MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 genome

Total Repeats: 331

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021881	TAAGT	2	10	9148	9157	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021881	CATAG	2	10	10976	10985	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_021881	TGGGA	2	10	12163	12172	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021881	TATCT	2	10	12392	12401	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_021881	AAAAT	2	10	20879	20888	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021881	ACAAT	2	10	25929	25938	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_021881	AGGAG	2	10	28192	28201	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021881	CTTTT	2	10	44734	44743	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_021881	TAGGA	2	10	46852	46861	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021881	AAGTG	2	10	47945	47954	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021881	TATGA	2	10	48419	48428	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021881	AAATT	2	10	56182	56191	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021881	GGAAA	2	10	73421	73430	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021881	CTACA	2	10	73938	73947	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_021881	TTGTA	2	10	77420	77429	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021881	GCAAG	2	10	78885	78894	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_021881	CCCTA	2	10	80849	80858	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
18	NC_021881	ATCTT	2	10	83776	83785	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_021881	ACATA	2	10	85806	85815	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_021881	TTTTG	2	10	87310	87319	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021881	CCGTA	2	10	91384	91393	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_021881	AGATT	2	10	92537	92546	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021881	ATTTT	2	10	92842	92851	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021881	TGGTA	2	10	93387	93396	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021881	TTCTA	2	10	93901	93910	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_021881	TTTTC	2	10	108328	108337	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_021881	ATTGC	2	10	119031	119040	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_021881	GTAGG	2	10	121144	121153	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021881	TGTTT	2	10	121370	121379	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021881	ATTGC	2	10	121808	121817	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_021881	CAATC	2	10	122644	122653	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_021881	GTCTA	2	10	123168	123177	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_021881	CTCAA	2	10	126851	126860	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_021881	CTCAT	2	10	137448	137457	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_021881	ATTCT	2	10	149979	149988	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_021881	TTGTT	2	10	159607	159616	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021881	AGTTA	2	10	159766	159775	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021881	ATGTT	2	10	166141	166150	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021881	AAGAT	2	10	168719	168728	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021881	TAGAA	2	10	172179	172188	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021881	ATTGT	2	10	172588	172597	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021881	TTCTG	2	10	197397	197406	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_021881	CCTTA	2	10	203021	203030	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_021881	GGTAT	2	10	207630	207639	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021881	GTTTT	2	10	209217	209226	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021881	TAATA	2	10	212886	212895	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021881	TATAG	2	10	216354	216363	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021881	TTGCG	2	10	220800	220809	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_021881	TGTGA	2	10	220928	220937	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021881	ATTCT	2	10	225456	225465	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_021881	GATTG	2	10	226530	226539	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021881	TACTA	2	10	242314	242323	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_021881	CCTAT	2	10	250432	250441	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_021881	TTTTG	2	10	260598	260607	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021881	CTACA	2	10	295808	295817	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_021881	GTTAT	2	10	298059	298068	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021881	TTTAT	2	10	310552	310561	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021881	CAAGT	2	10	321882	321891	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_021881	TGCGC	2	10	338783	338792	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
60	NC_021881	ATAGA	2	10	339202	339211	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021881	ATTCT	2	10	339434	339443	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_021881	TGTGT	2	10	343256	343265	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021881	TAGAA	2	10	349072	349081	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021881	ACGTC	2	10	350225	350234	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_021881	ATAGT	2	10	363442	363451	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021881	CGCAG	2	10	383700	383709	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_021881	CAAAA	2	10	391989	391998	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_021881	GCATT	2	10	403657	403666	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_021881	TGTGG	2	10	415515	415524	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021881	GGTGG	2	10	419786	419795	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021881	TTATG	2	10	431200	431209	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021881	AATAC	2	10	449511	449520	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_021881	AATAC	2	10	449903	449912	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_021881	GGCTT	2	10	457941	457950	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_021881	TTCTA	2	10	476199	476208	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_021881	TGATA	2	10	478826	478835	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021881	CAAAA	2	10	480760	480769	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_021881	CTATC	2	10	491379	491388	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_021881	CCTGA	2	10	491883	491892	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_021881	CTATC	2	10	503793	503802	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_021881	AAGTG	2	10	512762	512771	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021881	ACCTT	2	10	520718	520727	