MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp38

Total Repeats: 1170

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001856	CTTC	2	8	25	32	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_001856	AAT	3	9	54	62	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001856	ATT	3	9	97	105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_001856	AGTGG	2	10	141	150	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5	NC_001856	AAT	2	6	181	186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_001856	GTA	2	6	198	203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_001856	TAC	2	6	221	226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_001856	CAG	2	6	252	257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_001856	TC	3	6	273	278	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_001856	CAA	2	6	338	343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_001856	A	6	6	363	368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_001856	AAAAAT	2	12	391	402	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_001856	TTA	2	6	407	412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_001856	TAAT	2	8	419	426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_001856	ATT	2	6	431	436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_001856	TAT	2	6	446	451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_001856	ATTAT	2	10	455	464	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_001856	AAT	2	6	560	565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_001856	GAA	2	6	588	593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_001856	TAA	2	6	598	603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_001856	A	6	6	610	615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_001856	TGA	2	6	625	630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_001856	A	6	6	634	639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_001856	A	7	7	666	672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_001856	A	7	7	677	683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_001856	AGA	3	9	686	694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_001856	T	6	6	733	738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_001856	CAT	2	6	745	750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_001856	ATA	2	6	766	771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_001856	CAAAA	2	10	868	877	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_001856	A	6	6	874	879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_001856	CCT	2	6	881	886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_001856	TTA	2	6	939	944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_001856	A	6	6	951	956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_001856	A	6	6	989	994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_001856	ATT	2	6	1016	1021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_001856	TTA	2	6	1062	1067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_001856	TA	3	6	1080	1085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_001856	A	8	8	1151	1158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_001856	ACA	2	6	1167	1172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_001856	GTTAT	2	10	1213	1222	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_001856	ACT	2	6	1280	1285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_001856	TAG	2	6	1312	1317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_001856	TAA	2	6	1331	1336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_001856	AGCAA	2	10	1363	1372	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_001856	ATA	2	6	1378	1383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_001856	TAA	2	6	1418	1423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_001856	TAT	2	6	1453	1458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_001856	TAA	3	9	1467	1475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_001856	A	6	6	1480	1485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_001856	ATT	3	9	1493	1501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_001856	ATA	2	6	1540	1545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_001856	TAT	2	6	1614	1619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_001856	T	8	8	1664	1671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_001856	GCA	2	6	1691	1696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_001856	TAGGAA	2	12	1810	1821	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_001856	ATT	3	9	1858	1866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_001856	A	7	7	1902	1908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_001856	A	7	7	1980	1986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_001856	TTA	2	6	1988	1993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_001856	CTT	2	6	2037	2042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_001856	A	6	6	2061	2066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_001856	AT	3	6	2156	2161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_001856	A	6	6	2205	2210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_001856	A	6	6	2270	2275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_001856	A	6	6	2302	2307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_001856	TTTTCA	2	12	2311	2322	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_001856	AAAAC	2	10	2334	2343	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_001856	T	7	7	2360	2366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_001856	AGA	2	6	2371	2376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_001856	ATG	2	6	2427	2432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_001856	AAAAT	2	10	2456	2465	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_001856	A	6	6	2505	2510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_001856	A	6	6	2514	2519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_001856	T	7	7	2588	2594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_001856	TAAAAA	2	12	2620	2631	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_001856	TTC	2	6	2684	2689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_001856	TGT	2	6	2693	2698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_001856	TA	3	6	2766	2771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_001856	ACT	2	6	2793	2798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_001856	ACT	2	6	2849	2854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_001856	TA	3	6	2890	2895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_001856	ATT	2	6	2957	2962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_001856	TAA	2	6	3045	3050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_001856	TCTTT	2	10	3069	3078	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_001856	T	7	7	3161	3167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_001856	T	6	6	3172	3177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_001856	T	6	6	3191	3196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_001856	ACT	2	6	3232	3237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_001856	T	6	6	3280	3285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_001856	ATA	2	6	3343	3348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_001856	ATC	2	6	3352	3357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_001856	T	6	6	3364	3369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_001856	CTA	2	6	3370	3375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_001856	TAA	2	6	3385	3390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_001856	TA	3	6	3453	3458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_001856	T	7	7	3481	3487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_001856	ATT	2	6	3489	3494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_001856	TAT	2	6	3509	3514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_001856	ATT	2	6	3538	3543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_001856	T	6	6	3557	3562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_001856	A	6	6	3572	3577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_001856	TTA	2	6	3578	3583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_001856	CTTT	2	8	3633	3640	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_001856	TTAT	2	8	3655	3662	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_001856	TAA	2	6	3678	3683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_001856	ATA	2	6	3701	3706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_001856	TCTT	2	8	3708	3715	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_001856	T	7	7	3773	3779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_001856	AT	3	6	3793	3798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_001856	TTA	2	6	3815	3820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_001856	ATT	2	6	3827	3832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_001856	AGA	2	6	3874	3879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_001856	TAA	2	6	3887	3892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_001856	AATT	2	8	3908	3915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_001856	ATA	2	6	3987	3992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_001856	TAATA	2	10	3995	4004	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_001856	TTA	2	6	4062	4067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_001856	TTAT	2	8	4135	4142	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_001856	A	6	6	4146	4151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_001856	TAT	2	6	4152	4157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_001856	AGAGG	2	10	4223	4232	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
123	NC_001856	ATC	2	6	4248	4253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_001856	A	6	6	4254	4259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_001856	AAAATA	2	12	4267	4278	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_001856	TATT	2	8	4283	4290	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_001856	GAA	2	6	4332	4337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_001856	AAC	2	6	4358	4363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_001856	TTTC	2	8	4371	4378	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_001856	TAG	2	6	4389	4394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_001856	TAA	2	6	4426	4431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_001856	A	6	6	4434	4439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_001856	TATAAA	2	12	4441	4452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_001856	TTTA	2	8	4455	4462	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_001856	CAAA	2	8	4478	4485	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_001856	AT	3	6	4489	4494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_001856	ATTA	2	8	4498	4505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_001856	ATT	4	12	4509	4520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_001856	AT	4	8	4525	4532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_001856	A	8	8	4567	4574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_001856	TA	3	6	4583	4588	50 %	50 %	0 %	0 %	11496844
142	NC_001856	TAA	2	6	4638	4643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496844
143	NC_001856	A	7	7	4649	4655	100 %	0 %	0 %	0 %	11496844
144	NC_001856	GTA	2	6	4682	4687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496844
145	NC_001856	TAA	2	6	4707	4712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496844
146	NC_001856	AAG	2	6	4727	4732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496844
147	NC_001856	A	7	7	4733	4739	100 %	0 %	0 %	0 %	11496844
148	NC_001856	ACT	2	6	4816	4821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496844
149	NC_001856	TCC	2	6	4844	4849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11496844
150	NC_001856	TAA	2	6	4884	4889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496844
151	NC_001856	ACCA	2	8	4899	4906	50 %	0 %	0 %	50 %	11496844
152	NC_001856	A	8	8	4925	4932	100 %	0 %	0 %	0 %	11496844
153	NC_001856	A	7	7	4938	4944	100 %	0 %	0 %	0 %	11496844
154	NC_001856	CTA	2	6	4961	4966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496844
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445	NC_001856	T	6	6	14416	14421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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482	NC_001856	TAA	2	6	15932	15937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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