MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp38

Total Repeats: 136

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001856	CTTC	2	8	25	32	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_001856	TAAT	2	8	419	426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001856	CTTT	2	8	3633	3640	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_001856	TTAT	2	8	3655	3662	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_001856	TCTT	2	8	3708	3715	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_001856	AATT	2	8	3908	3915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_001856	TTAT	2	8	4135	4142	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_001856	TATT	2	8	4283	4290	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_001856	TTTC	2	8	4371	4378	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_001856	TTTA	2	8	4455	4462	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_001856	CAAA	2	8	4478	4485	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_001856	ATTA	2	8	4498	4505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_001856	ACCA	2	8	4899	4906	50 %	0 %	0 %	50 %	11496844
14	NC_001856	GTAT	2	8	5048	5055	25 %	50 %	25 %	0 %	11496844
15	NC_001856	CTTT	2	8	5270	5277	0 %	75 %	0 %	25 %	11496844
16	NC_001856	TAAA	2	8	5369	5376	75 %	25 %	0 %	0 %	11496844
17	NC_001856	GCTA	2	8	5766	5773	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_001856	TAAA	3	12	6860	6871	75 %	25 %	0 %	0 %	11496832
19	NC_001856	AAGG	2	8	6882	6889	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_001856	TCCT	2	8	6913	6920	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_001856	TTAA	2	8	6935	6942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_001856	TACT	2	8	7033	7040	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_001856	TAAT	2	8	7220	7227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_001856	ATCT	2	8	7651	7658	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_001856	TTAA	2	8	8124	8131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_001856	ATGT	2	8	8187	8194	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_001856	CAAA	2	8	8336	8343	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_001856	GCTT	2	8	8490	8497	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_001856	AATA	2	8	8761	8768	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_001856	CTAT	2	8	9173	9180	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_001856	TATT	2	8	9289	9296	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_001856	ATAA	2	8	9303	9310	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_001856	TTTA	2	8	9373	9380	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_001856	TGAA	2	8	9418	9425	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_001856	AAAT	2	8	9432	9439	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_001856	TTTA	2	8	9685	9692	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_001856	TATT	2	8	9926	9933	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_001856	TAAA	3	12	10191	10202	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_001856	AATA	2	8	10203	10210	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_001856	CTTT	2	8	11992	11999	0 %	75 %	0 %	25 %	11496836
41	NC_001856	CCAT	2	8	12144	12151	25 %	25 %	0 %	50 %	11496836
42	NC_001856	TAAA	2	8	12197	12204	75 %	25 %	0 %	0 %	11496836
43	NC_001856	TTCT	2	8	12350	12357	0 %	75 %	0 %	25 %	11496836
44	NC_001856	TTTA	2	8	12366	12373	25 %	75 %	0 %	0 %	11496836
45	NC_001856	TAAT	2	8	13340	13347	50 %	50 %	0 %	0 %	11496837
46	NC_001856	CTTT	2	8	14426	14433	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_001856	TTAA	2	8	14574	14581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_001856	TATT	2	8	14688	14695	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_001856	ATTT	2	8	14997	15004	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_001856	ATTT	2	8	15317	15324	25 %	75 %	0 %	0 %	364556753
51	NC_001856	ATTT	2	8	15385	15392	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_001856	ATTT	2	8	15529	15536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_001856	TTAA	2	8	15886	15893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_001856	ATAA	2	8	16021	16028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_001856	TCAC	2	8	16123	16130	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_001856	AATA	2	8	16210	16217	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_001856	TAAA	2	8	16329	16336	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_001856	GTTT	2	8	16371	16378	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_001856	ATTT	2	8	16445	16452	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_001856	GAAG	2	8	16787	16794	50 %	0 %	50 %	0 %	364556748
61	NC_001856	AAGC	2	8	16966	16973	50 %	0 %	25 %	25 %	364556748
62	NC_001856	AAAG	2	8	17207	17214	75 %	0 %	25 %	0 %	364556748
63	NC_001856	CTTA	2	8	17650	17657	25 %	50 %	0 %	25 %	11496868
64	NC_001856	TTCT	2	8	18155	18162	0 %	75 %	0 %	25 %	11496868
65	NC_001856	GCTT	2	8	18459	18466	0 %	50 %	25 %	25 %	364556749
66	NC_001856	GGTT	2	8	18561	18568	0 %	50 %	50 %	0 %	364556749
