MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp56

Total Repeats: 174

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000956	ATAA	2	8	26	33	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000956	AAAC	2	8	357	364	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_000956	ATCT	2	8	754	761	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_000956	TTGG	2	8	865	872	0 %	50 %	50 %	0 %	11497374
5	NC_000956	AGAA	2	8	1374	1381	75 %	0 %	25 %	0 %	11497374
6	NC_000956	AAAC	2	8	2137	2144	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_000956	TAAA	2	8	2315	2322	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000956	TAAT	2	8	2431	2438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000956	ATTT	2	8	2509	2516	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000956	ATCA	2	8	2566	2573	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_000956	TTAA	2	8	2655	2662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000956	AAGC	2	8	2865	2872	50 %	0 %	25 %	25 %	11497375
13	NC_000956	TTTA	2	8	3172	3179	25 %	75 %	0 %	0 %	11497375
14	NC_000956	CTAT	2	8	3305	3312	25 %	50 %	0 %	25 %	11497375
15	NC_000956	CATT	2	8	3540	3547	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_000956	ATAA	2	8	4189	4196	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000956	ATTA	2	8	4423	4430	50 %	50 %	0 %	0 %	11497377
18	NC_000956	TAAT	2	8	4874	4881	50 %	50 %	0 %	0 %	11497377
19	NC_000956	CTTA	2	8	5000	5007	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_000956	TGGG	2	8	5434	5441	0 %	25 %	75 %	0 %	11497378
21	NC_000956	TCAA	2	8	5706	5713	50 %	25 %	0 %	25 %	11497378
22	NC_000956	TCCT	2	8	5842	5849	0 %	50 %	0 %	50 %	11497379
23	NC_000956	TGTT	2	8	5929	5936	0 %	75 %	25 %	0 %	11497379
24	NC_000956	ATTT	2	8	6393	6400	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000956	TTTG	2	8	6538	6545	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000956	CAAT	2	8	6668	6675	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_000956	TTTA	2	8	7359	7366	25 %	75 %	0 %	0 %	364556575
28	NC_000956	GTAA	2	8	7397	7404	50 %	25 %	25 %	0 %	364556575
29	NC_000956	TCAT	2	8	8311	8318	25 %	50 %	0 %	25 %	364556568
30	NC_000956	CAAA	2	8	8380	8387	75 %	0 %	0 %	25 %	364556568
31	NC_000956	TTAC	2	8	8619	8626	25 %	50 %	0 %	25 %	364556569
32	NC_000956	AATG	2	8	8866	8873	50 %	25 %	25 %	0 %	364556569
33	NC_000956	AAGT	2	8	9531	9538	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000956	TTTA	2	8	10465	10472	25 %	75 %	0 %	0 %	11497410
35	NC_000956	AGAA	2	8	10686	10693	75 %	0 %	25 %	0 %	11497410
36	NC_000956	GCTG	2	8	10800	10807	0 %	25 %	50 %	25 %	11497410
37	NC_000956	TGCC	2	8	10901	10908	0 %	25 %	25 %	50 %	11497410
38	NC_000956	GATT	2	8	11120	11127	25 %	50 %	25 %	0 %	11497410
39	NC_000956	ATTT	2	8	11962	11969	25 %	75 %	0 %	0 %	11497412
40	NC_000956	TGAG	2	8	12066	12073	25 %	25 %	50 %	0 %	11497412
41	NC_000956	CTTG	2	8	12264	12271	0 %	50 %	25 %	25 %	11497413
42	NC_000956	AATT	2	8	12410	12417	50 %	50 %	0 %	0 %	11497413
43	NC_000956	AACG	2	8	12995	13002	50 %	0 %	25 %	25 %	11497414
44	NC_000956	CAAG	2	8	13100	13107	50 %	0 %	25 %	25 %	11497414
45	NC_000956	TAAT	2	8	13578	13585	50 %	50 %	0 %	0 %	11497414
46	NC_000956	CTAC	2	8	13640	13647	25 %	25 %	0 %	50 %	11497414
47	NC_000956	AGAA	2	8	13876	13883	75 %	0 %	25 %	0 %	11497415
48	NC_000956	CTTT	2	8	14187	14194	0 %	75 %	0 %	25 %	11497415
49	NC_000956	GAAT	2	8	15435	15442	50 %	25 %	25 %	0 %	11497417
50	NC_000956	TCAA	2	8	15658	15665	50 %	25 %	0 %	25 %	11497417
51	NC_000956	TCAG	2	8	15902	15909	25 %	25 %	25 %	25 %	11497417
52	NC_000956	AATT	2	8	15931	15938	50 %	50 %	0 %	0 %	11497417
53	NC_000956	GTTT	2	8	15951	15958	0 %	75 %	25 %	0 %	11497417
54	NC_000956	TAAT	2	8	16492	16499	50 %	50 %	0 %	0 %	11497385
55	NC_000956	AGAT	2	8	17171	17178	50 %	25 %	25 %	0 %	11497385
56	NC_000956	TATC	2	8	17383	17390	25 %	50 %	0 %	25 %	11497386
57	NC_000956	AAAC	2	8	17575	17582	75 %	0 %	0 %	25 %	11497386
58	NC_000956	ATTT	2	8	17591	17598	25 %	75 %	0 %	0 %	11497386
59	NC_000956	ATTA	2	8	18110	18117	50 %	50 %	0 %	0 %	11497387
60	NC_000956	TACA	2	8	18506	18513	50 %	25 %	0 %	25 %	11497387
