MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. JM

Total Repeats: 5191

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021880	ATG	2	6	14	19	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021880	TGT	2	6	46	51	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021880	TAA	2	6	55	60	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021880	TTC	2	6	61	66	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021880	ATG	2	6	5101	5106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021880	GCA	2	6	5207	5212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021880	ACG	2	6	5226	5231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021880	GAA	2	6	5664	5669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021880	AAG	2	6	5702	5707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021880	GTA	2	6	5758	5763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021880	TTG	2	6	6039	6044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021880	AAG	2	6	6090	6095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021880	AGA	2	6	6124	6129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021880	TGT	2	6	6133	6138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021880	GAG	2	6	7038	7043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021880	GTT	2	6	7770	7775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021880	CAA	2	6	7843	7848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021880	ATT	2	6	9085	9090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021880	ATA	2	6	9095	9100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021880	ATA	2	6	9105	9110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021880	ATA	2	6	9119	9124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021880	TGT	2	6	9229	9234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021880	AGC	2	6	10650	10655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021880	AAT	2	6	10716	10721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021880	ATA	2	6	10790	10795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021880	AGA	2	6	10964	10969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021880	GAT	2	6	11031	11036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021880	CTG	2	6	11065	11070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021880	GCA	2	6	11087	11092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021880	TAT	2	6	11095	11100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021880	AAG	2	6	11156	11161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021880	AGC	2	6	11214	11219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021880	TGC	2	6	11360	11365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021880	TAA	3	9	11461	11469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021880	TAA	2	6	12238	12243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021880	TAA	2	6	12264	12269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021880	ACT	2	6	12301	12306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021880	TAA	2	6	12330	12335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021880	CAT	2	6	12365	12370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021880	CTT	2	6	15408	15413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021880	GAA	2	6	15427	15432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021880	ATC	2	6	17484	17489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021880	AAT	2	6	20649	20654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021880	ACA	2	6	20735	20740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021880	CAG	2	6	21834	21839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021880	ATT	2	6	23596	23601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021880	TAA	2	6	24493	24498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021880	AAG	2	6	25919	25924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021880	TAA	2	6	25941	25946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021880	ATA	2	6	25974	25979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021880	TAA	2	6	25990	25995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021880	AGG	2	6	26042	26047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021880	ATT	2	6	26192	26197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021880	GCT	2	6	26700	26705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021880	AGC	2	6	26805	26810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021880	AAC	2	6	26835	26840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021880	TAG	2	6	26862	26867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021880	TAC	2	6	26894	26899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021880	TAA	3	9	26930	26938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021880	GTA	2	6	27271	27276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021880	AGC	3	9	27910	27918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021880	AAC	2	6	27940	27945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021880	TAG	2	6	27967	27972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021880	CTT	2	6	27987	27992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021880	AAT	2	6	27999	28004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021880	AAT	2	6	28045	28050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021880	ATA	2	6	28068	28073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021880	AAT	2	6	28085	28090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021880	GTA	2	6	28108	28113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021880	TCT	2	6	28319	28324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021880	ATT	2	6	28349	28354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021880	ACT	2	6	28761	28766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021880	TCA	2	6	28784	28789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021880	TGT	2	6	30731	30736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021880	TAA	2	6	31083	31088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021880	AAC	2	6	31157	31162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021880	ATC	2	6	31177	31182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021880	ATT	2	6	31214	31219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021880	GTA	2	6	31355	31360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021880	GAA	2	6	31385	31390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021880	TAT	2	6	31410	31415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021880	ACG	2	6	31432	31437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_021880	CGT	2	6	31448	31453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021880	TGC	2	6	31492	31497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021880	CAG	2	6	31524	31529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021880	ATT	2	6	31555	31560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021880	ATA	2	6	36421	36426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021880	AAT	2	6	36546	36551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021880	GAG	2	6	37862	37867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021880	GCA	2	6	38707	38712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021880	ATT	2	6	38729	38734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021880	ATA	2	6	38771	38776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021880	CGT	2	6	38961	38966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_021880	GGA	2	6	38970	38975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021880	GGA	2	6	41336	41341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021880	CTA	2	6	41540	41545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021880	GTG	2	6	41596	41601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021880	TTA	2	6	44351	44356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021880	TGT	2	6	44381	44386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021880	TTA	2	6	44400	44405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021880	ATA	2	6	44559	44564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021880	ACC	2	6	44593	44598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_021880	AAG	2	6	44601	44606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021880	TTG	2	6	44663	44668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021880	GCA	2	6	46198	46203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021880	ACA	2	6	46227	46232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_021880	AAC	2	6	46590	46595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021880	AAC	2	6	46645	46650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_021880	TAG	2	6	46717	46722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021880	GAT	2	6	46739	46744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021880	ATT	2	6	46798	46803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021880	CAG	2	6	46820	46825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021880	TTG	2	6	46861	46866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021880	CAG	2	6	47013	47018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_021880	AAG	2	6	47046	47051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021880	ACT	2	6	47091	47096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_021880	ACA	2	6	47879	47884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021880	GTT	2	6	49058	49063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021880	AAG	2	6	55878	55883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021880	CTG	2	6	55893	55898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_021880	TAA	2	6	55927	55932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021880	TTC	2	6	60518	60523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_021880	GTT	2	6	60559	60564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021880	GAT	2	6	60615	60620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021880	GTT	2	6	60712	60717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021880	TTA	2	6	62096	62101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021880	AGC	2	6	62117	62122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_021880	GCT	2	6	62134	62139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021880	CAG	2	6	62159	62164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_021880	TAA	2	6	63489	63494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021880	ACT	2	6	63582	63587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_021880	ACA	2	6	63612	63617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_021880	TCT	2	6	63750	63755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_021880	CTT	2	6	64093	64098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_021880	GTT	2	6	64163	64168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021880	GTT	2	6	64227	64232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021880	TGC	2	6	64253	64258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_021880	TTC	2	6	64397	64402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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140	NC_021880	GAT	2	6	65721	65726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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