MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp28-3

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001853	AACTA	2	10	1343	1352	60 %	20 %	0 %	20 %	11496698
2	NC_001853	TAAAC	2	10	1644	1653	60 %	20 %	0 %	20 %	11496703
3	NC_001853	TAAAC	2	10	1758	1767	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_001853	TAATT	2	10	4837	4846	40 %	60 %	0 %	0 %	11496712
5	NC_001853	TTTAT	2	10	5312	5321	20 %	80 %	0 %	0 %	11496712
6	NC_001853	TAAAA	2	10	6853	6862	80 %	20 %	0 %	0 %	11496712
7	NC_001853	ATATT	2	10	7053	7062	40 %	60 %	0 %	0 %	11496712
8	NC_001853	ATTTT	2	10	7580	7589	20 %	80 %	0 %	0 %	11496712
9	NC_001853	AGATT	2	10	9605	9614	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_001853	TAAAT	2	10	10067	10076	60 %	40 %	0 %	0 %	11496699
11	NC_001853	TAAAT	2	10	10121	10130	60 %	40 %	0 %	0 %	11496699
12	NC_001853	TAAAT	2	10	10175	10184	60 %	40 %	0 %	0 %	11496699
13	NC_001853	TAAAT	2	10	10229	10238	60 %	40 %	0 %	0 %	11496699
14	NC_001853	TAAAT	2	10	10283	10292	60 %	40 %	0 %	0 %	11496699
15	NC_001853	TTTAT	2	10	10713	10722	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_001853	GCTTT	2	10	11014	11023	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_001853	ATTTT	2	10	11198	11207	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_001853	ATAGA	2	10	12259	12268	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_001853	GATAT	2	10	15977	15986	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_001853	TATTT	2	10	16362	16371	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_001853	CTAAG	2	10	17206	17215	40 %	20 %	20 %	20 %	11496723
22	NC_001853	TATAC	2	10	17519	17528	40 %	40 %	0 %	20 %	11496705
23	NC_001853	AAAGT	2	10	17888	17897	60 %	20 %	20 %	0 %	11496705
24	NC_001853	AAATT	2	10	18929	18938	60 %	40 %	0 %	0 %	11496707
25	NC_001853	CAAAA	2	10	19599	19608	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_001853	AAATA	2	10	20006	20015	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_001853	TTAAT	2	10	20116	20125	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_001853	TAATT	2	10	20592	20601	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_001853	ATATT	2	10	21361	21370	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_001853	AAGAA	2	10	21544	21553	80 %	0 %	20 %	0 %	11496708
31	NC_001853	TATTT	2	10	22572	22581	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_001853	TATTT	2	10	23811	23820	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_001853	TTTGG	2	10	23978	23987	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_001853	AATTA	2	10	24096	24105	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_001853	CTATA	2	10	24523	24532	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_001853	AAAAT	2	10	25049	25058	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_001853	TTATT	2	10	25761	25770	20 %	80 %	0 %	0 %	11496730
38	NC_001853	ATCAA	2	10	26675	26684	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_001853	GATTC	2	10	27704	27713	20 %	40 %	20 %	20 %	11496701
40	NC_001853	ATTTT	2	10	28254	28263	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_001853	GAATT	2	10	28266	28275	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.