MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. JM

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021880	GCAGGA	2	12	73873	73884	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_021880	GCTTTA	2	12	80508	80519	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_021880	TAACTC	2	12	82766	82777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021880	TGCGTG	2	12	92548	92559	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_021880	TACGTT	2	12	122660	122671	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_021880	CAGTAT	2	12	127102	127113	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_021880	TATGGT	2	12	149310	149321	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021880	TTACCA	2	12	205454	205465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021880	TCACTG	2	12	205954	205965	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021880	ACAGAA	2	12	219106	219117	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_021880	CGAGGA	2	12	244208	244219	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_021880	CTATTA	2	12	288442	288453	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_021880	TACATA	2	12	317788	317799	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_021880	TAATAG	2	12	318414	318425	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021880	GCCCGT	2	12	394467	394478	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_021880	TTATGG	2	12	397538	397549	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021880	CTATAG	2	12	428105	428116	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_021880	TGTACT	2	12	428523	428534	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_021880	TAACGG	2	12	430584	430595	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_021880	TAAATG	2	12	430638	430649	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021880	TGGTAG	2	12	443365	443376	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021880	AGGGAG	2	12	448549	448560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021880	AATTTT	2	12	457989	458000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021880	AAATAG	2	12	519968	519979	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021880	AGATCA	2	12	533050	533061	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021880	TTATAC	2	12	561198	561209	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_021880	TACGTG	2	12	593882	593893	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_021880	CGATAT	2	12	603991	604002	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_021880	TAAAGC	2	12	607326	607337	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_021880	TTTTTA	2	12	618939	618950	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021880	TAGGTA	2	12	622854	622865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021880	GTTTTT	2	12	661569	661580	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021880	AGGTTG	2	12	664961	664972	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021880	TAGCAG	2	12	681348	681359	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_021880	ATTTCA	2	12	687123	687134	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_021880	CTTTTT	2	12	691959	691970	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_021880	AATCTG	2	12	692578	692589	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_021880	GTTTTG	2	12	692618	692629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021880	ATCTTT	2	12	695089	695100	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_021880	ATACTT	2	12	715195	715206	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_021880	ATGGCT	2	12	715224	715235	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_021880	AGAGAA	2	12	731037	731048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021880	AGGTTT	2	12	731399	731410	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021880	ACAGCC	2	12	735652	735663	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021880	AGCATG	2	12	736290	736301	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_021880	TAAAGT	2	12	738909	738920	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021880	AAAATG	2	12	749786	749797	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021880	ATTAAA	2	12	771678	771689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021880	ATATTA	2	12	772653	772664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021880	AAAAGC	2	12	785955	785966	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_021880	ATACTT	2	12	817603	817614	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_021880	GCGGTT	2	12	834180	834191	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_021880	TTCTGA	2	12	888142	888153	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_021880	GTTATG	2	12	894895	894906	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021880	TTTGTA	2	12	903444	903455	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021880	ATGGAA	2	12	951642	951653	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021880	CCGAAA	2	12	960353	960364	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_021880	CAAAAA	2	12	968209	968220	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_021880	AGAGGA	2	12	970452	970463	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021880	ATAATT	2	12	986555	986566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021880	CATATG	2	12	997538	997549	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_021880	TTTATG	2	12	1018666	1018677	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021880	GCTTTT	2	12	1041218	1041229	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_021880	GCCCCT	2	12	1047392	1047403	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_021880	TAGATA	2	12	1072292	1072303	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021880	CAGTAA	2	12	1081149	1081160	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_021880	TAAATA	2	12	1084800	1084811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021880	GCCCCT	2	12	1086026	1086037	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_021880	CTGTAT	2	12	1125764	1125775	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_021880	GGGCTT	2	12	1126205	1126216	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_021880	AAGTAT	2	12	1134241	1134252	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021880	CAAAGG	2	12	1144429	1144440	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_021880	CTGTAT	2	12	1164078	1164089	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_021880	GGGCTT	2	12	1164519	1164530	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_021880	TGCATA	2	12	1180859	1180870	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_021880	TACCCA	2	12	1183476	1183487	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_021880	TAAACA	2	12	1205818	1205829	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_021880	TAAACA	2	12	1207054	1207065	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_021880	TAAACA	2	12	1208275	1208286	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_021880	AACACA	2	12	1210705	1210716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021880	GTTTGC	2	12	1218339	1218350	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_021880	GGCGTT	2	12	1251559	1251570	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_021880	ACAGCA	2	12	1263047	1263058	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021880	AGAGCT	2	12	1283520	1283531	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_021880	GCTTCT	2	12	1283544	1283555	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021880	AAAAAC	2	12	1284946	1284957	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_021880	CGATTC	2	12	1320610	1320621	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_021880	AACGTA	2	12	1362727	1362738	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_021880	TCTGCA	2	12	1392408	1392419	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_021880	ACATGT	2	12	1395478	1395489	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_021880	GAATCG	2	12	1407155	1407166	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_021880	AACGTA	2	12	1416345	1416356	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_021880	CCACCC	2	12	1420463	1420474	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
94	NC_021880	TATGTA	2	12	1449600	1449611	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021880	TAGTAT	2	12	1451127	1451138	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021880	TGCGAA	2	12	1459599	1459610	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.