61	NC_000956	AATA	2	8	19114	19121	75 %	25 %	0 %	0 %	11497389
62	NC_000956	TCAA	2	8	19149	19156	50 %	25 %	0 %	25 %	11497389
63	NC_000956	AGGA	2	8	19221	19228	50 %	0 %	50 %	0 %	11497389
64	NC_000956	CTAT	2	8	19233	19240	25 %	50 %	0 %	25 %	11497389
65	NC_000956	TAAC	2	8	19303	19310	50 %	25 %	0 %	25 %	11497390
66	NC_000956	ATAG	2	8	20388	20395	50 %	25 %	25 %	0 %	364556572
67	NC_000956	ATAG	2	8	20421	20428	50 %	25 %	25 %	0 %	364556572
68	NC_000956	AGAT	2	8	20440	20447	50 %	25 %	25 %	0 %	364556572
69	NC_000956	ATTG	2	8	21249	21256	25 %	50 %	25 %	0 %	11497393
70	NC_000956	TCAA	2	8	21465	21472	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_000956	TCTT	2	8	21559	21566	0 %	75 %	0 %	25 %	11497394
72	NC_000956	CTTG	2	8	21963	21970	0 %	50 %	25 %	25 %	11497394
73	NC_000956	AATA	2	8	22500	22507	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_000956	AAGA	3	12	23323	23334	75 %	0 %	25 %	0 %	11497395
75	NC_000956	AATA	2	8	23450	23457	75 %	25 %	0 %	0 %	11497395
76	NC_000956	GAAA	2	8	23516	23523	75 %	0 %	25 %	0 %	11497395
77	NC_000956	AAAT	2	8	23602	23609	75 %	25 %	0 %	0 %	11497395
78	NC_000956	GAAA	2	8	23715	23722	75 %	0 %	25 %	0 %	11497395
79	NC_000956	TTTA	2	8	24434	24441	25 %	75 %	0 %	0 %	11497396
80	NC_000956	TTGC	2	8	24605	24612	0 %	50 %	25 %	25 %	11497397
81	NC_000956	TAAA	2	8	24810	24817	75 %	25 %	0 %	0 %	11497397
82	NC_000956	TAAA	2	8	25161	25168	75 %	25 %	0 %	0 %	11497397
83	NC_000956	TAAA	2	8	25267	25274	75 %	25 %	0 %	0 %	11497397
84	NC_000956	ATGG	2	8	26268	26275	25 %	25 %	50 %	0 %	11497399
85	NC_000956	TAAA	2	8	26818	26825	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_000956	TAAG	2	8	27060	27067	50 %	25 %	25 %	0 %	364556573
87	NC_000956	AAAT	2	8	27361	27368	75 %	25 %	0 %	0 %	364556573
88	NC_000956	AATC	2	8	27932	27939	50 %	25 %	0 %	25 %	364556573
89	NC_000956	AGAT	2	8	28156	28163	50 %	25 %	25 %	0 %	364556573
90	NC_000956	ATTA	2	8	28291	28298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_000956	TATG	2	8	28495	28502	25 %	50 %	25 %	0 %	11497401
92	NC_000956	AAAT	3	12	28879	28890	75 %	25 %	0 %	0 %	11497402
93	NC_000956	TTTA	2	8	28910	28917	25 %	75 %	0 %	0 %	11497402
94	NC_000956	ACCA	2	8	29263	29270	50 %	0 %	0 %	50 %	11497402
95	NC_000956	TGCA	2	8	29627	29634	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_000956	AAGA	2	8	29695	29702	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_000956	AAGA	2	8	30436	30443	75 %	0 %	25 %	0 %	11497403
98	NC_000956	TAAA	2	8	30790	30797	75 %	25 %	0 %	0 %	11497403
99	NC_000956	CAGT	2	8	30965	30972	25 %	25 %	25 %	25 %	11497403
100	NC_000956	TTAT	2	8	31145	31152	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_000956	ATGA	2	8	31651	31658	50 %	25 %	25 %	0 %	364556577
102	NC_000956	TAAA	2	8	32262	32269	75 %	25 %	0 %	0 %	11497421
103	NC_000956	AATT	2	8	32308	32315	50 %	50 %	0 %	0 %	11497421
104	NC_000956	CAAA	2	8	32467	32474	75 %	0 %	0 %	25 %	11497404
105	NC_000956	AAAT	2	8	32505	32512	75 %	25 %	0 %	0 %	11497404
106	NC_000956	AATT	2	8	32556	32563	50 %	50 %	0 %	0 %	11497404
107	NC_000956	TAGC	2	8	32663	32670	25 %	25 %	25 %	25 %	11497404
108	NC_000956	TGAT	2	8	32870	32877	25 %	50 %	25 %	0 %	11497404
109	NC_000956	AGCA	2	8	33231	33238	50 %	0 %	25 %	25 %	11497404
110	NC_000956	AAAT	2	8	33257	33264	75 %	25 %	0 %	0 %	11497404
111	NC_000956	TACA	2	8	33461	33468	50 %	25 %	0 %	25 %	11497404
112	NC_000956	TTTA	2	8	33622	33629	25 %	75 %	0 %	0 %	11497404
113	NC_000956	ATTT	3	12	34380	34391	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_000956	ATTA	2	8	34753	34760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_000956	ACAT	2	8	35435	35442	50 %	25 %	0 %	25 %	11497422
116	NC_000956	GTTC	2	8	35486	35493	0 %	50 %	25 %	25 %	11497422
117	NC_000956	TGCT	2	8	36342	36349	0 %	50 %	25 %	25 %	11497423
118	NC_000956	ATGT	2	8	36828	36835	25 %	50 %	25 %	0 %	11497424
119	NC_000956	GTAT	2	8	36853	36860	25 %	50 %	25 %	0 %	11497424
