MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acinetobacter baumannii BJAB07104 plasmid p1BJAB07104

Total Repeats: 252

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021727	TTA	2	6	166	171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021727	ATT	2	6	177	182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021727	GCAA	2	8	213	220	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021727	CTC	2	6	495	500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_021727	ATT	2	6	530	535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021727	CCA	2	6	1928	1933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_021727	AT	3	6	1953	1958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021727	GAAAA	2	10	1963	1972	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021727	A	6	6	1976	1981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021727	A	6	6	1990	1995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021727	ATA	2	6	2044	2049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021727	AAT	2	6	2055	2060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021727	ATA	2	6	2894	2899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021727	ATATT	2	10	2913	2922	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021727	AT	3	6	2927	2932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021727	TTA	2	6	2977	2982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021727	ATA	2	6	3593	3598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021727	ATT	2	6	3963	3968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021727	ACCTT	2	10	5784	5793	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_021727	CAA	2	6	5828	5833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021727	TAC	2	6	7965	7970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021727	AAC	2	6	7998	8003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021727	GTT	2	6	8033	8038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021727	CAA	2	6	8048	8053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021727	A	8	8	9454	9461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021727	TTATT	2	10	9473	9482	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021727	TATT	2	8	9496	9503	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021727	TGA	2	6	10140	10145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021727	CCT	2	6	10161	10166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_021727	GCA	2	6	10227	10232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021727	ATAG	2	8	10330	10337	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021727	ATG	2	6	10425	10430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021727	ATCT	2	8	10471	10478	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_021727	TTC	2	6	11332	11337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021727	TAA	2	6	13049	13054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021727	ATTT	2	8	13079	13086	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021727	TTA	2	6	13147	13152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021727	TA	3	6	13161	13166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021727	TTGA	2	8	13204	13211	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021727	TATC	2	8	13256	13263	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_021727	TGT	2	6	13377	13382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021727	ATT	2	6	13390	13395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021727	A	6	6	13422	13427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021727	T	6	6	14055	14060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021727	ATT	2	6	14861	14866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021727	GAT	2	6	14871	14876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021727	TA	3	6	14879	14884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021727	T	6	6	14886	14891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021727	AAAT	2	8	14904	14911	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021727	A	6	6	14936	14941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021727	TAA	2	6	14949	14954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021727	T	6	6	14971	14976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021727	TTA	2	6	15187	15192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021727	TTGGC	2	10	15195	15204	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_021727	T	7	7	15205	15211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021727	A	7	7	15220	15226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021727	AATAA	2	10	15233	15242	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021727	TCTCT	2	10	15582	15591	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_021727	AAC	2	6	15656	15661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021727	GTT	2	6	15668	15673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021727	CTTT	2	8	15678	15685	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_021727	CCA	2	6	15690	15695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_021727	TGA	2	6	15710	15715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021727	GGA	2	6	15727	15732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021727	CGT	2	6	15741	15746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021727	TA	3	6	15759	15764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021727	TAA	2	6	15774	15779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021727	TGC	2	6	15798	15803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021727	A	7	7	15854	15860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021727	TAT	2	6	15863	15868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021727	A	6	6	15880	15885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021727	ATT	2	6	15928	15933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021727	GATTT	2	10	15964	15973	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021727	CTC	2	6	16000	16005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_021727	TAAA	2	8	16060	16067	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021727	CT	3	6	17371	17376	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_021727	CTTT	2	8	17378	17385	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_021727	TTC	2	6	18040	18045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021727	TAT	2	6	18555	18560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021727	T	7	7	18560	18566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021727	A	7	7	18567	18573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021727	AGT	2	6	18592	18597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021727	TAA	2	6	21870	21875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021727	TTA	2	6	21898	21903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021727	AAC	2	6	21928	21933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021727	TAA	2	6	22003	22008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021727	ACT	2	6	22025	22030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_021727	TACT	2	8	22050	22057	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_021727	AAATAA	2	12	22061	22072	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021727	TTCA	2	8	22073	22080	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_021727	A	8	8	22126	22133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021727	TCAA	2	8	22134	22141	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_021727	AC	3	6	23337	23342	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_021727	TTGC	2	8	23368	23375	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_021727	AAG	2	6	23383	23388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021727	TAA	2	6	23428	23433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021727	TTA	2	6	23447	23452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021727	GA	3	6	23459	23464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021727	TCAA	2	8	23531	23538	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_021727	ATTT	2	8	23597	23604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021727	T	6	6	23602	23607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021727	T	7	7	23748	23754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021727	TAT	2	6	23759	23764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021727	ATT	2	6	23778	23783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021727	TAA	2	6	23790	23795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021727	T	6	6	24331	24336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021727	AATG	2	8	24349	24356	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021727	A	7	7	25722	25728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021727	TAA	2	6	25760	25765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021727	T	6	6	25777	25782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021727	ATG	2	6	25783	25788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021727	ATAG	2	8	25837	25844	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021727	ATG	2	6	25932	25937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021727	ATCT	2	8	25978	25985	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_021727	GTTGC	2	10	26086	26095	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_021727	TCA	2	6	26179	26184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_021727	CAATT	2	10	26234	26243	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_021727	AAC	2	6	26255	26260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_021727	TA	3	6	26267	26272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021727	ATC	2	6	26274	26279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_021727	T	7	7	26298	26304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021727	GCT	2	6	26322	26327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_021727	TA	3	6	26376	26381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021727	TAT	3	9	26389	26397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021727	T	6	6	26423	26428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021727	A	6	6	27231	27236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021727	T	6	6	27257	27262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021727	TAA	2	6	27275	27280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021727	ATTG	2	8	27361	27368	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021727	C	6	6	46337	46342	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
131	NC_021727	T	7	7	46704	46710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021727	TTA	2	6	46715	46720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021727	T	7	7	46724	46730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021727	A	8	8	47640	47647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021727	ACAG	2	8	47673	47680	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_021727	TTAC	2	8	47708	47715	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_021727	TTAT	2	8	47784	47791	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021727	AGA	2	6	47831	47836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021727	TGAA	2	8	47919	47926	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021727	TAA	2	6	48004	48009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021727	ACA	2	6	48028	48033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_021727	CATTT	2	10	48058	48067	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_021727	TGA	2	6	48097	48102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021727	T	6	6	48140	48145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021727	CAA	2	6	48158	48163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_021727	T	6	6	48202	48207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021727	CTAA	2	8	48731	48738	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_021727	ATTA	2	8	48821	48828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021727	A	8	8	48944	48951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021727	AGTAG	2	10	48963	48972	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.