MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-3

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000949	AAAAC	2	10	81	90	80 %	0 %	0 %	20 %	11497136
2	NC_000949	ATTAA	2	10	1780	1789	60 %	40 %	0 %	0 %	11497137
3	NC_000949	TAAAT	2	10	2415	2424	60 %	40 %	0 %	0 %	11497138
4	NC_000949	GAAAA	2	10	6915	6924	80 %	0 %	20 %	0 %	11497141
5	NC_000949	CACTT	2	10	8676	8685	20 %	40 %	0 %	40 %	11497143
6	NC_000949	CAAAA	2	10	9480	9489	80 %	0 %	0 %	20 %	11497145
7	NC_000949	GAAAA	2	10	10346	10355	80 %	0 %	20 %	0 %	11497146
8	NC_000949	AATCT	2	10	12262	12271	40 %	40 %	0 %	20 %	11497148
9	NC_000949	CAAAC	2	10	12314	12323	60 %	0 %	0 %	40 %	11497148
10	NC_000949	GGACT	2	10	12636	12645	20 %	20 %	40 %	20 %	11497130
11	NC_000949	TACTT	2	10	13279	13288	20 %	60 %	0 %	20 %	11497131
12	NC_000949	GAAAA	2	10	13357	13366	80 %	0 %	20 %	0 %	11497131
13	NC_000949	AAAGT	2	10	13379	13388	60 %	20 %	20 %	0 %	11497131
14	NC_000949	ATTAA	2	10	15221	15230	60 %	40 %	0 %	0 %	11497106
15	NC_000949	AGTAA	2	10	15858	15867	60 %	20 %	20 %	0 %	11497108
16	NC_000949	TCACT	2	10	16015	16024	20 %	40 %	0 %	40 %	11497108
17	NC_000949	TTGTT	2	10	16112	16121	0 %	80 %	20 %	0 %	365257003
18	NC_000949	TATGT	2	10	16222	16231	20 %	60 %	20 %	0 %	365257003
19	NC_000949	TAATT	2	10	16636	16645	40 %	60 %	0 %	0 %	11497132
20	NC_000949	AAAAC	2	10	16758	16767	80 %	0 %	0 %	20 %	11497132
21	NC_000949	AAAGA	2	10	16886	16895	80 %	0 %	20 %	0 %	11497132
22	NC_000949	ATAAA	2	10	18077	18086	80 %	20 %	0 %	0 %	11497111
23	NC_000949	ATTAT	2	10	22081	22090	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_000949	AAAAG	2	10	22124	22133	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000949	CAAAA	2	10	22411	22420	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_000949	TTTTA	2	10	23323	23332	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000949	CAATC	2	10	23539	23548	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_000949	GAGTT	2	10	24634	24643	20 %	40 %	40 %	0 %	365257006
29	NC_000949	ATAAA	2	10	25079	25088	80 %	20 %	0 %	0 %	11497120
30	NC_000949	TTTTG	2	10	26746	26755	0 %	80 %	20 %	0 %	11497122
31	NC_000949	AGATT	2	10	27913	27922	40 %	40 %	20 %	0 %	11497123
32	NC_000949	AAATA	2	10	27981	27990	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000949	TTATT	2	10	28043	28052	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000949	TTACA	2	10	30055	30064	40 %	40 %	0 %	20 %	11497124

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.