MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 5148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022784	GCA	2	6	19	24	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_022784	CTT	2	6	36	41	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_022784	TTG	2	6	108	113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022784	TGA	2	6	153	158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022784	TCA	2	6	167	172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_022784	GTT	2	6	182	187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022784	TGT	2	6	193	198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022784	ATG	2	6	4426	4431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022784	TGT	2	6	4447	4452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022784	TGT	2	6	5231	5236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022784	TGC	2	6	5287	5292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_022784	TGG	2	6	6379	6384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022784	TTA	2	6	6849	6854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022784	TGA	2	6	6958	6963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022784	CTG	2	6	6984	6989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_022784	GCC	2	6	8585	8590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_022784	CGA	3	9	10314	10322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_022784	CCA	2	6	10542	10547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_022784	TCA	2	6	10577	10582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_022784	GGT	2	6	10599	10604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022784	TGC	2	6	10691	10696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_022784	TTC	2	6	10726	10731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_022784	AGG	2	6	10747	10752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022784	TGG	2	6	10886	10891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022784	TGA	2	6	10911	10916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022784	CAT	2	6	11002	11007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_022784	GTT	2	6	11011	11016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022784	ACG	2	6	11057	11062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_022784	GTT	2	6	11166	11171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022784	CTT	2	6	11203	11208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_022784	TGG	2	6	11219	11224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022784	GGA	2	6	11348	11353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022784	TAC	2	6	12074	12079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_022784	ACA	2	6	12127	12132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_022784	GGC	2	6	12210	12215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_022784	CAT	2	6	12299	12304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_022784	CAT	2	6	12338	12343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_022784	GTT	2	6	12507	12512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022784	TAT	2	6	12738	12743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022784	CAG	2	6	12812	12817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_022784	CTG	2	6	13068	13073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_022784	TGT	2	6	13094	13099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022784	CGC	2	6	13160	13165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_022784	TGT	2	6	13192	13197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022784	GCG	2	6	13784	13789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_022784	GCC	2	6	15094	15099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_022784	AGT	2	6	15114	15119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022784	ACC	2	6	15151	15156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_022784	GCA	2	6	15178	15183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_022784	ATC	2	6	15203	15208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_022784	GCA	2	6	15212	15217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_022784	GCT	2	6	16137	16142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_022784	GGC	2	6	16155	16160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_022784	TGG	2	6	18540	18545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022784	TGC	2	6	18575	18580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_022784	TGT	3	9	18702	18710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022784	TGG	2	6	18751	18756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022784	AGT	2	6	18813	18818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022784	CTG	2	6	18858	18863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_022784	CGC	2	6	18911	18916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_022784	TGG	2	6	19051	19056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022784	CAG	2	6	19102	19107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_022784	GGT	2	6	19224	19229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022784	CCT	2	6	19238	19243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_022784	TGA	2	6	19352	19357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022784	AGT	2	6	19418	19423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022784	GAG	2	6	19461	19466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022784	TCC	2	6	19608	19613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_022784	TTA	2	6	19664	19669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022784	AGC	2	6	19683	19688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_022784	CGT	2	6	19703	19708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_022784	GGC	2	6	19764	19769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_022784	TTG	2	6	19830	19835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022784	AAC	2	6	19854	19859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_022784	AGA	2	6	19886	19891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022784	GCA	2	6	19897	19902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_022784	AAG	2	6	20007	20012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022784	GGT	2	6	20082	20087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022784	TGG	2	6	20174	20179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022784	TGA	2	6	20189	20194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022784	GCA	2	6	20336	20341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_022784	TGA	2	6	20378	20383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022784	CAG	2	6	20429	20434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_022784	AGC	2	6	20553	20558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_022784	GCA	2	6	20638	20643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_022784	CGG	2	6	20672	20677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_022784	AAC	2	6	20860	20865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_022784	CGC	2	6	21508	21513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_022784	ATG	2	6	24236	24241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022784	ACC	2	6	24254	24259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_022784	ATG	2	6	24266	24271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022784	CAG	2	6	24333	24338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_022784	CTG	2	6	24347	24352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_022784	TAG	2	6	24366	24371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022784	CTG	2	6	24375	24380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_022784	TGA	2	6	24381	24386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022784	GGA	2	6	24452	24457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022784	AAG	2	6	24509	24514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022784	TTA	2	6	24542	24547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022784	ACA	2	6	24819	24824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_022784	TCC	2	6	24889	24894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_022784	CAT	2	6	24953	24958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_022784	GTA	2	6	25007	25012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022784	GTG	3	9	25045	25053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022784	GCT	2	6	25058	25063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_022784	GCG	2	6	25097	25102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_022784	TGT	2	6	25103	25108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022784	AGG	2	6	25115	25120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022784	TGG	2	6	25124	25129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022784	CCA	2	6	27673	27678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_022784	ATA	2	6	27706	27711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022784	CCT	2	6	27752	27757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_022784	ACC	2	6	27763	27768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_022784	GCA	2	6	28108	28113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_022784	GCT	2	6	28122	28127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_022784	AAC	2	6	28964	28969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_022784	GGC	2	6	29018	29023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_022784	GGC	2	6	30983	30988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_022784	CCG	2	6	31087	31092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_022784	AGG	2	6	31103	31108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022784	CGG	2	6	31199	31204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_022784	TGC	2	6	31322	31327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_022784	TGT	2	6	31391	31396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022784	CAG	2	6	32645	32650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_022784	TGC	2	6	32785	32790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_022784	GCG	2	6	32795	32800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_022784	AGA	2	6	32881	32886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022784	TCC	2	6	32988	32993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_022784	GGT	2	6	33047	33052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022784	AGA	2	6	35357	35362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022784	TTG	2	6	35404	35409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022784	TAA	2	6	35435	35440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022784	ATT	2	6	35458	35463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022784	TGC	2	6	35495	35500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_022784	GCT	2	6	35514	35519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_022784	TAA	2	6	35549	35554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022784	TGA	2	6	35564	35569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022784	TCC	2	6	35593	35598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_022784	CCT	2	6	35621	35626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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142	NC_022784	CAC	2	6	35872	35877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_022784	CAC	2	6	35941	35946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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163	NC_022784	TTG	2	6	42043	42048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_022784	ACA	2	6	45490	45495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_022784	TAC	2	6	46342	46347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_022784	TCT	2	6	47529	47534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_022784	CTC	2	6	47566	47571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
176	NC_022784	TTC	2	6	47590	47595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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