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_021881	AGGGA	2	10	522573	522582	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021881	ATCTT	2	10	522649	522658	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_021881	TAAGG	2	10	523195	523204	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021881	GCGTA	2	10	523711	523720	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_021881	CCGTA	2	10	524133	524142	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_021881	AATTA	2	10	526389	526398	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021881	TATAC	2	10	534791	534800	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_021881	TATAC	2	10	541602	541611	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_021881	TAAAA	2	10	543436	543445	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021881	TTCTC	2	10	544917	544926	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_021881	CTGCG	2	10	548698	548707	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_021881	ATCTG	2	10	553497	553506	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_021881	ATAGA	2	10	554091	554100	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021881	AGCTA	2	10	560424	560433	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_021881	AGTAT	2	10	560490	560499	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021881	CATAG	2	10	582653	582662	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_021881	ATATG	2	10	583318	583327	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021881	TTAAG	2	10	586874	586883	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021881	TATGT	2	10	587199	587208	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021881	CATGT	2	10	589831	589840	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_021881	GATGT	2	10	590815	590824	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021881	TAGAA	2	10	590990	590999	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021881	GTTAT	2	10	595845	595854	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021881	ATATT	2	10	607899	607908	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021881	TCGCT	2	10	613752	613761	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_021881	GTACA	2	10	614195	614204	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_021881	GGGAA	2	10	617206	617215	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021881	AGTTT	2	10	617489	617498	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021881	ATCTG	2	10	618179	618188	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_021881	ATTCA	2	10	618933	618942	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_021881	TTATA	2	10	622474	622483	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021881	GTGTT	2	10	623638	623647	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021881	TGCCG	2	10	624399	624408	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
116	NC_021881	AATAC	2	10	624848	624857	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_021881	ATTCT	2	10	630112	630121	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_021881	GTTTT	2	10	631579	631588	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021881	ACCTA	2	10	631841	631850	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_021881	CCCAT	2	10	636696	636705	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
121	NC_021881	CTGTA	2	10	637014	637023	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_021881	AGGGA	2	10	641993	642002	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021881	CAATG	2	10	645019	645028	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_021881	GATAG	2	10	646246	646255	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021881	GTTTT	2	10	646398	646407	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021881	CTTAA	2	10	646442	646451	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_021881	TAGCA	2	10	647581	647590	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_021881	TAGAG	2	10	648431	648440	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021881	GATAT	2	10	655254	655263	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021881	CAAAA	2	10	655268	655277	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_021881	AAGCA	2	10	657523	657532	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_021881	CCGGG	2	10	660740	660749	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
133	NC_021881	CAATG	2	10	661547	661556	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_021881	ATCTT	2	10	661579	661588	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_021881	CTCTT	2	10	662073	662082	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_021881	ATTGG	2	10	663185	663194	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021881	CAATG	2	10	665221	665230	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_021881	TACAA	2	10	668135	668144	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_021881	AATAA	2	10	668682	668691	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021881	TATAT	2	10	672394	672403	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021881	ATTCA	2	10	678759	678768	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_021881	TAAAC	2	10	679172	679181	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_021881	CCTTG	2	10	684932	684941	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_021881	ATAAA	2	10	685283	685292	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021881	TCACT	2	10	690729	690738	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_021881	TTTCT	2	10	690778	690787	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_021881	AAGTA	2	10	691774	691783	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021881	TAATA	2	10	700989	700998	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021881	AGGAG	2	10	706290	706299	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_021881	TATTT	2	10	710220	710229	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021881	TGTAC	2	10	710582	710591	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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154	NC_021881	CTATC	2	10	714418	714427	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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162	NC_021881	CCCTA	2	10	745956	745965	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
163	NC_021881	TTAAT	2	10	751508	751517	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_021881	TGATA	2	10	1107228	1107237	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
273	NC_021881	ATAAA	2	10	1110266	1110275	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_021881	TTGAG	2	10	1176591	1176600	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
284	NC_021881	CATCG	2	10	1180979	1180988	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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329	NC_021881	CAAAA	2	10	1463564	1463573	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
330	NC_021881	CTATA	2	10	1467797	1467806	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
331	NC_021881	TTGTA	2	10	1472391	1472400	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.