MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-4

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000950	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	11497179
2	NC_000950	ATTA	2	8	944	951	50 %	50 %	0 %	0 %	11497179
3	NC_000950	TGCT	2	8	2533	2540	0 %	50 %	25 %	25 %	11497180
4	NC_000950	ATGT	2	8	3019	3026	25 %	50 %	25 %	0 %	11497181
5	NC_000950	GTAT	2	8	3044	3051	25 %	50 %	25 %	0 %	11497181
6	NC_000950	ATAA	2	8	3126	3133	75 %	25 %	0 %	0 %	11497181
7	NC_000950	TAAT	2	8	3175	3182	50 %	50 %	0 %	0 %	11497181
8	NC_000950	CAAT	2	8	3208	3215	50 %	25 %	0 %	25 %	11497181
9	NC_000950	GTAA	2	8	3937	3944	50 %	25 %	25 %	0 %	364556467
10	NC_000950	ACTT	2	8	4304	4311	25 %	50 %	0 %	25 %	364556461
11	NC_000950	TCAT	2	8	4851	4858	25 %	50 %	0 %	25 %	364556461
12	NC_000950	TTAC	2	8	5159	5166	25 %	50 %	0 %	25 %	11497154
13	NC_000950	AATG	2	8	5406	5413	50 %	25 %	25 %	0 %	11497154
14	NC_000950	AAGT	2	8	6071	6078	50 %	25 %	25 %	0 %	11497156
15	NC_000950	GCTA	2	8	6831	6838	25 %	25 %	25 %	25 %	11497183
16	NC_000950	AGAA	2	8	7226	7233	75 %	0 %	25 %	0 %	11497183
17	NC_000950	GCTG	2	8	7340	7347	0 %	25 %	50 %	25 %	11497183
18	NC_000950	ATTT	2	8	8503	8510	25 %	75 %	0 %	0 %	11497185
19	NC_000950	TGAG	2	8	8607	8614	25 %	25 %	50 %	0 %	11497185
20	NC_000950	CTTG	2	8	8805	8812	0 %	50 %	25 %	25 %	11497186
21	NC_000950	AATT	2	8	8951	8958	50 %	50 %	0 %	0 %	11497186
22	NC_000950	AACG	2	8	9536	9543	50 %	0 %	25 %	25 %	11497187
23	NC_000950	CAAG	2	8	9641	9648	50 %	0 %	25 %	25 %	11497187
24	NC_000950	TGGA	2	8	10186	10193	25 %	25 %	50 %	0 %	11497187
25	NC_000950	CTTT	2	8	10641	10648	0 %	75 %	0 %	25 %	11497188
26	NC_000950	GGCA	2	8	11306	11313	25 %	0 %	50 %	25 %	11497189
27	NC_000950	GAAT	2	8	11889	11896	50 %	25 %	25 %	0 %	11497190
28	NC_000950	TCAA	2	8	12112	12119	50 %	25 %	0 %	25 %	11497190
29	NC_000950	TCAG	2	8	12356	12363	25 %	25 %	25 %	25 %	11497190
30	NC_000950	AATT	2	8	12385	12392	50 %	50 %	0 %	0 %	11497190
31	NC_000950	TAAT	2	8	12946	12953	50 %	50 %	0 %	0 %	11497159
32	NC_000950	AGAT	2	8	13625	13632	50 %	25 %	25 %	0 %	11497159
33	NC_000950	TATC	2	8	13837	13844	25 %	50 %	0 %	25 %	11497160
34	NC_000950	AAAC	2	8	14029	14036	75 %	0 %	0 %	25 %	11497160
35	NC_000950	ATTT	2	8	14045	14052	25 %	75 %	0 %	0 %	11497160
36	NC_000950	TGAT	2	8	14302	14309	25 %	50 %	25 %	0 %	11497161
37	NC_000950	GAAT	2	8	14573	14580	50 %	25 %	25 %	0 %	11497161
38	NC_000950	TACA	2	8	14960	14967	50 %	25 %	0 %	25 %	11497161
39	NC_000950	AATA	2	8	15568	15575	75 %	25 %	0 %	0 %	11497163
40	NC_000950	TCAA	2	8	15603	15610	50 %	25 %	0 %	25 %	11497163
41	NC_000950	AGGA	2	8	15675	15682	50 %	0 %	50 %	0 %	11497163
42	NC_000950	CTAT	2	8	15687	15694	25 %	50 %	0 %	25 %	11497163
43	NC_000950	TAAC	2	8	15757	15764	50 %	25 %	0 %	25 %	11497164
44	NC_000950	ATAG	2	8	16788	16795	50 %	25 %	25 %	0 %	364556464
45	NC_000950	AGAT	2	8	16807	16814	50 %	25 %	25 %	0 %	364556464
46	NC_000950	ATAG	2	8	16842	16849	50 %	25 %	25 %	0 %	364556464
