MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 7734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_022784	GTG	2	6	441011	441016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_022784	GGT	2	6	441067	441072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_022784	A	6	6	441095	441100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_022784	TGC	2	6	441101	441106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_022784	AC	3	6	441478	441483	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3006	NC_022784	GTT	2	6	441831	441836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_022784	GGC	2	6	441840	441845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_022784	AT	3	6	441904	441909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_022784	TAT	2	6	442016	442021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_022784	TGT	2	6	443162	443167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_022784	TCA	2	6	443185	443190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_022784	CA	3	6	445037	445042	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3013	NC_022784	AT	3	6	447144	447149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_022784	CAA	2	6	447163	447168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_022784	AAC	2	6	447214	447219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_022784	CAG	2	6	449284	449289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_022784	GA	3	6	449315	449320	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_022784	GAT	2	6	449936	449941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_022784	TGA	2	6	450631	450636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_022784	AC	3	6	453154	453159	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3021	NC_022784	GCC	2	6	453396	453401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3022	NC_022784	AGC	2	6	453473	453478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_022784	TACCT	2	10	453506	453515	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3024	NC_022784	CCT	2	6	453539	453544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3025	NC_022784	CTTG	2	8	453572	453579	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3026	NC_022784	TTG	2	6	453592	453597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_022784	GC	3	6	453617	453622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3028	NC_022784	GAA	2	6	453625	453630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_022784	TCA	2	6	453649	453654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_022784	N	1102	1102	453666	454767	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_022784	GCG	2	6	454778	454783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_022784	GCG	2	6	454810	454815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_022784	AAT	3	9	454845	454853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_022784	CG	4	8	454907	454914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3035	NC_022784	TGT	2	6	454918	454923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_022784	CTT	2	6	454936	454941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_022784	TG	3	6	454949	454954	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_022784	GCC	2	6	455042	455047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3039	NC_022784	GTA	2	6	456552	456557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_022784	CTT	2	6	456559	456564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_022784	TCCGG	2	10	459094	459103	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3042	NC_022784	TGT	2	6	459171	459176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_022784	GTC	2	6	459220	459225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_022784	CCAT	2	8	459239	459246	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3045	NC_022784	GCA	2	6	459832	459837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_022784	ATC	2	6	459879	459884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_022784	GTCT	2	8	459957	459964	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3048	NC_022784	TGC	2	6	460108	460113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_022784	AC	3	6	460203	460208	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3050	NC_022784	CAGC	2	8	460216	460223	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3051	NC_022784	ATA	2	6	460267	460272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_022784	CAA	2	6	460294	460299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_022784	CGC	2	6	460314	460319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3054	NC_022784	GT	3	6	460395	460400	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_022784	GATA	2	8	460403	460410	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_022784	ACT	2	6	460442	460447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_022784	AAG	2	6	460493	460498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_022784	CTC	2	6	460592	460597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3059	NC_022784	TCA	2	6	460650	460655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_022784	ACA	2	6	460693	460698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_022784	TCG	2	6	460720	460725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_022784	CACG	2	8	462473	462480	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3063	NC_022784	CATG	2	8	462541	462548	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3064	NC_022784	G	7	7	462684	462690	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_022784	TGC	2	6	463765	463770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_022784	AT	3	6	463946	463951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_022784	GCC	2	6	464648	464653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3068	NC_022784	GCA	2	6	466406	466411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_022784	CA	3	6	466410	466415	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3070	NC_022784	TGC	2	6	466421	466426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_022784	AAT	2	6	466427	466432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_022784	N	603	603	466508	467110	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_022784	TAA	2	6	467140	467145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_022784	GTT	2	6	467172	467177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_022784	GAT	2	6	467247	467252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_022784	AT	3	6	467251	467256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_022784	TA	3	6	467382	467387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_022784	GC	3	6	467397	467402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3079	NC_022784	ACG	2	6	467439	467444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_022784	TGC	2	6	467468	467473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_022784	T	6	6	467501	467506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_022784	T	6	6	467744	467749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_022784	TG	3	6	467849	467854	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_022784	GCA	2	6	467855	467860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3085	NC_022784	CTT	2	6	467879	467884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_022784	GCA	2	6	467903	467908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_022784	GCA	2	6	467911	467916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_022784	AC	3	6	467975	467980	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3089	NC_022784	CCA	2	6	468027	468032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3090	NC_022784	AAC	2	6	468040	468045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_022784	TCCC	2	8	468055	468062	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3092	NC_022784	CGC	2	6	468072	468077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3093	NC_022784	AGC	2	6	468090	468095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_022784	TTA	2	6	468099	468104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_022784	TTGT	2	8	468120	468127	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_022784	AGC	2	6	468138	468143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_022784	GCC	2	6	468145	468150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3098	NC_022784	GATG	2	8	468152	468159	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_022784	GCT	2	6	468167	468172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_022784	CGG	2	6	470218	470223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_022784	GTA	2	6	472235	472240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_022784	GCGA	2	8	472241	472248	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3103	NC_022784	TCA	2	6	472338	472343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_022784	CCA	2	6	472407	472412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3105	NC_022784	CGG	2	6	472521	472526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_022784	CAG	2	6	472546	472551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_022784	CCG	2	6	472581	472586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3108	NC_022784	TAC	2	6	472687	472692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_022784	TAT	2	6	472867	472872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_022784	GCT	2	6	472906	472911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_022784	GC	3	6	472957	472962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3112	NC_022784	TGT	2	6	472967	472972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_022784	ATT	2	6	472982	472987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_022784	AG	3	6	473182	473187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_022784	GCAAA	2	10	473234	473243	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3116	NC_022784	CCA	2	6	473250	473255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3117	NC_022784	CAG	2	6	473260	473265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_022784	TAA	2	6	473292	473297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_022784	AAC	2	6	473315	473320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_022784	CAC	2	6	473333	473338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3121	NC_022784	GAC	2	6	473355	473360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_022784	TG	3	6	473527	473532	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_022784	GTT	2	6	473545	473550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_022784	TGT	2	6	473583	473588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_022784	CAA	2	6	473620	473625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_022784	TG	3	6	473637	473642	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_022784	TTG	2	6	473653	473658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_022784	CGA	2	6	473667	473672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_022784	TGC	2	6	473681	473686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_022784	CTTTG	2	10	473688	473697	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3131	NC_022784	TCC	2	6	474668	474673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3132	NC_022784	GCA	2	6	474700	474705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_022784	TGCAAC	2	12	474718	474729	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_022784	ATGG	2	8	475993	476000	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_022784	TGGT	2	8	476041	476048	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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