MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Acinetobacter baumannii MDR-TJ plasmid pABTJ2

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020524	ATTA	2	8	1780	1787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020524	TTAT	2	8	4520	4527	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020524	AGTA	2	8	14163	14170	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020524	AATA	2	8	14711	14718	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020524	ACTT	2	8	16790	16797	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_020524	ATCA	2	8	21955	21962	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_020524	TAAA	2	8	23899	23906	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020524	GAAA	2	8	26037	26044	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020524	CTTT	2	8	26061	26068	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020524	CTTA	2	8	30632	30639	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020524	TAAT	2	8	35016	35023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020524	ACTA	2	8	36125	36132	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_020524	ACTT	2	8	42386	42393	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_020524	TAAT	2	8	42408	42415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020524	CTAT	2	8	42508	42515	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_020524	GTAA	2	8	42518	42525	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020524	TTAT	2	8	42953	42960	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020524	ACCA	2	8	44657	44664	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_020524	ATTG	2	8	44843	44850	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020524	TTAT	2	8	45657	45664	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020524	TACA	2	8	46731	46738	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_020524	CTTA	2	8	47837	47844	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_020524	TAGA	2	8	47881	47888	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020524	TAAT	2	8	49591	49598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020524	TAAT	2	8	50232	50239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020524	CTTC	2	8	51805	51812	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020524	GAAA	2	8	51833	51840	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020524	GCTA	2	8	51942	51949	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_020524	TAGA	2	8	54266	54273	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020524	ATTC	2	8	54297	54304	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_020524	TTTA	2	8	54306	54313	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020524	AATA	2	8	54357	54364	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020524	AGAT	2	8	56068	56075	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020524	CATG	2	8	56111	56118	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_020524	TCAT	2	8	56119	56126	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_020524	CATG	2	8	56133	56140	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_020524	ATTC	2	8	59537	59544	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_020524	TTGC	2	8	62036	62043	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_020524	TATC	2	8	62111	62118	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_020524	GTAG	2	8	62218	62225	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020524	TCTA	2	8	62598	62605	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_020524	TTAA	2	8	64200	64207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020524	CTAT	2	8	64222	64229	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_020524	TAGA	3	12	65935	65946	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020524	ATCT	2	8	65970	65977	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_020524	GATA	2	8	66070	66077	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020524	TAGA	2	8	66112	66119	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020524	TAGA	2	8	66170	66177	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020524	TCAA	2	8	66278	66285	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020524	ATCT	2	8	66530	66537	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_020524	TTAT	2	8	66848	66855	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020524	TAAA	2	8	67553	67560	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020524	ATGC	2	8	68221	68228	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_020524	CGCA	2	8	68265	68272	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020524	TTTA	2	8	68287	68294	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020524	TCAA	2	8	68355	68362	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_020524	TAAG	2	8	72751	72758	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020524	TTGA	2	8	75803	75810	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020524	TTAG	2	8	83759	83766	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020524	ATTG	2	8	83826	83833	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020524	CTTA	2	8	94125	94132	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_020524	TTAT	2	8	109438	109445	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020524	TGTT	2	8	110608	110615	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.