MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. JM

Total Repeats: 5191

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021880	AGA	2	6	1438127	1438132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_021880	ATA	2	6	1438331	1438336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_021880	TAT	2	6	1438526	1438531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_021880	ATG	2	6	1438541	1438546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_021880	AGC	2	6	1438625	1438630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_021880	AGC	2	6	1438724	1438729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_021880	ATT	2	6	1438744	1438749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_021880	GAC	2	6	1438853	1438858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_021880	ATA	2	6	1439025	1439030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_021880	AGC	2	6	1439057	1439062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_021880	GCA	2	6	1439161	1439166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_021880	ACT	2	6	1440985	1440990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_021880	AGC	2	6	1443072	1443077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_021880	GGC	2	6	1443117	1443122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_021880	TAA	2	6	1443161	1443166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_021880	TAT	2	6	1443221	1443226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_021880	TGC	2	6	1443320	1443325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_021880	TGA	2	6	1443385	1443390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_021880	TTC	2	6	1443395	1443400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_021880	CTT	2	6	1443564	1443569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_021880	TAA	2	6	1443618	1443623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_021880	GAT	2	6	1443692	1443697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_021880	TAT	2	6	1443779	1443784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_021880	ATT	2	6	1443807	1443812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_021880	ATT	2	6	1443821	1443826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_021880	ATA	2	6	1444072	1444077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_021880	TAA	2	6	1444113	1444118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_021880	AGA	2	6	1444896	1444901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_021880	AGT	2	6	1444961	1444966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_021880	ATC	2	6	1445284	1445289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_021880	CAA	2	6	1445348	1445353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_021880	TAT	2	6	1445413	1445418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_021880	TTG	2	6	1445429	1445434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_021880	AAC	2	6	1445458	1445463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_021880	ACC	2	6	1446380	1446385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5036	NC_021880	TGA	2	6	1446436	1446441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_021880	CTC	2	6	1446450	1446455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5038	NC_021880	AAT	2	6	1446508	1446513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_021880	TGC	2	6	1446580	1446585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_021880	GTA	3	9	1448056	1448064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_021880	TGC	2	6	1448407	1448412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_021880	GCA	2	6	1448440	1448445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_021880	GTG	2	6	1448579	1448584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_021880	GTG	2	6	1448633	1448638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_021880	TGC	3	9	1448698	1448706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_021880	TCT	2	6	1448855	1448860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_021880	TTA	2	6	1449057	1449062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_021880	CTA	3	9	1449113	1449121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_021880	GGT	2	6	1449200	1449205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_021880	TTA	2	6	1449314	1449319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_021880	CTA	3	9	1449370	1449378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_021880	ACA	2	6	1449428	1449433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_021880	TTA	2	6	1449564	1449569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_021880	GGT	2	6	1449707	1449712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_021880	TAC	3	9	1449715	1449723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_021880	AGT	2	6	1449919	1449924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_021880	ACC	2	6	1449996	1450001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5058	NC_021880	TGA	2	6	1450050	1450055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_021880	CTC	2	6	1450064	1450069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5060	NC_021880	AAT	2	6	1450122	1450127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_021880	ATT	2	6	1450175	1450180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_021880	GTA	2	6	1450558	1450563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_021880	ATT	2	6	1450583	1450588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_021880	AAG	2	6	1450745	1450750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_021880	CGT	2	6	1450764	1450769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_021880	ACA	2	6	1450801	1450806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_021880	CAC	2	6	1451117	1451122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5068	NC_021880	GCG	2	6	1451188	1451193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_021880	CTA	2	6	1451200	1451205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_021880	AAT	2	6	1451259	1451264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_021880	TTG	2	6	1452162	1452167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_021880	TTG	2	6	1453752	1453757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_021880	ATT	2	6	1453784	1453789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_021880	TAA	2	6	1453797	1453802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_021880	GCA	2	6	1453817	1453822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_021880	GGT	2	6	1454829	1454834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_021880	CAT	2	6	1454842	1454847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_021880	AAG	2	6	1454888	1454893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_021880	AAT	2	6	1454918	1454923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_021880	TCT	2	6	1454953	1454958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_021880	GCA	2	6	1455427	1455432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_021880	ACG	2	6	1455520	1455525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_021880	GAG	2	6	1455538	1455543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_021880	CTA	2	6	1456255	1456260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_021880	TAA	2	6	1456877	1456882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_021880	CTA	2	6	1456946	1456951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_021880	TGT	2	6	1456964	1456969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_021880	CTA	2	6	1457596	1457601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_021880	ACC	2	6	1458861	1458866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5090	NC_021880	TAA	2	6	1459422	1459427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_021880	TTA	2	6	1459547	1459552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_021880	TAG	2	6	1459693	1459698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_021880	TTC	2	6	1459718	1459723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5095	NC_021880	GTT	2	6	1459779	1459784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_021880	ATC	2	6	1459822	1459827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_021880	AGG	2	6	1459884	1459889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_021880	TTC	2	6	1461709	1461714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_021880	TAT	2	6	1461791	1461796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_021880	TCT	2	6	1461808	1461813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_021880	ATT	2	6	1461815	1461820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_021880	GGT	2	6	1461828	1461833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_021880	ATT	2	6	1461882	1461887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_021880	TTA	2	6	1462151	1462156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_021880	CTC	2	6	1462757	1462762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5106	NC_021880	AGG	2	6	1462818	1462823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_021880	CTA	2	6	1462882	1462887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_021880	GTA	2	6	1462908	1462913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_021880	AGC	2	6	1463555	1463560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_021880	AAC	2	6	1463585	1463590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_021880	TAG	2	6	1463612	1463617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_021880	TAC	2	6	1463644	1463649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_021880	TAA	3	9	1463680	1463688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_021880	ATC	2	6	1463746	1463751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_021880	CAT	2	6	1464886	1464891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_021880	TAA	2	6	1464901	1464906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_021880	ATT	2	6	1465085	1465090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_021880	TCT	2	6	1465138	1465143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_021880	GAG	2	6	1465180	1465185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_021880	AAT	2	6	1465197	1465202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_021880	TAA	2	6	1465217	1465222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_021880	AGT	2	6	1465899	1465904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_021880	ACT	2	6	1465937	1465942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_021880	AAC	2	6	1466017	1466022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_021880	ACT	2	6	1466038	1466043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5127	NC_021880	ATT	2	6	1466098	1466103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.