MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp25

Total Repeats: 353

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001850	TTA	2	6	102	107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001850	AAG	2	6	110	115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001850	TAT	2	6	343	348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_001850	AAT	2	6	355	360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_001850	AGA	2	6	380	385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_001850	TCT	2	6	393	398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_001850	TAA	2	6	481	486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_001850	ATT	2	6	488	493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_001850	TCT	2	6	522	527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_001850	TTA	2	6	546	551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_001850	CAA	2	6	739	744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_001850	TCT	2	6	746	751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_001850	ATA	2	6	789	794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_001850	AAT	2	6	795	800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_001850	TCA	2	6	828	833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_001850	TGA	2	6	1050	1055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_001850	TAT	2	6	1090	1095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_001850	TAA	2	6	1106	1111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_001850	TAA	2	6	1201	1206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_001850	TTC	2	6	1214	1219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_001850	TAT	2	6	1235	1240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_001850	CTT	2	6	1262	1267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_001850	ACT	2	6	1355	1360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_001850	TTA	2	6	1588	1593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_001850	CCA	2	6	1638	1643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_001850	ATT	2	6	1676	1681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_001850	GAT	2	6	1729	1734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_001850	GGA	2	6	1851	1856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_001850	CTT	2	6	1879	1884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_001850	TAG	2	6	1923	1928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_001850	ATT	2	6	2088	2093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_001850	TTC	2	6	2117	2122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_001850	TCT	2	6	2157	2162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_001850	TAG	2	6	2164	2169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_001850	TCT	2	6	2202	2207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_001850	ATG	2	6	2330	2335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_001850	GTG	2	6	2350	2355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_001850	CAT	2	6	2490	2495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_001850	AAT	2	6	2512	2517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_001850	TTC	2	6	2527	2532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_001850	GCT	2	6	2676	2681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_001850	TGA	2	6	2689	2694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_001850	CTT	2	6	2829	2834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_001850	AAT	2	6	2863	2868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_001850	TTC	2	6	3019	3024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_001850	ATT	2	6	3052	3057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_001850	TCT	2	6	3074	3079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_001850	TTA	2	6	3150	3155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_001850	TCA	2	6	3188	3193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_001850	AGA	2	6	3217	3222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_001850	TTC	2	6	3316	3321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_001850	GTC	2	6	3415	3420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_001850	TTC	2	6	3577	3582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_001850	TTC	2	6	3586	3591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_001850	TCT	2	6	3727	3732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_001850	ATT	2	6	3822	3827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_001850	CTT	2	6	3836	3841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_001850	TAT	2	6	3848	3853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_001850	TGT	2	6	3934	3939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_001850	AAT	2	6	3947	3952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_001850	TTC	2	6	3957	3962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_001850	ATC	2	6	4008	4013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_001850	TTA	2	6	4060	4065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_001850	ATT	2	6	4122	4127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_001850	TAT	2	6	4180	4185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_001850	CAA	2	6	4308	4313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_001850	TAA	2	6	4370	4375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_001850	ATT	2	6	4463	4468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_001850	TCT	2	6	4470	4475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_001850	GAT	2	6	4486	4491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_001850	ATC	2	6	4501	4506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_001850	CCA	2	6	4557	4562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_001850	ATT	2	6	4612	4617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_001850	TAA	2	6	4618	4623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_001850	ATT	2	6	4631	4636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_001850	TAT	2	6	4644	4649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_001850	ATT	3	9	4661	4669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_001850	ATT	2	6	4753	4758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_001850	TAA	2	6	4945	4950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_001850	TAT	2	6	5002	5007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_001850	TTC	2	6	5023	5028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_001850	CAA	2	6	5077	5082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_001850	TTA	2	6	5083	5088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_001850	TAC	2	6	5255	5260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_001850	GAA	2	6	5432	5437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_001850	ATA	2	6	5674	5679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_001850	ATT	2	6	5714	5719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_001850	GTT	2	6	5728	5733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_001850	ATG	2	6	5926	5931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_001850	CTT	2	6	6025	6030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_001850	TTA	2	6	6044	6049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_001850	TAT	2	6	6153	6158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_001850	TTA	2	6	6167	6172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_001850	CTT	2	6	6174	6179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_001850	AAC	2	6	6383	6388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_001850	TAA	2	6	6505	6510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_001850	CTT	2	6	6590	6595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_001850	TTG	2	6	6643	6648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_001850	ATA	2	6	6670	6675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_001850	ATT	2	6	6939	6944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496612