67	NC_001856	TCTT	2	8	18748	18755	0 %	75 %	0 %	25 %	364556749
68	NC_001856	ATTT	2	8	19052	19059	25 %	75 %	0 %	0 %	364556749
69	NC_001856	AATG	2	8	19537	19544	50 %	25 %	25 %	0 %	11496838
70	NC_001856	GAAA	2	8	20174	20181	75 %	0 %	25 %	0 %	364556750
71	NC_001856	ATAG	2	8	20262	20269	50 %	25 %	25 %	0 %	364556750
72	NC_001856	TATT	2	8	20857	20864	25 %	75 %	0 %	0 %	364556750
73	NC_001856	AATG	2	8	21215	21222	50 %	25 %	25 %	0 %	364556750
74	NC_001856	TCAA	2	8	21651	21658	50 %	25 %	0 %	25 %	364556745
75	NC_001856	TAGG	2	8	22290	22297	25 %	25 %	50 %	0 %	364556746
76	NC_001856	AAAG	2	8	22430	22437	75 %	0 %	25 %	0 %	364556746
77	NC_001856	AGAT	2	8	23098	23105	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_001856	GATA	2	8	23188	23195	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_001856	TAAG	2	8	23448	23455	50 %	25 %	25 %	0 %	11496853
80	NC_001856	AAAT	2	8	23733	23740	75 %	25 %	0 %	0 %	11496853
81	NC_001856	AAAG	2	8	23785	23792	75 %	0 %	25 %	0 %	11496853
82	NC_001856	GCTT	2	8	24067	24074	0 %	50 %	25 %	25 %	11496853
83	NC_001856	TAAA	2	8	24341	24348	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_001856	TAAA	2	8	24351	24358	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_001856	ACAA	2	8	24408	24415	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_001856	CCTT	2	8	24565	24572	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_001856	ATAG	2	8	24674	24681	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_001856	AAAT	2	8	25156	25163	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_001856	AAAT	2	8	25256	25263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_001856	TTAT	3	12	25333	25344	25 %	75 %	0 %	0 %	11496856
91	NC_001856	AGAA	2	8	25670	25677	75 %	0 %	25 %	0 %	11496856
92	NC_001856	ATTT	2	8	26429	26436	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_001856	TAAA	2	8	26445	26452	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_001856	TAAG	2	8	26698	26705	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_001856	GCTT	2	8	27221	27228	0 %	50 %	25 %	25 %	11496858
96	NC_001856	GGCT	2	8	27285	27292	0 %	25 %	50 %	25 %	11496858
97	NC_001856	AGCA	2	8	27820	27827	50 %	0 %	25 %	25 %	11496858
98	NC_001856	TTGT	2	8	27886	27893	0 %	75 %	25 %	0 %	11496858
99	NC_001856	AGCA	2	8	28108	28115	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_001856	AGAA	2	8	28483	28490	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_001856	CTTA	2	8	28536	28543	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_001856	CTTA	2	8	28589	28596	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_001856	TTAT	2	8	28739	28746	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_001856	TTTC	2	8	29165	29172	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_001856	ATTT	2	8	29765	29772	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_001856	TTAG	2	8	31419	31426	25 %	50 %	25 %	0 %	11496873
107	NC_001856	AAAG	2	8	31560	31567	75 %	0 %	25 %	0 %	11496873
108	NC_001856	AGAT	2	8	32228	32235	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_001856	GATA	2	8	32318	32325	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_001856	TAAG	2	8	32578	32585	50 %	25 %	25 %	0 %	11496875
111	NC_001856	AAAT	2	8	32863	32870	75 %	25 %	0 %	0 %	11496875
112	NC_001856	AAAG	2	8	32915	32922	75 %	0 %	25 %	0 %	11496875
113	NC_001856	GCTT	2	8	33197	33204	0 %	50 %	25 %	25 %	11496875
114	NC_001856	ATTA	2	8	33241	33248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_001856	TAAA	2	8	33472	33479	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_001856	TAAA	2	8	33482	33489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_001856	ACAA	2	8	33539	33546	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_001856	CCTT	2	8	33696	33703	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_001856	AAAT	2	8	33920	33927	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_001856	TGTA	2	8	34287	34294	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_001856	TATT	2	8	34767	34774	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_001856	TAAA	2	8	35037	35044	75 %	25 %	0 %	0 %	11496877
123	NC_001856	CTAT	2	8	35435	35442	25 %	50 %	0 %	25 %	11496877
124	NC_001856	CAAA	2	8	35504	35511	75 %	0 %	0 %	25 %	11496877
125	NC_001856	TTGT	2	8	35975	35982	0 %	75 %	25 %	0 %	364556751
126	NC_001856	TAAA	2	8	35998	36005	75 %	25 %	0 %	0 %	364556751
127	NC_001856	AATA	2	8	36163	36170	75 %	25 %	0 %	0 %	364556751
128	NC_001856	TAGC	2	8	36201	36208	25 %	25 %	25 %	25 %	364556751
129	NC_001856	AAAT	2	8	36256	36263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_001856	AGCT	2	8	36406	36413	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_001856	AAAT	2	8	36415	36422	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_001856	AATT	2	8	36732	36739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_001856	AATA	2	8	37366	37373	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_001856	ATCA	2	8	38392	38399	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_001856	AAAT	2	8	38632	38639	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_001856	TATT	2	8	38784	38791	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.