460	24471	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_001857	ATCAAA	2	12	24671	24682	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	11496966
26	NC_001857	TTTTTA	2	12	25091	25102	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	11496966
27	NC_001857	TGAAGA	2	12	25746	25757	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	365823351
28	NC_001857	ATTATG	2	12	25937	25948	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	365823351
29	NC_001857	GTTTTA	2	12	30575	30586	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	11496921
30	NC_001857	GCTTAA	2	12	31671	31682	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	11496945
31	NC_001857	TTCCAA	2	12	31907	31918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496946
32	NC_001857	AAAAAG	2	12	33808	33819	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_001857	AAATTC	2	12	33910	33921	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_001857	TACAAA	2	12	34594	34605	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	11496950
35	NC_001857	AAATAT	2	12	35309	35320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496904
36	NC_001857	ACAAAA	2	12	35334	35345	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	11496904
37	NC_001857	CTTTTT	2	12	38128	38139	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_001857	TTTGGG	2	12	38369	38380	0 %	50 %	50 %	0 %	11496937
39	NC_001857	GTATTA	2	12	38564	38575	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	11496937
40	NC_001857	AAAATT	2	12	39565	39576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_001857	ATTAAT	2	12	41082	41093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_001857	GTTTAA	2	12	41371	41382	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_001857	ATTGAT	2	12	42201	42212	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_001857	ATTAAA	2	12	42551	42562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_001857	CTTTGT	2	12	44443	44454	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	11496951
46	NC_001857	TTGTCA	2	12	45751	45762	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	11496923
47	NC_001857	TTTAAA	2	12	46323	46334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_001857	AATATA	2	12	51241	51252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_001857	TTGTTT	2	12	51452	51463	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_001857	GGAATT	2	12	52221	52232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496925

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.