47	NC_000950	CAAA	2	8	17181	17188	75 %	0 %	0 %	25 %	11497167
48	NC_000950	AGGT	2	8	18744	18751	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000950	TAAT	2	8	18847	18854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_000950	AAGA	3	12	19414	19425	75 %	0 %	25 %	0 %	11497169
51	NC_000950	AATA	2	8	19541	19548	75 %	25 %	0 %	0 %	11497169
52	NC_000950	GAAA	2	8	19607	19614	75 %	0 %	25 %	0 %	11497169
53	NC_000950	AAAT	2	8	19693	19700	75 %	25 %	0 %	0 %	11497169
54	NC_000950	GAAA	2	8	19806	19813	75 %	0 %	25 %	0 %	11497169
55	NC_000950	TTTA	2	8	20525	20532	25 %	75 %	0 %	0 %	11497170
56	NC_000950	AATA	2	8	20857	20864	75 %	25 %	0 %	0 %	11497171
57	NC_000950	AATG	2	8	21109	21116	50 %	25 %	25 %	0 %	11497171
58	NC_000950	AGAA	2	8	21140	21147	75 %	0 %	25 %	0 %	11497171
59	NC_000950	AAAT	2	8	21387	21394	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000950	TGAT	2	8	21602	21609	25 %	50 %	25 %	0 %	11497172
61	NC_000950	TAAT	2	8	22134	22141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_000950	ATAG	2	8	22166	22173	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_000950	ATAG	2	8	22187	22194	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_000950	GCAA	2	8	22268	22275	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_000950	TATT	2	8	22590	22597	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_000950	TAAG	2	8	22970	22977	50 %	25 %	25 %	0 %	11497173
67	NC_000950	AATC	2	8	23842	23849	50 %	25 %	0 %	25 %	11497173
68	NC_000950	AGAT	2	8	24066	24073	50 %	25 %	25 %	0 %	11497173
69	NC_000950	ATTA	2	8	24202	24209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_000950	AAAT	3	12	24790	24801	75 %	25 %	0 %	0 %	11497175
71	NC_000950	TTTA	2	8	24821	24828	25 %	75 %	0 %	0 %	11497175
72	NC_000950	TGTT	2	8	24909	24916	0 %	75 %	25 %	0 %	11497175
73	NC_000950	ACCA	2	8	25174	25181	50 %	0 %	0 %	50 %	11497175
74	NC_000950	AATT	2	8	25223	25230	50 %	50 %	0 %	0 %	11497175
75	NC_000950	TTTA	2	8	25346	25353	25 %	75 %	0 %	0 %	11497175
76	NC_000950	TGCA	2	8	25556	25563	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_000950	AAGA	2	8	25624	25631	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000950	GAAT	2	8	26090	26097	50 %	25 %	25 %	0 %	364556460
79	NC_000950	TTTA	2	8	27649	27656	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_000950	AATA	2	8	28263	28270	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_000950	TAAA	2	8	28754	28761	75 %	25 %	0 %	0 %	11497178
82	NC_000950	CAAG	2	8	28779	28786	50 %	0 %	25 %	25 %	11497178
83	NC_000950	AATT	2	8	28800	28807	50 %	50 %	0 %	0 %	11497178
84	NC_000950	CAAA	2	8	28959	28966	75 %	0 %	0 %	25 %	11497152
85	NC_000950	AAAT	2	8	28997	29004	75 %	25 %	0 %	0 %	11497152
86	NC_000950	AATT	2	8	29048	29055	50 %	50 %	0 %	0 %	11497152
87	NC_000950	TAGC	2	8	29155	29162	25 %	25 %	25 %	25 %	11497152
88	NC_000950	AGCA	2	8	29723	29730	50 %	0 %	25 %	25 %	11497152
89	NC_000950	AAAT	2	8	29749	29756	75 %	25 %	0 %	0 %	11497152

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.