MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-9

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000954	GT	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	11497348
2	NC_000954	AT	3	6	504	509	50 %	50 %	0 %	0 %	11497348
3	NC_000954	AG	3	6	1509	1514	50 %	0 %	50 %	0 %	11497349
4	NC_000954	GA	3	6	1742	1747	50 %	0 %	50 %	0 %	11497349
5	NC_000954	GA	3	6	1861	1866	50 %	0 %	50 %	0 %	11497349
6	NC_000954	TA	3	6	2972	2977	50 %	50 %	0 %	0 %	11497351
7	NC_000954	CT	3	6	3195	3200	0 %	50 %	0 %	50 %	11497351
8	NC_000954	TC	3	6	4318	4323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_000954	TC	3	6	4606	4611	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_000954	TG	3	6	5396	5401	0 %	50 %	50 %	0 %	11497326
11	NC_000954	AG	3	6	5537	5542	50 %	0 %	50 %	0 %	364556547
12	NC_000954	AT	3	6	5930	5935	50 %	50 %	0 %	0 %	11497328
13	NC_000954	TA	3	6	5946	5951	50 %	50 %	0 %	0 %	11497328
14	NC_000954	AT	4	8	6422	6429	50 %	50 %	0 %	0 %	11497329
15	NC_000954	AT	3	6	6556	6561	50 %	50 %	0 %	0 %	11497329
16	NC_000954	AC	3	6	7064	7069	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_000954	TA	3	6	7512	7517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_000954	AG	3	6	9187	9192	50 %	0 %	50 %	0 %	11497355
19	NC_000954	AG	3	6	9555	9560	50 %	0 %	50 %	0 %	11497355
20	NC_000954	TA	3	6	10772	10777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000954	AT	3	6	11296	11301	50 %	50 %	0 %	0 %	11497356
22	NC_000954	TA	3	6	11695	11700	50 %	50 %	0 %	0 %	11497356
23	NC_000954	CA	3	6	11829	11834	50 %	0 %	0 %	50 %	11497356
24	NC_000954	CA	3	6	12195	12200	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_000954	TA	3	6	12318	12323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000954	CA	3	6	12476	12481	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_000954	AT	3	6	12873	12878	50 %	50 %	0 %	0 %	11497330
28	NC_000954	AT	3	6	13267	13272	50 %	50 %	0 %	0 %	11497331
29	NC_000954	AT	3	6	13953	13958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_000954	TA	3	6	15275	15280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_000954	AT	3	6	15577	15582	50 %	50 %	0 %	0 %	11497333
32	NC_000954	AT	3	6	15987	15992	50 %	50 %	0 %	0 %	11497334
33	NC_000954	AT	3	6	16155	16160	50 %	50 %	0 %	0 %	11497334
34	NC_000954	AT	3	6	16460	16465	50 %	50 %	0 %	0 %	364556548
35	NC_000954	AT	3	6	16687	16692	50 %	50 %	0 %	0 %	364556549
36	NC_000954	CT	3	6	18490	18495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_000954	TA	3	6	18820	18825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000954	AC	3	6	19276	19281	50 %	0 %	0 %	50 %	11497338
39	NC_000954	TA	3	6	20768	20773	50 %	50 %	0 %	0 %	11497339
40	NC_000954	AT	3	6	21047	21052	50 %	50 %	0 %	0 %	11497340
41	NC_000954	AG	3	6	21383	21388	50 %	0 %	50 %	0 %	11497340
42	NC_000954	AT	3	6	21886	21891	50 %	50 %	0 %	0 %	11497341
43	NC_000954	AT	3	6	22527	22532	50 %	50 %	0 %	0 %	11497342
44	NC_000954	AT	3	6	22581	22586	50 %	50 %	0 %	0 %	11497342
45	NC_000954	TA	3	6	22757	22762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_000954	TA	3	6	23546	23551	50 %	50 %	0 %	0 %	11497343
47	NC_000954	AG	3	6	23587	23592	50 %	0 %	50 %	0 %	11497343
48	NC_000954	TA	3	6	23627	23632	50 %	50 %	0 %	0 %	11497343
49	NC_000954	AG	3	6	24043	24048	50 %	0 %	50 %	0 %	11497343
50	NC_000954	AG	3	6	25057	25062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000954	AT	3	6	25992	25997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_000954	GA	3	6	26067	26072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_000954	TA	3	6	26139	26144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_000954	GA	3	6	26786	26791	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000954	TA	3	6	28005	28010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000954	TA	3	6	28547	28552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000954	TG	3	6	28840	28845	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_000954	AT	3	6	29706	29711	50 %	50 %	0 %	0 %	11497347
59	NC_000954	AT	3	6	29956	29961	50 %	50 %	0 %	0 %	11497347
60	NC_000954	TA	3	6	30121	30126	50 %	50 %	0 %	0 %	11497347
61	NC_000954	AG	3	6	30610	30615	50 %	0 %	50 %	0 %	11497347

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.