120	NC_000956	TTTA	2	8	37426	37433	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_000956	CTAA	2	8	37865	37872	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_000956	TCTT	2	8	38196	38203	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_000956	TTCG	2	8	38274	38281	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_000956	GTTT	2	8	38298	38305	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_000956	CTTT	2	8	39055	39062	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_000956	GATC	2	8	39137	39144	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_000956	TTTC	2	8	39332	39339	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_000956	CTTT	2	8	39344	39351	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_000956	TAGA	2	8	39358	39365	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_000956	TTTA	2	8	39471	39478	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_000956	TCCT	2	8	39546	39553	0 %	50 %	0 %	50 %	11497430
132	NC_000956	ATTT	2	8	39916	39923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_000956	AATG	2	8	40169	40176	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_000956	ATAA	2	8	40219	40226	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_000956	AATC	2	8	41470	41477	50 %	25 %	0 %	25 %	364556574
136	NC_000956	TTGT	2	8	41919	41926	0 %	75 %	25 %	0 %	364556574
137	NC_000956	TTTC	2	8	42051	42058	0 %	75 %	0 %	25 %	364556574
138	NC_000956	GTTA	2	8	42275	42282	25 %	50 %	25 %	0 %	364556574
139	NC_000956	CCTT	2	8	42646	42653	0 %	50 %	0 %	50 %	364556574
140	NC_000956	AATT	2	8	42907	42914	50 %	50 %	0 %	0 %	364556574
141	NC_000956	GCTA	2	8	43166	43173	25 %	25 %	25 %	25 %	364556574
142	NC_000956	ATTT	2	8	43246	43253	25 %	75 %	0 %	0 %	364556574
143	NC_000956	TAGT	2	8	43291	43298	25 %	50 %	25 %	0 %	364556574
144	NC_000956	AGAA	2	8	44292	44299	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_000956	TTTA	2	8	44811	44818	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_000956	GCAA	2	8	44824	44831	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_000956	TATT	2	8	45055	45062	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_000956	TTAC	2	8	45596	45603	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_000956	TAAT	2	8	46077	46084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_000956	CTTG	2	8	46130	46137	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_000956	TTTA	2	8	46151	46158	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_000956	TAAT	2	8	46484	46491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_000956	CTAT	2	8	46662	46669	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
154	NC_000956	TTAT	2	8	46942	46949	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_000956	AATG	2	8	47294	47301	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
156	NC_000956	ATAG	2	8	47393	47400	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
157	NC_000956	CTTT	2	8	48436	48443	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
158	NC_000956	GCTT	2	8	48453	48460	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
159	NC_000956	TTAA	2	8	48638	48645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_000956	ATCT	2	8	48939	48946	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
161	NC_000956	AATG	2	8	49083	49090	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
162	NC_000956	ATTA	2	8	49485	49492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_000956	TTAT	2	8	49703	49710	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_000956	ATTT	2	8	49974	49981	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_000956	TTTA	2	8	50072	50079	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_000956	GATA	2	8	50280	50287	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
167	NC_000956	TCCA	2	8	50638	50645	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
168	NC_000956	TATT	2	8	51263	51270	25 %	75 %	0 %	0 %	11497406
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170	NC_000956	TTAT	2	8	52003	52010	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_000956	ATGT	2	8	52243	52250	25 %	50 %	25 %	0 %	11497443
172	NC_000956	CTTT	2	8	52418	52425	0 %	75 %	0 %	25 %	11497443
173	NC_000956	TTTG	2	8	52592	52599	0 %	75 %	25 %	0 %	11497443
174	NC_000956	ATTT	2	8	52607	52614	25 %	75 %	0 %	0 %	11497443

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.