MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-9

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000954	AAAAC	2	10	81	90	80 %	0 %	0 %	20 %	11497348
2	NC_000954	ATTAA	2	10	1783	1792	60 %	40 %	0 %	0 %	11497349
3	NC_000954	TGGCA	2	10	2333	2342	20 %	20 %	40 %	20 %	11497350
4	NC_000954	AATTA	2	10	2574	2583	60 %	40 %	0 %	0 %	11497350
5	NC_000954	TTCAA	2	10	4391	4400	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_000954	GAAAA	2	10	6931	6940	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000954	CTGCA	2	10	7585	7594	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_000954	CAAAA	2	10	9498	9507	80 %	0 %	0 %	20 %	11497355
9	NC_000954	GAAAA	2	10	10364	10373	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000954	GAAAA	2	10	10400	10409	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000954	GAAAA	2	10	10436	10445	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000954	AATCT	2	10	12351	12360	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_000954	TACTT	2	10	13377	13386	20 %	60 %	0 %	20 %	11497331
14	NC_000954	GAAAA	2	10	13455	13464	80 %	0 %	20 %	0 %	11497331
15	NC_000954	AAAGT	2	10	13477	13486	60 %	20 %	20 %	0 %	11497331
16	NC_000954	ATTAA	2	10	15321	15330	60 %	40 %	0 %	0 %	11497332
17	NC_000954	AGTAA	2	10	15958	15967	60 %	20 %	20 %	0 %	11497334
18	NC_000954	TCACT	2	10	16115	16124	20 %	40 %	0 %	40 %	11497334
19	NC_000954	TTGCT	2	10	16212	16221	0 %	60 %	20 %	20 %	364556548
20	NC_000954	AATTT	2	10	18725	18734	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000954	CACTA	2	10	19337	19346	40 %	20 %	0 %	40 %	11497338
22	NC_000954	TTAAA	2	10	20980	20989	60 %	40 %	0 %	0 %	11497340
23	NC_000954	AAATA	2	10	21574	21583	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_000954	TTTTA	2	10	22816	22825	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000954	ATAAA	2	10	24582	24591	80 %	20 %	0 %	0 %	11497344
26	NC_000954	ACTTG	2	10	24931	24940	20 %	40 %	20 %	20 %	11497344
27	NC_000954	AATTT	2	10	26012	26021	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000954	AAGAA	2	10	26443	26452	80 %	0 %	20 %	0 %	11497345
29	NC_000954	AACAA	2	10	27225	27234	80 %	0 %	0 %	20 %	11497346
30	NC_000954	TAAAT	2	10	27643	27652	60 %	40 %	0 %	0 %	11497346

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.