MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 genome

Total Repeats: 8783

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_021881	AAT	2	6	1340912	1340917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_021881	TA	3	6	1340958	1340963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_021881	GAT	2	6	1341834	1341839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_021881	AAT	2	6	1341863	1341868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_021881	GTT	2	6	1343890	1343895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_021881	GTG	2	6	1343945	1343950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_021881	TAT	2	6	1343952	1343957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_021881	TTA	2	6	1344141	1344146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_021881	GGT	2	6	1345331	1345336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_021881	TTG	2	6	1345337	1345342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_021881	TCT	2	6	1346696	1346701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8012	NC_021881	CTA	2	6	1346726	1346731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8013	NC_021881	CTT	2	6	1346735	1346740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8014	NC_021881	CCG	2	6	1347406	1347411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8015	NC_021881	ACT	2	6	1347456	1347461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8016	NC_021881	TTA	2	6	1347507	1347512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_021881	ATG	2	6	1347516	1347521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_021881	TAGCA	2	10	1347541	1347550	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8019	NC_021881	CAAA	2	8	1348329	1348336	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8020	NC_021881	TAC	2	6	1348363	1348368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8021	NC_021881	TAG	2	6	1348394	1348399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_021881	TAT	2	6	1348422	1348427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_021881	CA	3	6	1348547	1348552	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8024	NC_021881	TTG	2	6	1348553	1348558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_021881	GCT	2	6	1348583	1348588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8026	NC_021881	ACT	2	6	1348602	1348607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8027	NC_021881	TCA	2	6	1348666	1348671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8028	NC_021881	GAAA	2	8	1348685	1348692	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_021881	CG	3	6	1350547	1350552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8030	NC_021881	AC	3	6	1350559	1350564	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8031	NC_021881	TAGA	2	8	1350597	1350604	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_021881	AGA	2	6	1350617	1350622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_021881	CGA	2	6	1350731	1350736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8034	NC_021881	AC	3	6	1350802	1350807	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8035	NC_021881	GTA	2	6	1350847	1350852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_021881	T	6	6	1351987	1351992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_021881	ACA	2	6	1352092	1352097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8038	NC_021881	GTA	2	6	1352136	1352141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_021881	AGC	2	6	1352197	1352202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8040	NC_021881	CA	3	6	1352209	1352214	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8041	NC_021881	TCT	2	6	1352231	1352236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8042	NC_021881	CATT	2	8	1353098	1353105	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8043	NC_021881	ACTA	2	8	1353119	1353126	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8044	NC_021881	TGC	2	6	1353180	1353185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8045	NC_021881	AGA	2	6	1353190	1353195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_021881	AACGTA	2	12	1353328	1353339	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8047	NC_021881	AGA	2	6	1353432	1353437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_021881	TAG	2	6	1353506	1353511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_021881	CTA	2	6	1353536	1353541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8050	NC_021881	TGT	2	6	1353900	1353905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_021881	TA	3	6	1353945	1353950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_021881	AG	3	6	1355072	1355077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_021881	TGC	2	6	1355117	1355122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8054	NC_021881	GTA	2	6	1355153	1355158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_021881	GTGTA	2	10	1355173	1355182	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_021881	GTAGA	2	10	1355305	1355314	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_021881	ATC	2	6	1355352	1355357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8058	NC_021881	TACT	2	8	1355368	1355375	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8059	NC_021881	ATC	2	6	1355385	1355390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8060	NC_021881	ATT	2	6	1355689	1355694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_021881	TAT	2	6	1355856	1355861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_021881	TAT	2	6	1355873	1355878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_021881	TA	3	6	1357265	1357270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_021881	AAG	2	6	1357275	1357280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_021881	ATTTT	2	10	1357301	1357310	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8067	NC_021881	GGT	2	6	1358718	1358723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_021881	GT	3	6	1358826	1358831	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_021881	A	6	6	1358850	1358855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_021881	TAT	2	6	1358865	1358870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_021881	AC	3	6	1358968	1358973	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8072	NC_021881	AAT	2	6	1358992	1358997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_021881	CAC	2	6	1359074	1359079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8074	NC_021881	CTA	2	6	1359097	1359102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8077	NC_021881	ACC	2	6	1359255	1359260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8078	NC_021881	CAC	2	6	1359365	1359370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8079	NC_021881	TTAT	2	8	1359588	1359595	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8081	NC_021881	TA	3	6	1359664	1359669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_021881	TCA	2	6	1359678	1359683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8083	NC_021881	CTTC	2	8	1359717	1359724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8084	NC_021881	ATC	2	6	1359804	1359809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8085	NC_021881	TCT	2	6	1359848	1359853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8086	NC_021881	A	7	7	1359860	1359866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_021881	TACCC	2	10	1359970	1359979	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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8091	NC_021881	TAA	2	6	1362228	1362233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_021881	ATA	2	6	1362264	1362269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_021881	AGT	2	6	1362276	1362281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8095	NC_021881	TAA	2	6	1362336	1362341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_021881	GTT	2	6	1362777	1362782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_021881	GGT	2	6	1362810	1362815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_021881	ATC	2	6	1362838	1362843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8099	NC_021881	TCT	2	6	1363173	1363178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8100	NC_021881	CAA	2	6	1363201	1363206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8101	NC_021881	GAA	2	6	1363493	1363498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_021881	AAGC	2	8	1363590	1363597	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8103	NC_021881	TAA	2	6	1363617	1363622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_021881	TAA	2	6	1363660	1363665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_021881	TCC	2	6	1363736	1363741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8106	NC_021881	CTA	2	6	1363749	1363754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8107	NC_021881	AGCT	2	8	1363783	1363790	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8108	NC_021881	T	6	6	1364209	1364214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_021881	TCT	2	6	1364222	1364227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8110	NC_021881	ATA	2	6	1364269	1364274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_021881	AAG	2	6	1364311	1364316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_021881	ATTT	2	8	1364345	1364352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_021881	CAA	2	6	1364360	1364365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8114	NC_021881	TTG	2	6	1364425	1364430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_021881	TAG	2	6	1364446	1364451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_021881	GGTA	2	8	1364498	1364505	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_021881	GAA	2	6	1364557	1364562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_021881	GTG	2	6	1364582	1364587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_021881	TGG	2	6	1364616	1364621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_021881	AGA	2	6	1364660	1364665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_021881	TTA	2	6	1364676	1364681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_021881	ATTC	2	8	1364711	1364718	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8123	NC_021881	T	6	6	1364764	1364769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_021881	TA	3	6	1364785	1364790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_021881	TCA	2	6	1364799	1364804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8126	NC_021881	CTTC	2	8	1364838	1364845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8127	NC_021881	ATC	2	6	1364925	1364930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8128	NC_021881	T	6	6	1367763	1367768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_021881	GCA	2	6	1367814	1367819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8130	NC_021881	AAT	2	6	1367832	1367837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8133	NC_021881	ATT	2	6	1370376	1370381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8242	NC_021881	CTGT	2	8	1388529	1388536	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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8250	NC_021881	T	7	7	1389468	1389474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8252	NC_021881	GTA	2	6	1390658	1390663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8254	NC_021881	GAA	2	6	1390710	1390715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8393	NC_021881	CT	3	6	1411853	1411858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8394	NC_021881	ATAA	2	8	1411886	1411893	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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