MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 7734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_022784	AGC	2	6	578872	578877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_022784	CAT	2	6	578882	578887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_022784	ATA	2	6	578892	578897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_022784	CT	3	6	578903	578908	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4005	NC_022784	ATT	2	6	578941	578946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_022784	GCT	2	6	578961	578966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_022784	TTGC	2	8	578972	578979	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4008	NC_022784	CAAG	2	8	579007	579014	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4009	NC_022784	AAACG	2	10	579022	579031	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4010	NC_022784	CCA	2	6	579132	579137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4011	NC_022784	GCT	2	6	579139	579144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_022784	CAA	2	6	579235	579240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_022784	CGT	2	6	579265	579270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_022784	GCA	2	6	579381	579386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_022784	CAA	2	6	579406	579411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_022784	AGG	2	6	579427	579432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_022784	TC	3	6	579435	579440	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4018	NC_022784	GCA	2	6	579596	579601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_022784	CA	3	6	579621	579626	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4020	NC_022784	CAC	2	6	579783	579788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4021	NC_022784	GCA	2	6	579801	579806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_022784	CGG	3	9	579832	579840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_022784	CAC	2	6	579958	579963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4024	NC_022784	AAG	2	6	579984	579989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_022784	GGT	2	6	579995	580000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_022784	AGA	2	6	580054	580059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_022784	CG	3	6	580083	580088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4028	NC_022784	GT	3	6	580125	580130	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_022784	CTC	2	6	580131	580136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4030	NC_022784	CA	3	6	580157	580162	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4031	NC_022784	CTA	2	6	580218	580223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_022784	AGG	2	6	580254	580259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_022784	GCA	3	9	580364	580372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_022784	GAA	2	6	580421	580426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_022784	CAAC	2	8	580436	580443	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4036	NC_022784	GCT	2	6	580481	580486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_022784	G	6	6	580546	580551	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_022784	AAC	2	6	580592	580597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_022784	TAT	2	6	580598	580603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_022784	AGG	2	6	580725	580730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_022784	AACAT	2	10	580752	580761	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4042	NC_022784	GTG	2	6	580811	580816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_022784	N	54	54	581115	581168	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_022784	AAC	2	6	581193	581198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_022784	GCA	2	6	581217	581222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_022784	CGT	2	6	581238	581243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_022784	CGA	3	9	581251	581259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_022784	CA	3	6	581372	581377	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4049	NC_022784	C	6	6	581449	581454	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4050	NC_022784	TCA	2	6	581456	581461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_022784	AT	3	6	581484	581489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_022784	GC	3	6	581491	581496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4053	NC_022784	CAG	2	6	581512	581517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_022784	AGGC	2	8	581568	581575	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4055	NC_022784	GT	3	6	581615	581620	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_022784	TAC	2	6	581636	581641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_022784	ATC	2	6	581692	581697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_022784	TAC	2	6	581722	581727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_022784	TCAC	2	8	581887	581894	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4060	NC_022784	TCG	2	6	581942	581947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_022784	TAA	2	6	581974	581979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_022784	TC	3	6	581994	581999	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4063	NC_022784	CCA	2	6	582050	582055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4064	NC_022784	CAGA	2	8	582107	582114	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4065	NC_022784	GA	3	6	582119	582124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_022784	CTC	2	6	582125	582130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4067	NC_022784	TGC	2	6	582157	582162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_022784	T	6	6	582189	582194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_022784	AGC	2	6	582219	582224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_022784	AG	4	8	582238	582245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_022784	GT	3	6	582258	582263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_022784	CTT	2	6	582300	582305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_022784	CAAA	2	8	582355	582362	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4074	NC_022784	TAC	2	6	582406	582411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_022784	GCA	2	6	582428	582433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_022784	ATG	2	6	582576	582581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_022784	G	6	6	582634	582639	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_022784	AGG	2	6	582679	582684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_022784	ACC	2	6	582841	582846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4080	NC_022784	GAAA	2	8	582858	582865	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_022784	GAAAA	2	10	586328	586337	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_022784	GCA	2	6	586440	586445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_022784	GCA	2	6	588855	588860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_022784	ACA	2	6	588874	588879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_022784	CACT	2	8	588920	588927	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4086	NC_022784	CGG	2	6	588978	588983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_022784	CACAC	2	10	589072	589081	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
4088	NC_022784	AAT	2	6	589102	589107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_022784	TGC	2	6	589152	589157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_022784	GC	3	6	589807	589812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4091	NC_022784	CAC	2	6	589817	589822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4092	NC_022784	GAGC	2	8	589825	589832	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4093	NC_022784	GCT	2	6	590351	590356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_022784	TA	3	6	590394	590399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_022784	CA	3	6	590601	590606	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4096	NC_022784	AGC	2	6	594785	594790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_022784	TGC	2	6	594808	594813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_022784	CAA	2	6	594822	594827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_022784	AGC	2	6	594834	594839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_022784	CTG	2	6	594908	594913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_022784	CAA	2	6	594959	594964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_022784	ATA	2	6	598240	598245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_022784	GGTA	2	8	598304	598311	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_022784	T	8	8	598325	598332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_022784	CGG	2	6	598425	598430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_022784	TTG	2	6	599151	599156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_022784	TGC	2	6	599188	599193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_022784	AG	3	6	599234	599239	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_022784	GAC	2	6	599313	599318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_022784	GGT	2	6	599321	599326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_022784	TTGTA	2	10	599341	599350	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_022784	GTG	2	6	599379	599384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_022784	GA	3	6	599412	599417	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_022784	GAA	2	6	599436	599441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_022784	GCT	2	6	603339	603344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_022784	GCC	2	6	604426	604431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4117	NC_022784	ATC	2	6	604440	604445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_022784	TAC	2	6	606004	606009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_022784	AG	3	6	606039	606044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_022784	CAT	2	6	606068	606073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_022784	TCA	2	6	606198	606203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_022784	TGC	2	6	606263	606268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_022784	GTT	2	6	606269	606274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_022784	TGT	2	6	606275	606280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_022784	CG	4	8	606298	606305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4126	NC_022784	GA	3	6	607779	607784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_022784	GA	3	6	607844	607849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_022784	AT	3	6	607865	607870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_022784	AT	3	6	607976	607981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_022784	TTC	2	6	607982	607987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_022784	TTC	2	6	608087	608092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_022784	GGTA	2	8	608217	608224	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_022784	AGC	2	6	608872	608877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4134	NC_022784	TGA	2	6	608880	608885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_022784	AAC	2	6	608927	608932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4136	NC_022784	TGCG	2	8	608938	608945	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4137	NC_022784	TTG	2	6	608994	608999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4167	NC_022784	TAA	2	6	611585	611590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4168	NC_022784	CAGG	2	8	611617	611624	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4169	NC_022784	G	7	7	611669	611675	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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4177	NC_022784	GAA	2	6	612061	612066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4258	NC_022784	AACTC	2	10	622578	622587	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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4260	NC_022784	GC	3	6	622664	622669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4263	NC_022784	CCG	2	6	624170	624175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4269	NC_022784	CTG	2	6	624496	624501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4271	NC_022784	GAGT	2	8	624549	624556	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4279	NC_022784	CTG	2	6	624883	624888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4407	NC_022784	N	796	796	639776	640571	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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