MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. HZ2

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021879	GCAGGA	2	12	74006	74017	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_021879	GCTTTA	2	12	80641	80652	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_021879	TAACTC	2	12	82899	82910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021879	CACCCT	2	12	83525	83536	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_021879	TGCGTG	2	12	92681	92692	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_021879	CAGTAT	2	12	127235	127246	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_021879	TATGGT	2	12	149444	149455	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021879	TTACCA	2	12	207196	207207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021879	TCACTG	2	12	207696	207707	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021879	ACAGAA	2	12	221195	221206	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_021879	CGAGGA	2	12	246297	246308	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_021879	CTATTA	2	12	290530	290541	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_021879	TACATA	2	12	320121	320132	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_021879	TAATAG	2	12	320748	320759	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021879	GCCCGT	2	12	393222	393233	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_021879	TTATGG	2	12	396293	396304	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021879	CTATAG	2	12	427286	427297	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_021879	TGTACT	2	12	427704	427715	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_021879	TAACGG	2	12	429765	429776	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_021879	TAAATG	2	12	429819	429830	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021879	TGGTAG	2	12	442456	442467	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021879	AGGGAG	2	12	447646	447657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021879	AATTTT	2	12	457086	457097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021879	AAATAG	2	12	520018	520029	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021879	AGATCA	2	12	533101	533112	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021879	TTATAC	2	12	560149	560160	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_021879	TACGTG	2	12	592703	592714	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_021879	CGATAT	2	12	602703	602714	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_021879	TAAAGC	2	12	606038	606049	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_021879	TTTTTA	2	12	617650	617661	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021879	TAGGTA	2	12	621565	621576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021879	GTTTTT	2	12	660259	660270	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021879	AGGTTG	2	12	663598	663609	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021879	TAGCAG	2	12	680820	680831	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_021879	ATTTCA	2	12	686596	686607	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_021879	CTTTTT	2	12	691432	691443	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_021879	AATCTG	2	12	692051	692062	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_021879	ATCTTT	2	12	694563	694574	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_021879	ATACTT	2	12	714644	714655	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_021879	ATGGCT	2	12	714673	714684	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_021879	AGAGAA	2	12	730475	730486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021879	AGGTTT	2	12	730824	730835	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021879	ACAGCC	2	12	735077	735088	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021879	AGCATG	2	12	735715	735726	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_021879	AAAATG	2	12	749340	749351	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021879	ATTAAA	2	12	770350	770361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021879	ATATTA	2	12	771289	771300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021879	AAAAGC	2	12	784592	784603	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_021879	ATACTT	2	12	816259	816270	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_021879	GCGGTT	2	12	832848	832859	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_021879	TTCTGA	2	12	886724	886735	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_021879	GTTATG	2	12	893465	893476	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021879	TTTGTA	2	12	901938	901949	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021879	ATGGAA	2	12	951296	951307	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021879	CCGAAA	2	12	960122	960133	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021879	CAAAAA	2	12	967978	967989	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_021879	AGAGGA	2	12	970221	970232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021879	ATAATT	2	12	986327	986338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021879	CATATG	2	12	997336	997347	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_021879	TTTATG	2	12	1018267	1018278	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021879	GCTTTT	2	12	1040285	1040296	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_021879	GCCCCT	2	12	1046460	1046471	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_021879	TAGATA	2	12	1071360	1071371	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021879	CAGTAA	2	12	1080218	1080229	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_021879	TAAATA	2	12	1083869	1083880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021879	GCCCCT	2	12	1085098	1085109	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_021879	CTGTAT	2	12	1124851	1124862	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_021879	GGGCTT	2	12	1125292	1125303	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_021879	CAAAGG	2	12	1143524	1143535	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_021879	CTGTAT	2	12	1162133	1162144	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_021879	GGGCTT	2	12	1162574	1162585	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_021879	TGCATA	2	12	1178947	1178958	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_021879	TACCCA	2	12	1181564	1181575	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_021879	TAAACA	2	12	1203870	1203881	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_021879	TAAACA	2	12	1205091	1205102	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_021879	AACACA	2	12	1207521	1207532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021879	GTTTGC	2	12	1215158	1215169	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_021879	GGCGTT	2	12	1247581	1247592	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_021879	ACAGCA	2	12	1259051	1259062	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021879	AGAGCT	2	12	1279561	1279572	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_021879	GCTTCT	2	12	1279585	1279596	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021879	AAAAAC	2	12	1280987	1280998	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_021879	CGATTC	2	12	1315808	1315819	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021879	AAGTAT	2	12	1337431	1337442	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021879	AACGTA	2	12	1357974	1357985	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_021879	TCTGCA	2	12	1388315	1388326	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021879	ACATGT	2	12	1391384	1391395	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_021879	GAATCG	2	12	1403062	1403073	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_021879	AACGTA	2	12	1412252	1412263	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_021879	CCACCC	2	12	1416370	1416381	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
91	NC_021879	TATGTA	2	12	1444980	1444991	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021879	TAGTAT	2	12	1446507	1446518	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021879	TGCGAA	2	12	1454861	1454872	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.