MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Alistipes shahii WAL 8301 draft genome

Total Repeats: 23269

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021030	CGTA	2	8	541717	541724	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3502	NC_021030	CG	3	6	541768	541773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3503	NC_021030	ACA	2	6	541786	541791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_021030	GCA	2	6	541864	541869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_021030	TGC	2	6	541873	541878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_021030	CGA	2	6	541880	541885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_021030	ACG	2	6	541909	541914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_021030	ACC	2	6	541954	541959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3509	NC_021030	GAA	2	6	542036	542041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_021030	GCG	2	6	542101	542106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_021030	TTCG	2	8	542117	542124	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3512	NC_021030	GCGG	2	8	542171	542178	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3513	NC_021030	CAA	2	6	542213	542218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_021030	AGG	2	6	542281	542286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_021030	CCG	2	6	542287	542292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3516	NC_021030	CGA	2	6	542336	542341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_021030	AAG	2	6	542433	542438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_021030	TTA	2	6	542521	542526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_021030	CTA	2	6	542978	542983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_021030	CGC	2	6	543675	543680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3521	NC_021030	CGT	2	6	543687	543692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_021030	CTC	2	6	543721	543726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3523	NC_021030	CGT	2	6	543747	543752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_021030	ATT	2	6	543757	543762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_021030	CAA	2	6	543765	543770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_021030	GGT	2	6	543781	543786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_021030	A	7	7	543791	543797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_021030	CCT	2	6	543805	543810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3529	NC_021030	GTTC	2	8	545889	545896	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3530	NC_021030	AACA	2	8	546678	546685	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3531	NC_021030	TCCG	2	8	546716	546723	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3532	NC_021030	A	6	6	546726	546731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_021030	GCG	2	6	546760	546765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_021030	CTG	2	6	546816	546821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_021030	CGG	2	6	546835	546840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_021030	GCT	2	6	546906	546911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_021030	AAAT	2	8	546925	546932	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_021030	CAG	2	6	547015	547020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_021030	TG	3	6	547051	547056	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_021030	GCT	2	6	547112	547117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_021030	CGA	2	6	547166	547171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_021030	ATC	2	6	547219	547224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_021030	CCGG	2	8	547252	547259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3544	NC_021030	GCC	2	6	547297	547302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3545	NC_021030	GGC	2	6	547330	547335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_021030	AGT	2	6	547408	547413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_021030	A	6	6	549394	549399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_021030	GAG	2	6	549473	549478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_021030	AACTA	2	10	549560	549569	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3550	NC_021030	GTTC	2	8	552454	552461	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3551	NC_021030	GCG	2	6	552509	552514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_021030	GCC	2	6	552568	552573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_021030	GGC	2	6	552581	552586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_021030	ATA	3	9	553848	553856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_021030	CGC	2	6	553944	553949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3556	NC_021030	GGC	2	6	555047	555052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_021030	GCC	2	6	555101	555106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3558	NC_021030	GCG	2	6	555111	555116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_021030	ATTT	2	8	555149	555156	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_021030	CTT	2	6	555210	555215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_021030	ACG	2	6	555239	555244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_021030	TCC	2	6	555249	555254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3563	NC_021030	CCG	3	9	555255	555263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3564	NC_021030	CG	4	8	555266	555273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3565	NC_021030	GCC	2	6	555284	555289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3566	NC_021030	CGA	2	6	555326	555331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_021030	GCG	2	6	557945	557950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_021030	A	6	6	563705	563710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_021030	A	7	7	563748	563754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_021030	TTG	2	6	567684	567689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_021030	ATT	2	6	567759	567764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_021030	CCG	2	6	568223	568228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3573	NC_021030	GAC	2	6	568242	568247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_021030	GGC	2	6	568281	568286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_021030	CATC	2	8	568296	568303	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3576	NC_021030	GAC	2	6	568341	568346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_021030	TTGT	2	8	569014	569021	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_021030	GCC	2	6	569050	569055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3579	NC_021030	CAT	2	6	569061	569066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_021030	CGC	2	6	569182	569187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3581	NC_021030	GAG	2	6	569224	569229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_021030	GAC	2	6	569263	569268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_021030	GGCT	2	8	569291	569298	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3584	NC_021030	CG	3	6	569303	569308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3585	NC_021030	GCC	3	9	569345	569353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3586	NC_021030	CTA	2	6	569382	569387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3587	NC_021030	TC	3	6	569457	569462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3588	NC_021030	GAAT	2	8	569519	569526	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_021030	CGC	2	6	569529	569534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3590	NC_021030	GCA	2	6	569642	569647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_021030	CTT	2	6	569655	569660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_021030	GGA	2	6	569693	569698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_021030	GTA	2	6	569733	569738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_021030	TAG	2	6	569848	569853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_021030	GC	3	6	569989	569994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3596	NC_021030	CGA	2	6	570104	570109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_021030	GCG	2	6	570135	570140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_021030	GTT	2	6	570168	570173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_021030	GGA	2	6	570185	570190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_021030	GCC	2	6	570194	570199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3601	NC_021030	TGT	2	6	570221	570226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_021030	AGG	3	9	570281	570289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_021030	GTT	2	6	570330	570335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_021030	TCA	3	9	570365	570373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_021030	CGC	2	6	570374	570379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3606	NC_021030	CGT	2	6	570555	570560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_021030	GCA	2	6	570575	570580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_021030	A	6	6	570580	570585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_021030	TTG	2	6	570646	570651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_021030	GCG	2	6	570652	570657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_021030	GAAAA	2	10	570668	570677	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_021030	GGCG	2	8	570728	570735	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3613	NC_021030	GAC	2	6	570748	570753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_021030	TGTC	2	8	570788	570795	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3615	NC_021030	ACCG	2	8	571658	571665	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3616	NC_021030	CCG	2	6	574627	574632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3617	NC_021030	A	6	6	574675	574680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_021030	A	6	6	574690	574695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_021030	AAT	2	6	574717	574722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_021030	TTC	2	6	574732	574737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_021030	A	7	7	574754	574760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_021030	GGTTTC	2	12	574785	574796	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3623	NC_021030	TAT	2	6	574824	574829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_021030	N	764	764	574884	575647	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_021030	AAT	2	6	575672	575677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_021030	TCT	2	6	575709	575714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_021030	AAT	2	6	575746	575751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_021030	T	7	7	575798	575804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_021030	CATTT	2	10	575994	576003	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3630	NC_021030	A	6	6	576005	576010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_021030	GAT	2	6	576011	576016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_021030	CTGAT	2	10	576037	576046	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3633	NC_021030	TTC	2	6	576287	576292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3634	NC_021030	CATCC	2	10	576394	576403	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
3635	NC_021030	TGC	2	6	576517	576522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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