MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus 386B plasmid Apa386Bp1

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021976	GAAG	2	8	1	8	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021976	CAGA	2	8	1943	1950	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021976	AGGA	2	8	5112	5119	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021976	TTTA	2	8	6226	6233	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021976	TATT	2	8	7827	7834	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021976	CTGG	2	8	13216	13223	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021976	AGGA	2	8	13740	13747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021976	TGCC	2	8	17927	17934	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021976	ATCC	2	8	18203	18210	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021976	ATTG	2	8	26982	26989	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021976	CTTA	2	8	27492	27499	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021976	ACTT	2	8	28658	28665	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021976	TACC	2	8	28692	28699	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021976	CAGA	2	8	29162	29169	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_021976	GTGC	2	8	29278	29285	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021976	TCAA	2	8	30308	30315	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021976	TATC	2	8	30340	30347	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021976	GCAG	2	8	32323	32330	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_021976	TGTT	2	8	36217	36224	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021976	CTGT	2	8	37384	37391	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021976	TATT	2	8	37479	37486	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021976	CCCG	2	8	39675	39682	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
23	NC_021976	GAAC	2	8	39786	39793	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_021976	GTTC	2	8	40146	40153	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_021976	AGCA	2	8	42389	42396	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_021976	TTAA	2	8	46480	46487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021976	GGGA	2	8	46662	46669	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021976	ACCG	2	8	52025	52032	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021976	TTCA	2	8	52341	52348	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_021976	AATT	2	8	52669	52676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021976	CATG	2	8	52793	52800	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021976	CGGA	2	8	54249	54256	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_021976	AGAC	2	8	58740	58747	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_021976	GGAG	2	8	62097	62104	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021976	CAAG	2	8	65314	65321	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_021976	GTCA	2	8	72747	72754	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_021976	CGAC	2	8	73302	73309	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_021976	CTTC	2	8	78983	78990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_021976	GTTC	2	8	81848	81855	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_021976	CGTT	2	8	82952	82959	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_021976	TCGT	2	8	82996	83003	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_021976	TCTG	2	8	83474	83481	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_021976	CGGT	2	8	86365	86372	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_021976	TTAA	2	8	90146	90153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021976	GTAT	2	8	90292	90299	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021976	TTGG	2	8	97388	97395	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021976	CGTC	2	8	99943	99950	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_021976	TTCC	2	8	100000	100007	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_021976	CCAC	2	8	105776	105783	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
50	NC_021976	ATCA	2	8	112962	112969	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_021976	CGAC	2	8	113491	113498	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_021976	TTGA	2	8	113909	113916	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021976	TCAA	2	8	115073	115080	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_021976	ATCA	2	8	115114	115121	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_021976	CCTG	2	8	119500	119507	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_021976	TCTG	2	8	119767	119774	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021976	CTCA	2	8	119821	119828	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_021976	TTTC	2	8	120899	120906	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_021976	TGTA	2	8	121167	121174	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021976	TCTT	2	8	122389	122396	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021976	AAAC	2	8	126400	126407	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_021976	AAAG	2	8	128673	128680	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021976	ATAA	2	8	129869	129876	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021976	GCAT	2	8	132793	132800	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_021976	ATAA	2	8	133370	133377	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021976	TATC	2	8	137304	137311	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_021976	AAAG	2	8	141597	141604	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021976	CTGG	2	8	152465	152472	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_021976	CTTT	2	8	153181	153188	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_021976	TTTA	2	8	153200	153207	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021976	GATG	2	8	156546	156553	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021976	TCAA	2	8	157510	157517	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_021976	AGCC	2	8	157541	157548	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_021976	CAAC	2	8	157553	157560	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_021976	GCCC	2	8	164046	164053	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
76	NC_021976	GTGG	2	8	169366	169373	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021976	ACCA	2	8	169443	169450	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_021976	CTGC	2	8	169547	169554	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_021976	AATG	2	8	170144	170151	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021976	TCAT	2	8	171004	171011	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_021976	TGCG	2	8	171411	171418	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_021976	ATGT	2	8	171456	171463	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021976	GGAA	2	8	172709	172716	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021976	CATT	2	8	175513	175520	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_021976	GAAA	2	8	175811	175818	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021976	TCGA	2	8	176625	176632	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_021976	CCAA	2	8	176783	176790	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021976	ACCG	2	8	177741	177748	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_021976	TCGA	2	8	178144	178151	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_021976	AGCC	2	8	178166	178173	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_021976	AGGT	2	8	189198	189205	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021976	ATGG	2	8	189958	189965	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021976	GGTA	2	8	193922	193929	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021976	TACC	2	8	193967	193974	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_021976	GGTA	2	8	193979	193986	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.