MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus 386B

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021991	TATTCG	2	12	27061	27072	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_021991	AAACAT	2	12	43138	43149	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_021991	TTCAGG	2	12	43211	43222	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021991	CAAAAA	2	12	56919	56930	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_021991	CAAAAA	2	12	77841	77852	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_021991	TTTTTG	2	12	164032	164043	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021991	CTCGCC	2	12	291721	291732	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_021991	CTGCAA	2	12	392080	392091	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021991	AAAAGA	2	12	401423	401434	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021991	CTCGCC	2	12	533232	533243	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_021991	CCGAAA	2	12	600080	600091	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021991	TTTTTA	2	12	631933	631944	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021991	GAGCCC	2	12	641372	641383	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021991	CGGTTC	2	12	646882	646893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021991	TATGGA	2	12	726100	726111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021991	AAAATA	2	12	743219	743230	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021991	GTTTTT	2	12	757199	757210	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021991	ATCACG	2	12	794203	794214	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021991	TGATCA	2	12	808285	808296	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_021991	TGTTCC	2	12	813206	813217	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021991	AACCCT	2	12	947681	947692	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_021991	GCTCCA	2	12	964950	964961	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_021991	AATATA	2	12	977625	977636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021991	CTCGCC	2	12	1005880	1005891	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_021991	TGCGGT	2	12	1031627	1031638	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021991	GAAAAA	2	12	1072318	1072329	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021991	ATCCTT	2	12	1129432	1129443	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021991	TCGTTA	2	12	1134267	1134278	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_021991	AAAATA	2	12	1145111	1145122	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021991	CAGAAA	2	12	1236155	1236166	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_021991	CTCGCC	2	12	1276496	1276507	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_021991	ACCTGC	2	12	1311653	1311664	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_021991	CCGGAT	2	12	1343425	1343436	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021991	TCGCTG	2	12	1366855	1366866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021991	GCTTGC	2	12	1367001	1367012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021991	CTCGCC	2	12	1431548	1431559	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_021991	TCTTAC	2	12	1452448	1452459	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021991	CTTTTT	2	12	1469016	1469027	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_021991	GCTTCT	2	12	1507043	1507054	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021991	TGCACA	2	12	1574310	1574321	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021991	TTTTTC	2	12	1641037	1641048	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_021991	GAAAAA	2	12	1666900	1666911	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021991	TATTTT	2	12	1713646	1713657	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021991	TTTTGC	2	12	1717833	1717844	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_021991	CTTTTC	2	12	1753570	1753581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021991	ACCTTT	2	12	1795793	1795804	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021991	CACAGG	2	12	1800973	1800984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021991	TGCCAC	2	12	1850775	1850786	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_021991	AGAAAA	2	12	1878830	1878841	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021991	TTCTGG	2	12	1909656	1909667	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_021991	GGCGCG	2	12	1978456	1978467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021991	AAACCA	2	12	2076424	2076435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021991	AAAATT	2	12	2085538	2085549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021991	TAAAAA	2	12	2087723	2087734	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021991	GCCGGG	2	12	2090560	2090571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021991	CAAGGG	2	12	2174971	2174982	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_021991	TCCGGT	2	12	2213430	2213441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_021991	GTGCGT	2	12	2266768	2266779	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_021991	AAAGAA	2	12	2270575	2270586	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021991	AAAAGG	2	12	2296421	2296432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021991	TGAACG	2	12	2309741	2309752	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_021991	TAAAGC	2	12	2317755	2317766	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_021991	GCAGTG	2	12	2332568	2332579	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_021991	GTGCTG	2	12	2332640	2332651	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_021991	CTCCGG	2	12	2363842	2363853	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
66	NC_021991	GCTCCG	2	12	2363973	2363984	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
67	NC_021991	GACGAA	2	12	2415349	2415360	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_021991	AGACGG	2	12	2494624	2494635	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_021991	CCTTTC	2	12	2553636	2553647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_021991	TTTTCT	2	12	2586346	2586357	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_021991	GGGGAT	2	12	2619910	2619921	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021991	TGTTGG	2	12	2620488	2620499	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021991	GGGCAG	2	12	2722154	2722165	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_021991	ACGGAA	2	12	2750193	2750204	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_021991	GGAACG	2	12	2771002	2771013	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.