MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp38

Total Repeats: 576

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001856	AAT	3	9	54	62	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001856	ATT	3	9	97	105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001856	AAT	2	6	181	186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_001856	GTA	2	6	198	203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_001856	TAC	2	6	221	226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_001856	CAG	2	6	252	257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_001856	CAA	2	6	338	343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_001856	TTA	2	6	407	412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_001856	ATT	2	6	431	436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_001856	TAT	2	6	446	451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_001856	AAT	2	6	560	565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_001856	GAA	2	6	588	593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_001856	TAA	2	6	598	603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_001856	TGA	2	6	625	630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_001856	AGA	3	9	686	694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_001856	CAT	2	6	745	750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_001856	ATA	2	6	766	771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_001856	CCT	2	6	881	886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_001856	TTA	2	6	939	944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_001856	ATT	2	6	1016	1021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_001856	TTA	2	6	1062	1067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_001856	ACA	2	6	1167	1172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_001856	ACT	2	6	1280	1285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_001856	TAG	2	6	1312	1317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_001856	TAA	2	6	1331	1336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_001856	ATA	2	6	1378	1383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_001856	TAA	2	6	1418	1423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_001856	TAT	2	6	1453	1458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_001856	TAA	3	9	1467	1475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_001856	ATT	3	9	1493	1501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_001856	ATA	2	6	1540	1545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_001856	TAT	2	6	1614	1619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_001856	GCA	2	6	1691	1696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_001856	ATT	3	9	1858	1866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_001856	TTA	2	6	1988	1993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_001856	CTT	2	6	2037	2042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_001856	AGA	2	6	2371	2376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_001856	ATG	2	6	2427	2432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_001856	TTC	2	6	2684	2689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_001856	TGT	2	6	2693	2698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_001856	ACT	2	6	2793	2798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_001856	ACT	2	6	2849	2854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_001856	ATT	2	6	2957	2962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_001856	TAA	2	6	3045	3050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_001856	ACT	2	6	3232	3237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_001856	ATA	2	6	3343	3348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_001856	ATC	2	6	3352	3357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_001856	CTA	2	6	3370	3375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_001856	TAA	2	6	3385	3390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_001856	ATT	2	6	3489	3494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_001856	TAT	2	6	3509	3514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_001856	ATT	2	6	3538	3543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_001856	TTA	2	6	3578	3583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_001856	TAA	2	6	3678	3683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_001856	ATA	2	6	3701	3706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_001856	TTA	2	6	3815	3820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_001856	ATT	2	6	3827	3832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_001856	AGA	2	6	3874	3879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_001856	TAA	2	6	3887	3892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_001856	ATA	2	6	3987	3992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_001856	TTA	2	6	4062	4067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_001856	TAT	2	6	4152	4157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_001856	ATC	2	6	4248	4253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_001856	GAA	2	6	4332	4337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_001856	AAC	2	6	4358	4363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_001856	TAG	2	6	4389	4394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_001856	TAA	2	6	4426	4431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_001856	ATT	4	12	4509	4520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_001856	TAA	2	6	4638	4643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496844
70	NC_001856	GTA	2	6	4682	4687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496844
71	NC_001856	TAA	2	6	4707	4712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496844
72	NC_001856	AAG	2	6	4727	4732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496844
73	NC_001856	ACT	2	6	4816	4821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496844
74	NC_001856	TCC	2	6	4844	4849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11496844
75	NC_001856	TAA	2	6	4884	4889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496844
76	NC_001856	CTA	2	6	4961	4966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496844
77	NC_001856	GAA	2	6	4969	4974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496844
78	NC_001856	TTA	2	6	5012	5017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496844
79	NC_001856	TAA	2	6	5078	5083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496844
80	NC_001856	AAT	2	6	5086	5091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496844
81	NC_001856	ATG	2	6	5096	5101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496844
82	NC_001856	CAT	2	6	5129	5134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496844
83	NC_001856	TAA	2	6	5135	5140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496844
84	NC_001856	AAT	2	6	5191	5196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496844
85	NC_001856	TGA	2	6	5217	5222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496844
86	NC_001856	ATT	2	6	5311	5316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496844
87	NC_001856	AGA	2	6	5379	5384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496844
88	NC_001856	CTT	3	9	5405	5413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496844
89	NC_001856	GAA	2	6	5435	5440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496844
90	NC_001856	CTT	2	6	5542	5547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_001856	TCA	2	6	5621	5626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_001856	AAT	2	6	5637	5642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_001856	ATT	2	6	5680	5685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_001856	ATT	2	6	5704	5709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_001856	TTA	3	9	5747	5755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_001856	CAT	2	6	5860	5865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_001856	TAG	2	6	5930	5935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_001856	TAA	2	6	6099	6104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496832
99	NC_001856	TAC	2	6	6108	6113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496832
100	NC_001856	ATC	2	6	6169	6174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496832
101	NC_001856	AAT	2	6	6188	6193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496832
102	NC_001856	TTA	2	6	6275	6280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496832
103	NC_001856	AAG	2	6	6303	6308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496832
104	NC_001856	ACA	2	6	6317	6322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496832
105	NC_001856	CTG	2	6	6396	6401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11496832
106	NC_001856	CAA	2	6	6420	6425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496832
107	NC_001856	AAG	2	6	6519	6524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496832
108	NC_001856	AGC	2	6	6541	6546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11496832
109	NC_001856	CAA	2	6	6578	6583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496832
110	NC_001856	AGC	2	6	6784	6789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11496832
111	NC_001856	AAG	2	6	6834	6839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496832
112	NC_001856	AAT	2	6	6893	6898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_001856	ATA	2	6	6959	6964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_001856	TAA	2	6	6991	6996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_001856	TAA	2	6	7005	7010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_001856	TTA	2	6	7070	7075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_001856	TAA	2	6	7089	7094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_001856	AGA	2	6	7178	7183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_001856	TGT	2	6	7184	7189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_001856	AAG	2	6	7365	7370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_001856	TAA	2	6	7499	7504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_001856	TAT	2	6	7521	7526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_001856	TTA	2	6	7715	7720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_001856	ATT	2	6	7731	7736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_001856	AAT	2	6	7839	7844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496846
126	NC_001856	CGC	2	6	7901	7906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	11496846
127	NC_001856	CAA	2	6	8052	8057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_001856	ACA	2	6	8069	8074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_001856	TAT	2	6	8106	8111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_001856	TAA	2	6	8281	8286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_001856	TTG	2	6	8500	8505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_001856	ATA	2	6	8600	8605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_001856	AAT	2	6	8643	8648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_001856	TCA	2	6	8673	8678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_001856	TTC	2	6	8703	8708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_001856	TAT	2	6	9041	9046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496848
137	NC_001856	CAA	2	6	9062	9067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496848
138	NC_001856	CAA	2	6	9150	9155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496848
139	NC_001856	TTA	3	9	9254	9262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_001856	TTC	2	6	9271	9276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_001856	CTT	2	6	9332	9337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_001856	TAG	2	6	9405	9410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_001856	TAC	2	6	9447	9452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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