101	NC_001850	CCA	2	6	6964	6969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	11496612
102	NC_001850	ATA	2	6	7046	7051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496612
103	NC_001850	AAT	2	6	7075	7080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496612
104	NC_001850	AAG	2	6	7121	7126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496612
105	NC_001850	ATA	2	6	7205	7210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496612
106	NC_001850	AAG	2	6	7343	7348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496612
107	NC_001850	ATA	2	6	7363	7368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496612
108	NC_001850	ATT	2	6	7559	7564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496612
109	NC_001850	ATG	2	6	7682	7687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496612
110	NC_001850	TGA	2	6	7749	7754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496612
111	NC_001850	ATG	2	6	7755	7760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496612
112	NC_001850	TTG	2	6	7863	7868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_001850	ATA	2	6	7994	7999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_001850	ATT	2	6	8054	8059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_001850	TAA	2	6	8064	8069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_001850	TTA	2	6	8239	8244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_001850	TTC	2	6	8340	8345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_001850	TAT	2	6	8384	8389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_001850	TCT	2	6	8449	8454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_001850	CAA	2	6	8544	8549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_001850	ATT	2	6	8569	8574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_001850	AAT	2	6	8590	8595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_001850	ATT	2	6	8627	8632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_001850	ACT	2	6	8702	8707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_001850	ATA	2	6	8866	8871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_001850	ATG	2	6	9003	9008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_001850	AGA	2	6	9014	9019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_001850	AAC	2	6	9059	9064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_001850	AAC	2	6	9237	9242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_001850	ATT	2	6	9244	9249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_001850	TAT	2	6	9252	9257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_001850	AGA	2	6	9318	9323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_001850	TGC	2	6	9781	9786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11496635
134	NC_001850	ATT	2	6	9804	9809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496635
135	NC_001850	ATC	2	6	9955	9960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496635
136	NC_001850	TCA	2	6	10051	10056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496635
137	NC_001850	ATC	2	6	10068	10073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496635
138	NC_001850	CAA	2	6	10082	10087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496635
139	NC_001850	TAT	2	6	10091	10096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496635
140	NC_001850	TAA	2	6	10185	10190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496635
141	NC_001850	ATT	2	6	10281	10286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556622
142	NC_001850	TCA	2	6	10291	10296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	364556622
143	NC_001850	TCT	2	6	10327	10332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	364556622
144	NC_001850	AAT	2	6	10394	10399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556622
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162	NC_001850	ATA	2	6	11292	11297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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278	NC_001850	AAT	2	6	19634	19639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_001850	ATA	2	6	19644	19649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_001850	AGA	2	6	19666	19671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_001850	ATT	2	6	19673	19678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_001850	TAA	2	6	19683	19688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_001850	GTA	2	6	19826	19831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
284	NC_001850	TAA	2	6	19945	19950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_001850	AAG	2	6	20020	20025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
286	NC_001850	AAT	2	6	20147	20152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_001850	GAA	2	6	20248	20253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
288	NC_001850	TCC	2	6	20307	20312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
289	NC_001850	TAA	2	6	20334	20339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_001850	ATG	2	6	20420	20425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
291	NC_001850	TTA	2	6	20438	20443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_001850	TGA	2	6	20561	20566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
293	NC_001850	TGA	2	6	20612	20617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
294	NC_001850	ATT	2	6	20822	20827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_001850	AAT	2	6	20895	20900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_001850	AGA	2	6	20996	21001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
297	NC_001850	TTA	2	6	21051	21056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NC_001850	GCA	2	6	21129	21134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
299	NC_001850	GTA	2	6	21167	21172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
300	NC_001850	AAT	2	6	21210	21215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_001850	TTA	2	6	21222	21227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_001850	AGA	2	6	21345	21350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
303	NC_001850	TAA	2	6	21371	21376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
304	NC_001850	TTA	2	6	21407	21412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
305	NC_001850	AGG	2	6	21456	21461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
306	NC_001850	ATA	2	6	21566	21571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
307	NC_001850	TAA	2	6	21593	21598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
308	NC_001850	AGA	2	6	21627	21632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
309	NC_001850	ATT	2	6	21663	21668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
310	NC_001850	TTA	2	6	21817	21822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
311	NC_001850	ACT	2	6	21833	21838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
312	NC_001850	TAG	2	6	21864	21869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
313	NC_001850	ATA	2	6	21913	21918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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330	NC_001850	ATA	3	9	22739	22747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
331	NC_001850	TAT	2	6	22758	22763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
332	NC_001850	TAT	2	6	22945	22950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
333	NC_001850	AAT	2	6	23056	23061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.