MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Anaplasma marginale str. Dawn genome

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022760	TACATC	2	12	7357	7368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_022760	GCCGCG	2	12	18150	18161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_022760	GAAGTA	2	12	24541	24552	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022760	CTACTT	2	12	36466	36477	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_022760	AAACCC	2	12	38112	38123	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_022760	TGGGTG	2	12	88519	88530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022760	CCTGTC	2	12	99303	99314	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8	NC_022760	GTGCTG	2	12	135182	135193	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_022760	AACTGC	2	12	158361	158372	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_022760	CGCCTG	2	12	159150	159161	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_022760	AGATAT	2	12	174574	174585	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022760	TATAAT	2	12	190627	190638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022760	AGGGGC	2	12	226905	226916	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_022760	ACAAAA	2	12	250706	250717	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_022760	GGTGCT	2	12	250969	250980	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_022760	TGGGCT	2	12	284692	284703	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_022760	TGTCGG	2	12	307925	307936	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_022760	ACCACT	2	12	309807	309818	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_022760	TATCCC	2	12	312503	312514	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_022760	ACATCT	2	12	322381	322392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_022760	GGGTTT	2	12	323762	323773	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022760	ATGCCC	2	12	335316	335327	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_022760	GTCAAT	2	12	342913	342924	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_022760	CCTTGC	2	12	343947	343958	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_022760	CATTGC	2	12	344953	344964	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_022760	AACAAT	2	12	345155	345166	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_022760	GCTGTT	2	12	345805	345816	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_022760	GATGCT	2	12	389577	389588	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_022760	AACTTC	2	12	391411	391422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_022760	CTTCAT	2	12	446393	446404	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_022760	TGCAAC	2	12	474785	474796	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_022760	GCGATA	2	12	496501	496512	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_022760	CACATC	2	12	523940	523951	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_022760	CGCACA	2	12	537767	537778	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_022760	GCAGCC	2	12	574269	574280	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_022760	GGCATA	2	12	578402	578413	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_022760	GTATGG	2	12	607143	607154	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022760	ACACCG	2	12	641005	641016	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_022760	TGCACA	2	12	643798	643809	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_022760	CGGTTC	2	12	644056	644067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_022760	CAGCTG	2	12	644076	644087	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_022760	GCAGGG	2	12	645355	645366	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_022760	TGCCGC	2	12	650735	650746	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_022760	GGAGGC	2	12	651662	651673	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_022760	ACCCAG	2	12	656310	656321	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46	NC_022760	CTACTT	2	12	663145	663156	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_022760	TGCAGC	2	12	715139	715150	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_022760	CCGGCA	2	12	726943	726954	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_022760	ATGTAC	2	12	742833	742844	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_022760	TCCTTG	2	12	743898	743909	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_022760	GCCCAC	2	12	761136	761147	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_022760	TCGCGC	2	12	766731	766742	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_022760	AGAATC	2	12	789022	789033	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_022760	TAGTGG	2	12	790460	790471	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022760	AGGGCA	2	12	790490	790501	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_022760	TAAACA	2	12	792915	792926	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_022760	TTCATC	2	12	798953	798964	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_022760	CTGTTG	2	12	811721	811732	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_022760	CTTACC	2	12	824120	824131	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_022760	TCAAGA	2	12	872951	872962	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_022760	TGGAGC	2	12	899486	899497	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_022760	GAAGTA	2	12	901904	901915	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022760	TGGGCG	2	12	902116	902127	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_022760	CCTGTA	2	12	902138	902149	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_022760	GGGCTT	2	12	932413	932424	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_022760	TGCACA	2	12	938281	938292	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_022760	TTTGAG	2	12	942910	942921	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022760	GCTCAC	2	12	944455	944466	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
69	NC_022760	ATTACT	2	12	946901	946912	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_022760	CAACCT	2	12	947059	947070	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_022760	TGTCAT	2	12	954556	954567	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_022760	ACACTT	2	12	956548	956559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_022760	CTCTTA	2	12	961386	961397	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_022760	CGTGTA	2	12	973398	973409	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_022760	ATGGAG	2	12	1021142	1021153	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022760	CTACTT	2	12	1037946	1037957	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_022760	CCCGGA	2	12	1062736	1062747	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_022760	GAGATT	2	12	1063712	1063723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022760	CGAACA	2	12	1065172	1065183	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_022760	CAGTAG	2	12	1083296	1083307	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_022760	CTACAA	2	12	1085040	1085051	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_022760	GATATA	2	12	1095240	1095251	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022760	CAAGAA	2	12	1102699	1102710	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_022760	CTACTT	2	12	1113602	1113613	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_022760	CCAGCT	2	12	1116613	1116624	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_022760	ACTCCC	2	12	1136624	1136635	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_022760	GCACCA	2	12	1180578	1180589	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
88	NC_022760	GAAGTA	2	12	1180887	1180898	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.